基于k-mer组分信息的系统发生树构建方法

随着越来越多基因组的测序完成,基于全基因组的非比对的系统发生分析已成为研究热点。不同的生物物种或个体基因组之间的核酸组分不完全相同。遗传语言-DNA序列的信息很大程度上反映在其k—mer频数中。基于基因组序列k-mer频数的系统发生树则从新的角度为我们提供物种之间的亲缘关系。本文定义基于k-mer,频数的信息参数,并用它表征基因组序列,计算不同基因组之间信息参数的距离,用邻接法对84个病毒构建了系统发生树,发现构建的系统发生树很大程度上与已有的系统发生树相吻合。     

四川省赫坎按蚊种团各蚊种卵形态鉴别的可靠性研究

本文论证用蚊卵形态鉴别四川省赫坎按蚊种团各蚊种的可靠性。中华按蚊同嗜人按蚊、筠连接蚊、八代按蚊、贵阳按蚊,凉山按蚊同嗜人按蚊等,用卵形态鉴别比较可靠;其余各蚊种之间卵形态鉴别不完全可靠,必须结合蚊虫生活史中其他阶段的形态进行鉴别;卵甲板定同卵宽、甲板定同浮囊内缘间距离、浮囊内缘至甲板边缘距离同甲板宽等的比值,以及甲板的形状等卵外部形态,在赫坎按蚊种团各蚊种之间的鉴别上占有比较重要的地位。     

k-长DNA子序列频数分布研究

在详细阐述了生成DNA序列分形图像的Hao方法后,提出一种能够直观显示k-长DNA子序列频数分布差异性的三维频数分布图生成方法。把3D频数分布图转化为1D对数频谱图,突出显示了频数分布的局部特征,提出k-长DNA子序列频数区划分准则,并详细研究了甚高频数区的n阶零间隔现象,指出n阶零间隔分布就是基因组进化过程所留痕迹的假设,并给出对数频谱图特征的生物学解释。实验发现许多DNA序列频数概率分布近似服从非中心F分布,对于分布呈多峰现象的基因组序列,可采用多个非中心F分布的叠加来拟合。在比较非中心F分布与Gamma分布后,提出一种结合二者在拟合方面具有互补优势的新分布,实验证明这种新分布能够更好地吻合实际DNA序列的频数分布。最后研究了两种特异出现频数(最高出现频数与出现频数为1的k-长子序列个数)与k值的关系,发现不同物种的这两种关系具有良好的一致性。     

黄山地区居民地方特色食品摄入量及其与血压关系探讨

目的：了解黄山地区地方特色食品及特色茶的摄入情况,探讨地方特色食品摄入对高血压患病率的影响,为改善当地居民的营养搭配及健康状况提供科学依据。方法：利用方便抽样的方法,选取黄山市境内三区四县518户常住居民,每户选取1名40岁以上的家庭成员作为调查对象。问卷调查研究对象的人口学资料、疾病史等,并规范测量身高、体重、血压、腰围。采用食物频率问卷法记录调查对象1年的特色食品摄入频率和摄入量,再折算成标准人日摄入量。结果：黄山地区居民食用频率较高的地方特色食品是香菇、新鲜竹笋、火腿、咸肉、茶干、小烧饼、石头馃,每月3次及以上分别占46.1%、39.6%、44.8%、47.0%、39.6%、45.0%、38.4%,而毛豆腐和臭鳜鱼的食用频率并不高。结论：黄山地区居民食用的地方特色食品是香菇、新鲜竹笋、火腿、咸肉、茶干、小烧饼、石头馃,地方特色食品的摄入及饮茶与高血压可能无关。     

基于壳长频率分析的洪泽湖河蚬渔获物年龄结构、生长与死亡参数估计

{{@ convertAbstractHtml(article.abstractinfoCn, "cn")}}       

人类外周血淋巴细胞中“自发”和诱发的SCE频数分布的比较

“自发”SCE频数在细胞间的分布,服从Poisson分布;而以CSC诱发的SCE频数则服从正态颁。分布类型的改变,可能是由于平均数的增加所致。平均数的增加,以A组和C组染色体为甚。     

基于添加模体信息和功率谱密度的组合向量预测27类蛋白质折叠子

以序列相似性低于40%的1895条蛋白质序列构建涵盖27个折叠类型的蛋白质折叠子数据库,从蛋白质序列出发,用模体频数值、低频功率谱密度值、氨基酸组分、预测的二级结构信息和自相关函数值构成组合向量表示蛋白质序列信息,采用支持向量机算法,基于整体分类策略,对27类蛋白质折叠子的折叠类型进行预测,独立检验的预测精度达到了66.67%。同时,以同样的特征参数和算法对27类折叠子的4个结构类型进行了预测,独立检验的预测精度达到了89.24%。将同样的方法用于前人使用过的27类折叠子数据库,得到了好于前人的预测结果。     

枯草杆菌基因组中的回文结构

统计了枯草杆菌全序列中中间间隔S从0到29、侧翼序列长度L从4开始的所有回文结构,以及这些回文结构在编码区和非编码区的分布。通过分析不同S、L的回文结构的频数以及AT含量,发现枯草杆菌基因组中长的回文结构是过表达的、AT含量高并且对非编码区有偏好。     

数理统计法初步分析江汉平原裸藻门植物的分布

裸藻门植物在江汉平原分布的特点是:分布广泛,出现机率高,达96.4％;用方差分析法,检测各采集点浮游生物标本中裸藻门植物种类丰度在平原各地随机分布的差异程度,其结果是无显著的区域性差异;水体中裸藻门植物种类丰度的频数分布近似于一正态曲线,这反映了大多数水体中裸藻类的种类丰度较大;相同频数的种类数与其出现频数的相关性呈明显的幂函数关系,显示了只有少数非常普生的裸藻门种类在区内广泛分布。