基于ND4基因海南竹叶青蛇物种与亚种分类地位

《中国动物志》与文献记载竹叶青蛇属分类存在矛盾,故本研究探讨了产自海南岛的竹叶青蛇的分类地位。为了研究其分类地位,理清国内外分类系统的矛盾。通过原竹叶青蛇属37个物种91个个体的ND_4基因进行测序,计算遗传距离;以瘤鼻蛇为外群,建立分子发育树。结果显示:所有物种在分子树上明显分为7支;产自海南岛的竹叶青蛇属于两个物种,即白唇竹叶青蛇和福建竹叶青蛇。由此得结论为国际上将原竹叶青蛇属细分为8个属的观点比较合理;支持"福建竹叶青蛇海南亚种"的分类地位。本研究丰富了海南基于分子生物学竹叶青蛇分类研究,完善竹叶青蛇生物信息学理论体系提供理论参考。     

广西竹叶青蛇伤的临床特征探讨

目的探讨广西竹叶青蛇伤后的临床特征,为临床诊治提供较合理依据。方法选择被竹叶青蛇咬伤的急诊患者55例的临床资料并分析临床特征。结果 55例竹叶青蛇伤患者分别按咬伤地点与临床分型比较(χ2=18.03,P0.01),竹叶青蛇属(竹叶青和白唇竹叶青)与临床分型比较(χ2=24.67,P0.01)及咬伤地点与竹叶青蛇属比较(χ2=24.80,P0.01),差异均有统计学意义,咬伤地点与竹叶青蛇属呈中度正相关(rs=0.67);竹叶青蛇咬伤按临床分型比较血液学变化有统计学意义(均P0.01),其中血小板(PLT)、白细胞(WBC)各型比较均有统计学意义(P0.05)。结论竹叶青蛇伤主要在城市花园草丛、田间地头等地点发生,伤后临床分型绝大多数为轻型,少数为重型和危重型;白唇竹叶青蛇伤地点主要在深山老林,伤后临床分型以危重型、重型为主,少数为轻型。咬伤地点与临床分型和蛇种属有很大差异性,可为临床诊治提供参考依据。竹叶青蛇伤致血液功能障碍,甚至出现类DIC;除分型标准外,患者WBC的增高程度可作为严重程度的参考指标。     

绿荫下的猎手——竹叶青蛇

<正>每次我穿梭在低矮树丛中的时候,我都格外留意身边和头上的树枝,因为那里可能潜藏一种美丽又危险的精灵——白唇竹叶青蛇Trimeresurus albolabris。因为我特别钟爱亚洲蝮蛇,所以每次见到它都格外兴奋。白唇竹叶青蛇是广州常见的毒蛇,在广州各个森林公园里都可以看到它的身影。生活在低海拔的丘陵、山地;栖息于杂草灌木丛和竹林中。它的善于缠绕的尾巴,使它非常适应树上生活。白唇竹叶青蛇主要是晚上活动,这次我看见它大白天     

蝮亚科蛇线粒体细胞色素b基因序列分析及其系统发育

对中国产蝮亚科（Crotaline)亚洲蝮属（Gloydius)6种蛇（其中短属蝮取自两个不同地区）[短尾蝮Gloydius brevicaudus (Stejneger).黑眉蝮Gloydius saxatilis(Emelianov),蛇岛蝮Gloydius shedaoensis(Zhao),雪山蝮Gloydius strauchii(Bedriaga),高原蝮Gloydius strauchii monticola monticlal (Werner),乌苏里蝮Gloydius ussurriensis(Emelianov)]与竹叶青属竹叶青蛇Trimeresurus stejnegeri Schmidt共7种蛇8个个体测定了789bp或744bp线粒体细胞色素b基因序列,用MEGA1．02软件分析了其碱基组成及变异情况,以游蛇科链蛇属半棱鳞链蛇Dinodon semicarinatus序列为外群,用PAUP4．0b2软件构建最简约分子系统树,结果显示,竹叶青蛇在全部受试物种中处于原始地位,分布于东北地区的蛇岛蝮,乌苏里蝮,黑眉蝮与浙江与陕西产的短尾蝮所组成的分枝与横断山区的高原蝮,雪山蝮聚集形居的分枝组成姐妹群,支持分布于中国境内的亚洲蝮属蛇种的两个起源及分化地的假说,同时探讨了蝮蛇的分类地位问题。     

关于竹叶青蛇耐饥能力的探索

关于竹叶青蛇耐饥能力的探索江根伙安徽黄山歙县新溪口乡育林村２４５２４１蛇耐饥能力很强,饱食后常可几个月到一年不吃东西。在饲养不断水的情况下,有的蛇数月甚至一二年乃至更长时间不进食物。本人于１９８８年３月从野外采集到一条体格健壮的白唇竹叶青蛇,重１５６...     

基于cytb基因的台湾岛竹叶青蛇扩散的初步分析

为研究竹叶青蛇在中国台湾岛的扩散趋势,从Gen Bank上获取竹叶青蛇部分cytb基因序列,长度约655 bp,通过Seqman对序列进行格式转换、剪切与校正,再用MEGA6.0进行序列比对,统计碱基含量和变异位点。从内类群个体共定义了28个单倍型,其中1个来自福建武夷山,27个来自台湾岛。运用Microsoft Visio 2007软件绘制cytb部分序列统计简约网络图。结合生物地理学信息,发现早期竹叶青蛇基本是由北向南的扩散路线,可以初步推断在中国台湾地区竹叶青蛇大体是由北部(台北)向中南部山区扩散的总体趋势。用分子方法推断物种扩散,为新兴的分子生态学研究方法,可以广泛应用于未来系统发育地理学研究。     

从12S rRNA基因片段序列研究20种蛇的系统发生关系

本文测定了中国产蛇亚目20种蛇约800bp的mtDNA 12S rDNA基因片段序列。所测序列与楔齿蜥的同源序列一起经Clustal X1.8软件比对,共有881个位点,其中变异位点有494个。以楔齿蜥为外群,用NJ法构建了4科20种蛇的进化关系树,对这20种蛇的系统发生关系作了初步探讨。研究结果表明：所研究的4个科20种蛇分成4个支系。第一个支系包括蟒科的东方沙蟒和蟒2种蛇;第二个支系为蝰科3种蛇,即草原蝰、尖吻蝮、竹叶青组成一个单系群;眼镜蛇科的眼镜蛇和银环蛇构成第三个支系;游蛇科的13种蛇构成了第四个支系,其中灰鼠蛇、乌梢蛇和赤链蛇组成一个支系,锦蛇属的7种蛇组成一个单系群,然后它们与前一支系相聚。剩下的颈槽蛇属两种聚类后与赤链华游蛇构成一个支系,并与游蛇科其它蛇组成姐妹群。第四支系首先与第三支系眼镜蛇科聚类,第二支系蝰科构成了三、四支系眼镜蛇科和游蛇科的姐妹群,第一支系蟒科在系统树的最基部,为四个科中较原始的类群。     

基于ITS和trnL-F以及rps4基因片段的 粗疣藓属分类学地位研究

选择粗疣藓属及相关属样本作为内群,油藓属样本作为外群,选取核基因ITS片段以及叶绿体基因trnL-F和rps4片段进行PCR扩增、测序,运用贝叶斯推论(BI)、最大似然法(ML)和最大简约法(MP)构建分子系统发育树,以明确粗疣藓属的分类学地位。结果表明:(1)用于分子系统分析的基因序列共有1 744个位点,其中747个位点属于核基因片段,997个位点属于叶绿体基因片段。(2)3种系统发育树拓扑结构基本一致,都显示粗疣藓属与毛锦藓科成员聚成一支,支持粗疣藓属应隶属于毛锦藓科的观点。(3)小粗疣藓和粗疣藓的种间界限模糊。(4)小鼠尾藓属的3个种与棉藓属成员聚成一支,支持将其归入棉藓科的观点。     

亚洲蝮亚科蛇属间系统发生支序分析 (蛇亚目：蝰科)

在大量比较形态研究的基础上,选择了５个特征方面２８个性状,以支序分析方法探讨了分布于亚洲蝮亚科蛇５属１４种的系统发生关系,结果表明：该亚科蛇类可以划分为３个不同的类群,第一个类群包括尖吻蝮属、瘤鼻蝮属、红口腹属,它们具有较多的祖征,代表了该科中原始一类,基中红口蝮可能是最原始的一属;亚洲蝮属单独形成一个类群;第三个类群为原广义的烙铁头蛇属,包括竹叶青蛇属、原矛蝮属、烙铁头蛇属、黑绿烙铁头蛇属、莽山     

基于不同DNA序列对四数獐牙菜系统位置分析

以扁蕾属植物为外类群,基于trnL-trnF序列、rpl16序列以及 ITS序列,采用最大简约法对四数獐牙菜的系统位置进行了分析.结果显示:尽管在ITS系统发育树、trnL-trnF系统发育树和rpl16系统发育树中所用的种和数量有所不同,所得到的3种系统发育树的拓扑结构也不一致,但四数獐牙菜的系统位置在3种系统发育树中的结果基本一致.在trnL-trnF系统发育树中,四数獐牙菜与花锚属的H.elliptica、H.brevicornis和H.weddelliana形成了一个单系群;而在ITS和rpl16系统发育树中,四数獐牙菜与歧散獐牙菜先聚在一起,再与花锚属的植物聚为一支支持率较高的单系支.研究表明,四数獐牙菜与Anagalidium属的歧散獐牙菜的亲缘关系最近,其次是与花锚属的植物,而与獐牙菜属植物的亲缘关系较远.本实验系统发育的结果支持将四数獐牙菜从獐牙菜属中分出而归入Anagalidium属的观点.     

Geographical variation in the morphology of four snake species from the Lesser Sunda Islands, eastern Indonesia

The morphology of three colubrid snakes, Elaphe subradiata, Psammodynastes pulverulentus, Lycodon aulicus capucinus , and the viper Trimeresurus albolabris , were examined from populations throughout the Lesser Sunda islands using canonical variate analysis. The Lesser Sundas form the western part of two extensive Island chains, the Banda Arcs, that lie between the large islands on the Sunda (Asian) and Sahul (Australian) continental shelves. The snakes of the Lesser Sunda islands show considerable intraspecific variation in morphology. Populations of Trimeresurus albolabris from Wetar and Psammodynastes pulverulentus from Alor show the greatest morphological separation from conspecifics. The most pronounced morphological differentiation in multidimensional space occurs between populations on islands that remained separated throughout the Pleistocene, when sea levels were about 120 m lower than present. Consensus tree evaluation of Mahalanobis distance for populations of these four species and Dendrelaphis pubis on the islands of Lombok, Sumba, Flores, Lembata and Alor, supports the finding that populations from islands that remained isolated throughout the Pleistocene by sea barriers show the greatest morphological divergence.     

The use of amplified fragment length polymorphism in determining species trees at fine taxonomic levels: analysis of a medically important snake, Trimeresurus albolabris

There are a huge number of phylogenetic studies based on mitochondrial DNA (mtDNA); however, these may represent gene trees that may not be congruent with the species tree. A solution to this problem is to include additional, independent, loci from the nuclear genome. At fine taxonomic levels, i.e. between populations and closely related species, previously suggested nuclear markers such as intron sequence data may not be appropriate. In this study we investigate the use of amplified fragment length polymorphisms (AFLP) to aid determination of the species tree for 24 specimens of a medically important snake, Trimeresurus albolabris. This is of particular importance for many venomous snakes as venom often varies intraspecifically. Five different primer combinations produced 434 bands and were analysed by constructing a phylogenetic tree using neighbour joining and principal component analysis. Results were similar across all methods and found distinct groupings. The results were compared with mtDNA data and a reconciled tree was constructed in order to determine the species tree for T. albolabris. We found that T. albolabris (sensu lato) is not monophyletic. Specimens from the Indonesian islands (except West Java) form a distinct clade and we propose elevation to species level. A specimen from Nepal is also distinct and suggests that this population also deserves specific status. We suggest that AFLPs may prove a valuable aid in determining species trees as opposed to gene trees at fine taxonomic levels and this should facilitate the incorporation of molecular data into such activities as antivenom production and conservation management.     

台湾岛和海南岛兰科植物区系特征比较

为探明台湾岛和海南岛兰科( Orchidaceae)植物区系特征,在充分查阅相关资料的基础上,对2个岛屿兰科植物的物种组成、生活型和分布区类型进行分析,并对这2个岛屿与大陆陆地和周边国家兰科植物的分布特征进行比较和分析。结果表明：2个岛屿的兰科植物共有146属639种,其中,台湾岛有107属446种,海南岛有96属302种。2个岛屿树兰亚科( Subfam. Epidendroideae)的属和种比例均最高;原始的拟兰亚科( Subfam. Apostasioideae)在台湾岛无分布,而在海南岛分布有2属4种。从属和种的数量看,含1种和2~5种的属比例较高,分别占台湾岛兰科植物总属数的43.9%和36.4%,占海南岛兰科植物总属数的45.8%和40.6%;且包含种数多的属的比例较低。从生活型看,2个岛屿地生兰和附生兰的比例较高,分别占台湾岛兰科植物总种数的52.7%和34.3%,占海南岛兰科植物总种数的37.1%和55.3%。从分布区类型看,台湾岛和海南岛的兰科植物分别可划分为11和10个分布区类型,且均以热带亚洲至热带大洋洲分布型属和种的比例最高,热带亚洲分布型属和种的比例也较高。从热带成分与温带成分的数量比(R/T)看,台湾岛和海南岛兰科植物属的R/T值分别为3.6和3.3,种的R/T值分别为10.9和11.9,说明2个岛屿的兰科植物均以热带成分为主,台湾岛还包含一定的温带成分。从共有属和共有种看,2个岛屿与大陆陆地的兰科植物共有属均约占各自兰科植物总属数的90.7%,其中,三地共有属有66属;台湾岛与大陆陆地的兰科植物共有种比例较低(46.2%),而海南岛与大陆陆地的兰科植物共有种比例较高(74.9%),说明2个岛屿与大陆陆地兰科植物属的同源性较高,且海南岛兰科植物的大陆性特征更明显。与周边国家相比,2个岛屿与越南的兰科植物共有种比例较高,分别占台湾岛和海南岛兰科植物总种数的33.9%和75.2%。综合分析结果显示：台湾岛和海南岛的兰科植物种类丰富,生活型齐全,且具有明显的热带性质,但台湾岛的兰科植物还表现出一定的温带性质;2个岛屿与大陆陆地兰科植物的亲缘关系较近,但台湾岛兰科植物的特有性更明显。     

海南省兰科植物新记录属——鳔唇兰属

在海南省尖峰岭国家级自然保护区发现分布有兰科Orchidaceae鳔唇兰属Cystorchis Blume,应为海南省的新记录属。海南省是该属在我国已被发现的第二个分布点。根据世界自然保护联盟（IUCN）红色名录的濒危标准,无叶鳔唇兰C. aphylla属于D2级,应实施原地保护。     

Molecular phylogeography of white‐lipped tree viper (Trimeresurus; Viperidae)

The white‐lipped tree viper (Trimeresurus albolabris) is one of the most common venomous snakes with medicine importance in South East Asia. To explore the genetic diversity, population structure and evolutionary history of Trimeresurus albolabris, we collected 98 samples from 27 localities covering its entire distribution. Two mitochondrial gene fragments (cyt‐b and ND‐4) and two nuclear genes (RAG‐1 and NT‐3) were sequenced and analysed. Bayesian inference and maximum‐likelihood methods were employed to reconstruct the phylogenetic relationships among populations based on the two mitochondrial fragments, and the median‐joining networks were depicted using nuclear genes. Divergence date and ancestral area were estimated, and the population demographic history was inferred. Both phylogenetic analyses consistently uncovered that Trimeresurus albolabris was monophyletics, with five geographically structured lineages. Divergence date and ancestral area estimation indicated that T. albolabris originated in northern Thailand and eastern Myanmar at c. 7.15 Ma. Population dynamics analyses showed the southern China lineage has experienced population expansion and contraction, but the others have not. Both the interglacial expansion and the highly heterogeneous habitats resulting from the uplift of the Plateau played a joint role in shaping the present distribution and population structure. The evolutionary history of T. albolabris can be explained by a pattern of two direction dispersal: first from North to South, and then from West to East.     

未来气候变化对海南橡胶树春季物候期的影响

为研究未来气候变化对海南岛橡胶树春季物候期(第一蓬叶展叶期和春花期)的影响,以国内外关于橡胶树物候期量化研究和橡胶树观测试验数据为基础,结合作物生长钟模型,建立橡胶树春季物候期模型,开发成计算机软件RubberSP并进行适宜性评价。在此基础上,通过贝叶斯模型平均法(BMA)结合耦合模式比较计划第五阶段(CMIP5)多模式数据集中的5个大气环流模式(GCMs),分别在RCP2.6、RCP4.5和RCP8.5气候情景下,以1986—2017年为基准时段,预估2020—2099年气候变化对橡胶树春季物候期的可能影响。结果表明:RubberSP的模拟精度较高,模拟值与实测值的决定系数R²为0.73～0.87,均方根误差RMSE为3.26～4.15 d,归一化均方根误差NRMSE为3.4%～7.4%。BMA方法可以有效地处理单一GCMs带来的不确定性问题,较好地反映出气温变化趋势;预估RCP2.6、RCP4.5和RCP8.5情景下,海南岛至21世纪末较基准时段分别升温超过0.3、1.0和2.5 ℃。在未来气候情景下,春季物候期出现日序提前,产胶量提高的可能性变大。日序等值线均向西北方向移动,海南岛橡胶树种植最适宜区有向西北方向扩大的可能。第一蓬叶展叶期的空间差异性变大,春花期则略微变小。橡胶树春季物候期在未来3种情景下提前或推迟的变化幅度随RCP情景下升温的幅度而变化,RCP2.6最平缓,RCP8.5最剧烈。     

论中国海南岛的生物地理起源

当前海南岛植物区系以热带分布的科和属占绝对优势,在属的地理成分上热带亚洲分布属的比例最高,显示出它是一个热带性质的植物区系,并具有热带亚洲亲缘。在海南植物区系中,仅有7个特有属和约10%的特有种,极低的特有性显示了它具有明显的大陆起源特征。通过比较研究发现,中国海南植物区系与越南植物区系关系最密切,其次是广西植物区系。在哺乳动物上,也显示出与植物区系类似的生物地理格局,中国海南与越南的联系最密切。古植物学研究揭示海南岛在始新世时曾具有亚热带性质的植物区系和亚热带气候,处在比现今更北的位置。古地磁学研究揭示在中生代时期海南岛连接着越南和中国广西,处于比现在高5~6个纬度的位置。综合各方面的研究,我们从生物地理的角度提出中国海南岛在始新世时曾连接着越南和中国广西,后来发生了向东南移动和旋转,最终到达现在的位置。     

Analysis of green pit viper (Trimeresurus alborabris) venom protein by LC/MS-MS

Green pit viper venom has major effect on the hematological system having a thrombin-like effect. Thus, this study is designed to analyze the composition of Trimeresurus albolabris venom by performing gel filtration and LC/MS-MS. The purified protein was then digested by trypsin, and the tryptic fragments were analyzed by iontrap spectrophotometry. This study found four types of proteins, namely jerdonitin, stejaggregin-A beta chain-1, stejnobin, and stejnihagin-A, as the components of T. albolabris venom. All of these toxins played a greater or lesser role in clot formation or otherwise contributed to cross-reactions in antivenom production.     

山烙铁头蛇属在中国海南岛的发现（蛇亚目：蝰科：蝮亚科）

作者有幸在上海自然历史博物馆收藏中发现采于海南岛的山烙铁头蛇属（Ovophis Burger in Hoger and Romano Hoge,1981）标本1号。该属广泛分布于中国、东亚和东南亚大部地区,但在海南岛尚无报道。本文对该标本详加描记。根据其鳞被特征,特别是尾下鳞成单,将其鉴定为过去仅知分布于越南山区的越南山烙铁头蛇Ovophis tonkinensis (Bourret,1934）是为中国蛇类的新纪录。