嗜热脂肪芽孢杆菌中转座因子IS5376的转座行为研究

ＩＳ５３７６和ＩＳ５３７７是在嗜热脂肪芽孢杆菌（Ｂａｃｉｌｕｓｓｔｅａｒｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）中发现的两个转座因子。随机取样分析的结果说明,ＩＳ５３７６由ＣＵ２１染色体向质粒ｐＦＤＣ５和ｐＦＤＣ１２的转座受温度的影响,而ＩＳ５３７７则不。温度影响的原因还不清楚,从现有证据看来,这由ＩＳ５３７６本身的性质所决定。另外,测得ＩＳ５３７６的转座作用有一定程度的专一性,还测得转座后所造成的目标序列的顺向重复为４或５ｂｐ。     

耐热性碱性磷酸酯酶作为非放射性标记物的研究

通过生物素与亲和素－酶复合物系统或地高辛与抗地高辛－酶复合物系统可把酶间接标记到探针上．Ｒｅｎｚ等通过不同的化学方法直接把酶标记到探针上［１～３］．耐热性碱性磷酸酯酶ＦＤ－ＴＡＰ（ｔｈｅｒｍｏｓｔａｂｌｅａｌｋａｌｉｎｅｐｈｏｓｐｈａｔａｓｅ）具有耐...     

recA基因通过同源重组途径参与由整合质粒发动的大肠杆菌染色体复制

我们在前文中报道由整合的F'质粒所发动的大肠杆菌染色体的复制依赖于recA基因。本文报道有关recA、recB、recC以及lexA等在染色体复制中的作用,实验结果说明,recA基因通过同源重组途径而不是通过SOS途径参与复制,而且recA基因和Chi热点无关。实验结果还说明,RecBC酶的依赖于ATP的双链DNA外切核酸酶活性和recA基因的作用无关。     

大肠杆菌的一株抗苯乙醇的dnaB突变型

通过硫酸二乙酯诱变,选得一株抗苯乙醇的DNA复制突变型FD105。从温度和氨基酸饥饿对DNA残余合成的影响,以及在限制温度中噬菌体增殖情况可以看到,FD105是DNA复制链延长突变型。我们证实了温度敏感和苯乙醇抗性是同一基因突变的结果。这一基因被定位在dnaB座位。已有的研究表明苯乙醇的作用部位是细胞膜,链延长dnaB突变型同时抗苯乙醇,这是链延长与膜有关的一个旁证。     

应用寡核苷酸芯片并行检测CYP1A和GSTM1基因多态性

利用寡核苷酸芯片检测方法分析CYP1A单核苷酸多态性(SNP)和GSTM1缺失与否,实验结果证明了寡核苷酸芯片技术可并行、准确、高效地检测基因的单核苷酸多态性和其他类型的基因多态型,可为疾病遗传易感性及单体型的研究提供强有力的研究工具。采用该寡核苷酸芯片,检测了84份正常人的血液DNA样本,其中GSTMl基因缺失率达到47．6％,接近报道数值。统计分析发现,CYP1A m1-m2的3种基因型组合TT-AG、TT-GG和TC-GG的发生频率都为0,而根据实验得到的m1和m2各自基因型数据计算,它们的发生频率应是11．4％、2．6％和3．1％,所以推测在所检测的样本中没有T(m1位点)和G(m2位点)的连锁组合,即m1和m2位点的组合只有3种单体型：T-A、C-A和C-G,其发生频率分别是69．6％、7．7％和22．6％。     

应用寡核苷酸芯片并行检测CYP1A1和 GSTM1基因多态性

利用寡核苷酸芯片检测方法分析CYP1A1单核苷酸多态性 (SNP)和GSTM1缺失与否 ,实验结果证明了寡核苷酸芯片技术可并行、准确、高效地检测基因的单核苷酸多态性和其他类型的基因多态型 ,可为疾病遗传易感性及单体型的研究提供强有力的研究工具。采用该寡核苷酸芯片 ,检测了 84份正常人的血液DNA样本 ,其中GSTM1基因缺失率达到 4 7 6 % ,接近报道数值。统计分析发现 ,CYP1A1m1 m2的 3种基因型组合TT AG、TT GG和TC GG的发生频率都为 0 ,而根据实验得到的m1和m2各自基因型数据计算 ,它们的发生频率应是11 4 %、2 6 %和 3 1% ,所以推测在所检测的样本中没有T(m1位点 )和G(m2位点 )的连锁组合 ,即m1和m2位点的组合只有 3种单体型 :T A、C A和C G ,其发生频率分别是 6 9 6 %、7 7%和 2 2 6 %。     

烟豆小种群的RAPD研究

本研究应用RAPD技术对湄洲岛和平潭岛上4个烟豆小种群进行的生态遗传学研究,结果显示,总的多态位点比率为1.0,4个种群中最小为0.41,最大为0.82,表现出高度的多态性。利用相似系数及遗传距离进行的聚类分析结果表明,在种群间地理距离较大时,遗传分化与地理距离有一定的相关性,在小范围内则无明显相关性。 Abstract:The ecological genetic research on Glycine tabacina populations was based on RAPD technique,which revealed 100% polymorphisms,with minimum value of 0.41 in population MM,and maximum value of 0.82 in population PT.Cluster analysis showed that the populations' genetic variation was correlation to the environment gradient when the geographic distance among populations was big.In small geographic range,however,no correlation exists between genetic structure and ecological factors because of random genetic drift.     

表达谱基因芯片的可靠性验证分析

cDNA芯片是一项新兴的能评估检测全范围mRNA表达水平变化的技术。通过同种组织RNA自身比较实验及不同组织RNA的差异分析实验对cDNA芯片实验的重复性进行检验,利用相关系数(correlation coefficient,R)、变异系数(coefficient of variation,CV)和假阳性率(false positiver ate,FPR)分析eDNA芯片数据的可靠程度,对cDNA芯片实验数据作了整体的评估。结果证实,该芯片系统得到的cDNA表达谱数据相关系数一般大于0．9,平均变异系数15％左右,假阳性率控制在3％以内。还提出一致率(consistence rate,CR)的概念,作为衡量cDNA芯片系统重复性的新参数,同时阐述了该参数优于目前常用的相关系数及变异系数的特点。另外,通过比较芯片制备中点样浓度、mRNA和总RNA以及不同批次芯片和不同标记过程对实验的影响,来分析芯片数据的系统误差来源。并提出重复两次实验,可以克服绝大部分实验系统引入的假阳性。