“判别分析”在修正奥陶-志留系腕足动物劣扭月贝属(Katastrophomena)中的应用北大核心

腕足动物系统古生物研究中,对特征相近的两个分子的比较通常定性且直观,较少进行定量统计分析。判别分析是一种重要的分类分析方法,也是动植物分类的主要统计学基础。劣扭月贝属(Katastrophomena)与扭月贝属(Strophomena)虽分别归于扭月贝科的两个亚科,但它们的特征却很相似,对它们的属征差异各家观点不一致。经过对国内外文献中归于Katastrophomena与Strophomena两属共计31种(其中3个亚种,3个未定种)52个标本(其中7个正型,23个副型,6个亚型,4个选型)进行统计学上的判别分析,建立判别方程并证明其有效性,将两属定量地区分开来,较为科学地明确了它们的属征差异,确证了Katastrophomena属的分类地位。对K.(Costistrophomena)与K.(Katastrophomena)两个亚属的壳线频率进行统计分析,认为两者不存在本质差异,建议将它们合并。     

古生物学研究中的采样问题及多样性估计方法——以华夏正形贝动物群为例

传统的古生物学采样方法通常很少对同一化石层面展开进行,由此得到的多样性信息往往难以反映化石组合的真实情况。通过观察稀疏化曲线平缓程度来判断化石采样是否充分的经验方法并不严谨。本文在介绍古生物化石采样方法的基础上,提出采样是否充分的本质是采样获得的多样性与所属化石群落潜在多样性之间的接近程度。借鉴现代生物学中的多样性估计方法,以华夏正形贝腕足动物群为例,本研究采用EstimateS软件,定量估计4个化石点的潜在多样性;探讨客观判断采样充分的方法,同时通过曲线拟合法预测达到特定多样性可能需要的样本数量,为二次研究提供重要信息。该多样性估计方法是古生物研究中一个较新的领域,在多样性对比及特定化石群的多样性评估中均有较好应用前景。为得到更全面的多样性信息,文章建议相关研究在使用稀疏化的同时辅以多样性估计方法。     

表型单元、形态种和生物种——关于化石种判别问题的探讨

目前在我国古生物学研究中存在着许多有关物种判别的问题。在相当程度上这是与居群概念的贫乏和传统的林奈式类型-形态学研究方法的影响分不开的。广泛存在于物种间的形态间断为识别物种带来了方便,但它与生殖隔离并不完全吻合。若只考虑形态特征,所判定的化石种大多只相当于表型单元。本文探讨如何将形态标准与居群、群落-生态和时空等项标准相结合来区分物种与表型单元。以上这些标准分别反映了物种的生物学特性的不同方面,而生殖一遗传标准是将它们有机地联系在一起的共同基础。古生物学必须站在理性的高度上俯瞰生命发展过程中的物种,从现代生物学的知识库中汲取养料。化石种研究现状的改观尚有待于我们付出艰巨的努力。通过这种努力将使古生物学进入一个新的、更严格的科学发展阶段。     

滇东曲靖上志留统妙高组腕足化石群

一前言滇东志留系的妙高组,曾名Spirifer tingi和Spirifer bourgeoisi 层(Grabau,1930),或马龙群上部(孙云铸、王鸿祯,1946),分布在曲靖、马龙一带。妙高组的命名地在曲靖城西南数公里妙高山的南坡(丁文江、王日伦,1937),岩层出露甚佳,顺序清晰,与上覆玉龙寺组、下     

定量古生物学软件PAST及其常用功能北大核心CSCD

近半个世纪以来,古生物学涉及越来越复杂的现象与过程,难以用传统的经验科学方法来解决。伴随着相关研究引入日益增多的定量分析,古生物学逐渐成为一门可定量分析的科学。作为最早的古生物学专用的免费统计软件包,PAST功能全面、易于使用,并在过去十几年中发展迅速,目前已在相关软件中占据重要地位。本文在简单介绍该软件基本操作方法的基础上,结合古生物学应用案例,解读最常用到的几类"常规统计分析"与"多元统计分析"的使用;同时,针对古生物学相关领域中的"多样性、丰度及居群结构","形态学"和"生物地层学"问题,给出具体分析实例。在相关案例的分析介绍中,详细梳理用PAST实现这些分析的具体步骤,因而具有较好的实用参考价值。受篇幅所限,文章对软件中其他不常用但相对重要的9个模块只进行简要介绍,以供读者在偶尔涉及该类分析时参考。PAST软件不仅功能强大,而且能够针对古生物学及地层学浮现出来的最新前沿问题不断进行调整、更新,值得在古生物学界推广使用。     

基因敲除动物的研究和应用

目的基因敲除动物是近十几年来发展起来的在个体水平上研究基因功能的一类实验动物,它以基因敲除技术和胚胎干细胞技术为基础,在生命科学研究的各个领域得到了广泛应用。最近两年发展起来的RNA干扰技术仍然不能代替它。本文综述了基因敲除动物在各医学生物领域的研究与应用、浅谈其与RNA干扰技术的比较及其发展前景。     

华南上扬子区下奥陶统红花园组顶界的穿时性

在早奥陶世弗洛早期,广布于华南扬子台地的浅海碳酸盐台地沉积(红花园组)逐渐被陆源碎屑沉积所替代,而海洋生物分异度快速升高,随后出现了奥陶纪生物大辐射的第一次高潮。因此下奥陶统红花园组顶界附近的岩石地层学和年代地层学研究具有重要意义。目前该组顶界的穿时性及其横向分布规律尚无定论。通过对贵州桐梓红花园、习水吼滩、湖北兴山古洞口和湖南张家界温塘4个剖面红花园组牙形石动物群的系统分析,从下至上识别出了3个牙形石带,分别是Serratognathus diversus带、Prioniodus honghuayuanensis-Oepikodus communis带和Oepikodus evae带。采用统一的红花园组顶界定义,即以中—厚层亮晶颗粒灰岩的消失作为红花园组与上覆地层之间的界线,结合研究剖面和前人牙形石生物地层学资料,发现上扬子区红花园组顶界具有明显的穿时性,而且这种穿时性在空间上还具有一定的规律性。上扬子区红花园组顶界大部分位于P.honghuayuanensis-O.communis带内;从上扬子区中部向台地南北两侧的边缘区,红花园组顶界大体上逐渐升高至O.evae带;而在靠近陆源碎屑沉积的西部地区顶界则降低至S.diversus带。造成这一现象的主要控制因素除了海平面的升高外,可能还与陆源碎屑供应的增多有关。     

小鼠类胚胎干细胞分离培养及用于制作嵌合体小鼠的实验研究

目的探讨分离小鼠囊胚内细胞群类胚胎干细胞及用于制作嵌合体小鼠的方法及应用价值。方法分离3.5d小鼠囊胚内细胞群的类胚胎干细胞作为供体细胞,通过显微注射方法将分离的类胚胎干细胞注射到供体小鼠的囊胚腔中,再将注射后的囊胚移植到假孕雌鼠的子宫中制作嵌合体小鼠。结果分离36枚囊胚的内细胞群类胚胎干细胞,注射256只昆明小鼠囊胚中,移植32只假孕雌鼠子宫中,获产崽2窝,共12只,其中2只获毛色嵌合体小鼠。结论采用该技术分离所获得的类胚胎干细胞作为供体细胞制作嵌合体小鼠获得成功,该方法为ES细胞介导的转基因动物制作增添了一条新的途径,在同种不同品系的动物改良及遗传病基因治疗中有一定的应用价值,尤其是对未能建立ES细胞系的大动物的遗传工程操作具有一定意义。     

内蒙古西部额济纳旗晚奥陶世生物地理和奥陶-志留系分界

通过最近对内蒙古额济纳旗东南珠斯楞海尔罕一带(阿拉善地块)奥陶—志留系界线地层和生物群的野外调查和室内研究,首次在上奥陶统上部巴丹吉林组中发现阿什极尔中期(mid Ashgill)腕足动物化石巨大全嘴贝(Holorhymchus giganteus Kiaer),这是该属在我国奥陶系中的首次记录。根据未成年个体的切片所发现的腹壳顶端发育中隔板构造,修订该属定义,并证明研究小个体对识别物种特征、探讨个体发育和系统演化有重要意义。分析了全嘴贝属的群落生态、生物地理和演化意义后,发现它在奥陶纪末大灭绝过程中,因居群规模和分布范围极大地缩减,至今未发现其化石记录;但在志留纪初环境好转后继续存活,可暂视其为复活属。根据在拐子湖组近底部发现志留系最下部Akidograptus ascensus带的重要分子Normalograptus lubricus Chen et Lin,确定本区的奥陶—志留系分界。阿拉善地块因不发育Hirnantia动物群,表明奥陶纪末期它与扬子区、西藏、滇西等富含该动物群的地区属于不同的生物地理区系;在阿什极尔中期可能位于热带海域,与祁连山、中亚、乌拉尔等地有重要联系。文中描记H．giganteus种,评述正常笔石类(normalograptid)的系统分类位置并描记N．lubricus种。