利用基因芯片对一高保守基因进行肿瘤相关分析

本文对大规模人类cDNA 测序过程中获得的一条高保守基因进行了初步功能研究,生物信息学研究发现该基因在人类、小鼠、果蝇、拟南芥和裂殖酵母中都有很高的保守性,其他分析预测该基因可能具有肿瘤相关性。RT-PCR分析表明,该基因在成人和胎儿组织中广谱表达。利用基因芯片分析该基因在7例肝癌、5例胰腺癌、2例喉癌和2例肺癌中表达情况,结果证实了该基因的肿瘤相关性,并且提示该基因在不同肿瘤类型中可能处于不同的地位。 Abstract:Preliminary function research of a highly conserved human gene,which was cloned from human fetal cDNA library during large-scale cDNA sequencing,is illustrated in this article.Bioinformatics analysis indicates that this gene is highly conserved in human、mouse、fruit fly、thaliana and fission yeast.Other bioinformatics analysis implies its relevance with tumors.RT-PCR analysis shows its wide-ranging expression patterns.Its expression in 16 cancer cases(including 7 liver cancer cases、5 pancreas cancer cases、2 larynx cancer cases and 2 lung cancer cases) is studied by using gene microarray analysis.The result shows its relevance with tumors and implies it may have different status in different classification of tumors.     

利用基因芯片对一高保守基因进行肿瘤相关分析

本对大规模人类cDNA测序过程中获得的一条高保守基因进行了初步功能研究,生物信息学研究发现该基因在人类、小鼠、果蝇、拟南芥和裂殖酶母中都有很高的保守性,其他分析预测该基因可能具有肿瘤相关性。RT－PCR分析表明,该基因在成人和胎儿组织中广泛谱表达。利用基因芯片分析该基因在7例肝癌、5例胰腺癌、2例喉癌和2例肺癌中表达情况,结果证实了该基因的肿瘤相关性,并且提示该基因在不同类型中可能处于不同的地位。     

中国原螳属一新种记述（螳螂目：花螳科）

记述采自云南西部螳螂目昆虫1新种,即斑原螳Anaxarcha maculata,sp.mov.。模式标本保存于大理师范高等专科学校生物系。     

重组人胰高血糖素样肽-1的表达、纯化及其生物学活性

为获得重组人胰高血糖素样肽 1[recombinanthumanglucagon likepeptide 1(7～ 37) ,rhGLP 1]并研究其生物学活性 ,采用亚磷酸二酯法合成hGLP 1cDNA的 6个寡核苷酸片段 ,拼接成完整的hGLP 1cDNA ,构建重组质粒pGEX hGLP 1,转化大肠杆菌BL2 1(DE3)获得表达菌株 .高密度发酵培养的菌体超声破碎后 ,裂解液用Glutathione Sepharose 4B亲和层析纯化得到GST融合蛋白 .经CNBr裂解、QAE SepharoseFF柱层析和脱盐 ,得到纯度大于 90 %的rhGLP 1,质谱测定分子量结果与理论值一致 .生物学活性分析表明 ,rhGLP 1具有明显的降血糖活性 .     

小鼠IL-6基因的克隆及表达载体的构建

采用常规的分子生物学技术,从小鼠骨髓细胞中克隆了含信号肽序列的IL-6,并构建了表达载体,序列分析表明所克隆的IL-6序列与文献报道的一致,构建的表达载体经鉴定正确。     

利用IgA蛋白酶β结构域为骨架构建细菌表面展示随机肽库

以IgA蛋白酶β结构域为骨架构建细菌表面展示随机肽库。设计合成两条寡核苷酸双链,链1含有一个随机编码序列(NNK)10,其3'端可与链2互补。通过两条链的退火、延伸、酶切、回收后与酶切、去磷酸化的载体以最佳连接比连接,采用酚∶氯仿抽提去除残留的连接酶,分批进行电转化,获得一库容量为5×106的随机肽库。随机挑选10个克隆进行测序,结果显示所构建肽库的基本框架与预期设计相符,四个寡核苷酸出现的频率也与理论值相接近,表明所构建的随机肽库是成功的。     

重组人可溶性PDGFRβ/Fc在昆虫细胞Sf9中的表达

【目的】利用昆虫细胞Bac-to-Bac杆状病毒表达系统表达血小板源性生长因子受体β (PDGFRβ)链膜外区与人IgG Fc片段的可溶性受体融合蛋白sPDGFRβ/Fc,并检测重组蛋白的特异性和生物活性。【方法】采用Bac-to-Bac系统,构建重组转移质粒pFastbac-sPDGFRβ/Fc,转化到含穿梭载体Bacmid的感受态细胞DH10Bac中,使目的基因与杆状病毒基因组DNA发生位点特异性重组,获得重组病毒DNA,将其通过脂质体转染昆虫细胞Sf9获得重组病毒。将该重组病毒感染Sf9无血清细胞系,在Sf9细胞中表达sPDGFRβ/Fc,对表达产物进行Western blotting检测和Protein A亲合层析纯化,并进一步通过MTT法检测获得的重组蛋白生物学活性。【结果】重组病毒感染Sf9细胞后,经Western blotting分析,能检测到一条分子量约为97 kDa的特异性条带,与目的蛋白大小相符。通过Protein A亲和层析,获得了纯度达75％以上,表达量为1 μg/mL细胞培养上清的重组融合蛋白,MTT结果显示该重组融合蛋白sPDGFRβ/Fc具有抑制PDGF刺激的Balb/c 3T3细胞增殖的能力。【结论】具有生物活性的重组可溶性受体融合蛋白sPDGFRβ/Fc可在昆虫细胞中成功地得到表达。     

伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用

伤寒沙门菌是一种具有鞭毛的革兰阴性人类肠道致病菌,也是一种重要的原核生物研究用模式菌．基因组芯片能够系统、全面且高效地观察生物的基因表达及进行基因组结构比较．利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取CT18菌株和z66阳性菌株的特异性蛋白编码基因,设计特异性引物,经PCR有效扩增出4 201个基因,产物纯化后点样于多聚赖氨酸玻片制备伤寒沙门菌基因组DNA芯片,并验证了芯片样点位次与效果．通过对基因表达谱分析的各种条件进行优化,建立相应的表达谱分析方法,并用于比较伤寒沙门菌野生株在高渗、低渗条件下的基因表达差异,结果与以前的报道基本一致．结果表明,成功建立了伤寒沙门菌基因组DNA芯片及表达谱分析方法,可为有关伤寒沙门菌基因表达调控及致病性机理、进化和基因多样性等方面的深入研究提供有效的技术支持．     

长江口纹缟虾虎鱼胚胎发育及早期仔鱼生长与盐度的关系

研究了长江口纹缟虾虎鱼(Tridentiger trigonocephalus)胚胎发育及早期仔鱼生长与盐度的相关性。纹缟虾虎鱼胚胎发育时,盐度4与6试验组效果较好,受精率分别达(76.28±2.73)%与(74.63±5.49)%,孵化率分别达(66.95±2.99)%与(62.15±2.18)%,出膜时间分别为(228.8±5.9)h与(221.5±5.2)h,器官发育特征较明显,畸形率较低。纹缟虾虎鱼仔鱼发育时,初孵仔鱼全长(2.534±0.078)mm,卵黄囊长径(0.421±0.047)mm,短径(0.369±0.038)mm,5日龄时卵黄囊基本消失,初步形成消化器官、循环器官和运动器官等。盐度8与10水体孵育的仔鱼畸形率达5―20%,其他试验组略低。盐度4与6试验组仔鱼的器官发育速度快于其他3个试验组。盐度0―6试验组纹缟虾虎鱼仔鱼生存活力指数（SAI）为41.83―46.83,仔鱼活力较好,而盐度8―10试验组SAI值为23.43―29.13,活力较差。综合各项指标表明,在盐度0―10范围内,长江口纹缟虾虎鱼胚胎发育的适宜盐度为4―6,早期仔鱼生长的适宜盐度为2―4。     

冬季上海市城区河道中原生动物群落的结构特征

于2007年11月至2008年1月,对上海市城区经过初步修复的四条河道(午潮港、横港、朝阳河和曹杨环浜)中原生动物的群落结构和多样性进行了调查.共鉴定出原生动物88种,其中鞭毛虫31种,肉足虫13种,纤毛虫44种.除曹杨环浜无优势种外,其他三条河道的种类均以耐污种类为优势种,如波豆虫 Bodo sp.、滴虫 Monas sp.、隐藻 Cryptomonas sp.等;四条河道均呈现纤毛虫和鞭毛虫种类较为丰富,肉足虫相对较少的现象.四条河道中原生动物多样性指数的平均值变动在1.14～2.87之间;密度变动在900.35～2837.89 ind/ml间.分析发现,前期生态治理较为成功的曹杨环浜具有多样性指数高、密度大、无明显优势种等特征,而其他三条河道中原生动物种类相对较单一,且分布不均匀,主要优势种为一些耐污种类.提示经过人工合理的修复,可以有效改善受污染河道的状况.因此对已经初步修复河道的生态系统进行评估,探索和制定出有针对性的修复方案,并对其加以合理的维护,对建立健康、稳态的河道生态系统是十分必要的.