大花杓兰的组织培养与快速繁殖

1 植物名称 大花杓兰（Cypripedium macranthum SW．）。 2 材料类别 种子。 3 培养条件 种子萌发与生长培养基：（1）Harvais（Harvais1982）＋6-BA 1．0mg·L^-1（单位下同）;（2）VWD（Van Waes和Debergh 1986）＋6-BA 1．0。原球茎分化培养基：（3）Harvais＋6-BA 0．5;（4）VWD＋6-BA 0．5。     

基于多样性指标的分枝杆菌蛋白质亚细胞定位预测

由于蛋白质亚细胞位置与其一级序列存在很强的相关性,利用多样性增量来描述蛋白质之间氨基酸组分和二肽组分的相似程度,采用修正的马氏判别式（这里称为IDQD方法）对分枝杆菌蛋白质的亚细胞位置进行了预测。利用Jackknife检验对不同序列相似度下的蛋白质数据集进行了预测研究,结果显示,当数据集的序列相似度小于等于70％时,算法的预测精度稳定在75％左右。在对整体852条蛋白质的预测成功率达到87．7％,这一结果优于已有算法的预测精度,说明IDQD是一种有效的分枝杆菌蛋白质亚细胞预测方法。     

利用支持向量机和马氏判别式预测人类polⅡ启动子

通过选取人类启动子与非启动子序列中不同的k-mer作为预测算法的基础特征,分别以三个区域（-249～-1;0～＋50;-30～＋30）的6-mer频数作为离散源参数构建离散增量,同时选取24个位点（-31～-21;-4-＋2;＋25-＋29）的3-mer频数作为位置打分函数的参数,分别利用支持向量机和马氏判别式为判别函数对启动子进行预测。用10折叠交叉检验来衡量两种算法的预测能力,预测结果成功率分别达到87．0％和87．9％。对于独立检验集,敏感性分别为62．7％和76．0％,特异性分别为77．5％和66.8％。     

理论预测果蝇polⅡ启动子

基于果蝇polⅡ启动予的序列特征,利用结合了离散增量和位置权重矩阵的贝叶斯判别函数对果蝇启动予进行了预测。对预测算法进行10交叉检验。通过比较不同大小训练集对结果的影响,说明了参数选取的合理性和算法的预测能力。同时比较了不同参数的选取对预测结果的影响,从而获得最佳启动子预测结果。预测结果显示成功率达到93％,相互关联系数达到83％。     

基于二次判别的果蝇启动子识别

通过对果蝇polⅡ启动子和非启动子的序列特征分析,计算了序列每个位点单碱基保守性M1(l)值和六联体保守性M6(l)值。从而分别选取两个区域的六联体频数作为离散源参数,利用离散增量结合二次判别函数(IDQD)对启动子进行了预测。对于从编码区和内含子中选取的非启动子数据集,启动子的预测成功率分别达到93%和89%。比较结果显示IDQD模型能够有效地提高启动子预测成功率。     

拟南芥和线虫基因序列及剪切位点的理论预测

将拟南芥(A．thaliana)和线虫(C．elegans)基因组按外显子、内含子及基因间序列区分为3类。分别选取64、40、20种三联体的概率作为信号参数构建离散源,根据离散增量预测序列所属类型。结果表明：拟南芥各条染色体标准集总预测成功率达到82．19％,检验集为87．95％;线虫各条染色体标准集总预测成功率达到79．67％,检验集达到81,93％。另外,将两种基因序列中的外显子分别划分成3类,用外显子剪切位点、翻译起始和结束位点附近的三联体的3个位点作为3条子链,以各条子链的12个参数构建离散源,用离散增量对3种序列类型进行预测,预测成功率都达80％以上。     

右美托咪定联合七氟醚对老年腹腔镜胃肠肿瘤切除术患者应激反应和脑氧代谢的影响

摘要 目的：观察老年腹腔镜胃肠肿瘤切除术患者使用七氟醚联合右美托咪定复合麻醉后,机体应激反应和脑氧代谢的变化情况。方法：将我院2020年1月至2020年12月期间收治的100例老年腹腔镜胃肠肿瘤切除术患者根据随机数字表法分为对照组（n=50,七氟醚麻醉）和研究组（n=50,右美托咪定联合七氟醚麻醉）。观察两组血流动力学、应激反应、脑氧代谢、认知功能和不良反应。结果：两组手术60 min（T1）~手术后30 min（T3）时间点较麻醉诱导前（T0）时间点心率（HR）先下降后升高,平均动脉压（MAP）先升高后下降（P<0.05）。研究组T1~T3时间点HR及MAP低于对照组（P<0.05）。两组术后3 d多巴胺（DA）、肾上腺素（AD）、去甲肾上腺素（NE）水平升高,但研究组低于对照组（P<0.05）。两组术后3 d血氧含量差（DajvO₂）和脑氧摄取率（CERO₂）下降,且研究组低于对照组（P<0.05）。研究组术后6 h、术后1 d、术后3 d简易精神状态检查量表（MMSE）评分高于对照组（P<0.05）。两组不良反应发生率,对比无显著性差异（P>0.05）。结论：七氟醚联合右美托咪定应用于老年腹腔镜胃肠肿瘤切除术患者,可有效减轻机体应激反应,减轻机体认知功能损伤,维持血流动力学稳定和脑氧代谢。     

利用伪氨基酸组分预测分枝杆菌膜蛋白类型

膜蛋白是重要的药物靶位点,对膜蛋白类型的研究有助于药物的成功设计,因此正确预测膜蛋白类型对于药物研发是十分必要的。本文采用由274条分枝杆菌膜蛋白序列组成的一致性小于40%的数据集,以经过优化的伪氨基酸组分为特征,利用支持向量机分类算法预测分枝杆菌膜蛋白类型,在Jackknife检验下,得到85.4%的总体准确率和72.2%的平均准确率。结果说明,该方法可用于分枝杆菌膜蛋白类型的识别,将有助于抗分枝杆菌药物的开发。     

大肠杆菌sigma70启动子预测

统计了大肠杆菌sigma70启动子在不同基因间的分布。计算了683条大肠杆菌sigma70启动子的每个位点六联体的保守性M6(l)值及涨落限,以大于涨落限7.2的21个保守位点的六联体频数作为参数,利用离散增量理论对大肠杆菌全序列进行启动子搜索。结果显示683条启动子序列被全部正确预测且得到126条预测序列,利用启动子在不同基因间的分布和TSS到TIS的距离分布进行二次筛选,推测其中的84条序列是实验未测定的启动子序列。     

枯草杆菌基因组中的回文结构

统计了枯草杆菌全序列中中间间隔S从0到29、侧翼序列长度L从4开始的所有回文结构,以及这些回文结构在编码区和非编码区的分布。通过分析不同S、L的回文结构的频数以及AT含量,发现枯草杆菌基因组中长的回文结构是过表达的、AT含量高并且对非编码区有偏好。