HLA—DRB1等位基因的多态性及其应用

HLA系统参与和调节机体免疫功能,是人类重要叫遗传标志,具有种族、地域差异。HLA—Ⅱ类系统中DRB1等位基因的多态性最丰富,它的准确分型直接影响器官移植的供体选择、法医学个体认定、HLA与疾病相关性及人类学等研究。本文综述了HLA—DRB1分型检测方法,不同种族人群HLA-DRB1等位基因的多态性,HLA—DRB1多态性研究在探讨人类起源、民族融合方面的价值,HLA—DRB1与肝炎、系统性红斑狼疮等疾病的相关性等。     

甘肃裕固族HLA—DRB1基因多态性及其族源分析

目的：研究甘肃裕固族HLA—DRB1基因的多态性,探讨裕固族的起源、迁徙及其与其他民族的关系。方法：应用PCR-SSP基因分型技术,对54例裕固族个体进行了HLA-DRB1位点的基因分型并进行相应等位基因频率的比较。结果：甘肃裕固族HLA-DRB1位点共检出了14种等位基因,其中高频基因为DR5（0、2115）,DR4（0、1346）和DR7（0．1250）,低频的等住基因为DR14（0．0096）和DR13（0．0192）;裕固族人HLA-DRB1座位等位基因总的分布格局与蒙古族最接近,与云南黎族则相差较远。结论：对裕固族和我国各地人群的HLA-DRB1频率进行了聚类分析,极为相似的HLA-DRB1背景提示裕固族和蒙古族之间密切的遗传关系。     

人类白细胞抗原与鼻咽癌的相关性

鼻咽癌是一种多因素影响的复杂性疾病, 其发病具有显著的地理分布差异。Epstein-Barr(EB)病毒感染与鼻咽癌发病密切相关已得到公认, 但环境因素及遗传因素在鼻咽癌的发病中也具有重要作用。在鼻咽癌的遗传相关因素中, 位于6号染色体上具有高度多态性的人类白细胞抗原(Human leukocyte antigen, HLA)与鼻咽癌发病风险相关在多个研究组中被报道。随着DNA测序技术的发展, 高分辨基因分型技术的应用, HLA新等位基因数目呈指数级的上升, 更多的HLA全基因序列被研究者所报道。近年来, 等位基因关联性分析、微卫星连锁不平衡分析及全基因组关联性分析的研究结果均证实了6号染色体HLA区域与鼻咽癌具有显著关联。为了进一步探讨遗传相关性因子HLA在鼻咽癌发生发展中的作用, 文章着重综述了HLA与鼻咽癌相关性研究的最新进展, 为鼻咽癌HLA相关性研究提供新的思路。     

HLA基因多态性与结核病遗传易感性的研究进展

随着人类基因组计划的完成和功能基因组学的研究的进展,多种结核病候选易感基因被发现,其中人类白细胞抗原（HLA）基因是主要的候选基因之一。HLA基因作为人类最复杂、最具多态性的遗传系统,其功能涉及到机体免疫的各个方面,不同个体对疾病易感性的差异在很大程度上是由遗传因素所决定的,因此HLA基因与某些免疫性疾病的相关性已经成为近年来研究的热点,国内外学者对不同种族的人群对结核分枝杆菌感染的易感性做了大量的研究,探讨HLA基因多态性与结核病遗传易感性的关系。本文对这方面的研究进展做一综述。     

甘肃裕固族HLA-DRB1基因多态性及其族源分析

目的:研究甘肃裕固族HLA-DRB1基因的多态性,探讨裕固族的起源、迁徙及其与其他民族的关系.方法:应用PCR-SSP基因分型技术,对54例裕固族个体进行了HLA-DRB1位点的基因分型并进行相应等位基因频率的比较.结果:甘肃裕固族HLA-DRB1位点共检出了14种等位基因,其中高频基因为DR5(0.2115),DR4(0.1346)和DR7(0.1250),低频的等位基因为DR14(0.0096)和DR13(0.0192);裕固族人HLA-DRB1座位等位基因总的分布格局与蒙古族最接近,与云南黎族则相差较远.结论:对裕固族和我国各地人群的HLA-DRB1频率进行了聚类分析,极为相似的HLA-DRB1背景提示裕固族和蒙古族之间密切的遗传关系.     

新疆吐鲁番地区维吾尔族HLA-DQA1等位基因多态性研究

目的：探讨新疆吐鲁番地区维吾尔族HLA—DQA1等位基因多态性。方法：采用聚合酶链反应一序列特异性引物技术,检测107例新疆吐鲁番地区维吾尔族健康个体的HLA—DQA1等位基因频率,分析HLA—DQA1基因多态性,并将所得结果与国内其他民族的同类资料进行比较。结果：新疆吐鲁番地区维吾尔族健康个体中共检出10个等位基因,以DQA1＊0104（O．3727）、DQA1＊0501（0．2636）、DQA1＊0103（0．1318）的频率较高,DQA1＊0401（0．0045）、DQA1＊0601（0．0091）的频率较低。结果与国内其他民族的同类资料进行比较,等位基因分布频率上有共同点,也有一定的独特性。结论：新疆吐鲁番地区维吾尔族HLA—DQA1基因,与国内其他民族群体的资料比较,总体检验有显著差异（p〈0．01）,显示人类的遗传系统既有共性亦有各自的特点,显示华人群体遗传背景的复杂性,结果为人类学研究和HLA—DQA1基因相关的疾病提供了较为重要的信息.     

HLA-DRB1等位基因和抗HLA-DRB1抗体在尿毒症患者中的分布特征

为了研究华南地区尿毒症患者的HLA-DRB1等位基因频率分布及抗HLA-DRB1抗体类型,收集尿毒症患者和健康对照者的外周血,通过聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSO)方法对HLA-DRB1等位基因进行基因分型。经Luminex系统检测因尿毒症进行肾移植的患者中抗HLA-DRB1抗体的类型和频率,用HLAMatchmaker数据库比较和分析HLA-DRB1的表位及其氨基酸序列,通过统计软件分析患者中HLA等位基因和抗HLA抗体的类型和频率。结果发现:与健康对照者相比,尿毒症患者HLA-DRB1*13等位基因的频率显著低于健康对照者(4.33%vs. 13.37%,P0.001);HLA-DRB1*14等位基因的频率显著高于健康对照者(12.01%vs.4.12%,P0.001)。在所有类型的抗HLA-DRB1抗体中,抗HLA-DRB1*01/*13/*14抗体的频率显著低于其他抗HLA-DRB1抗体的频率(P0.05)。经HLAMatchmaker数据库分析发现,HLA-DRB1*01/*13/*14等位基因中的常见表位为77T。这表明:在基因频率上,HLA-DRB1*13与尿毒症患病率呈负相关,可能对个体具有保护作用;HLADRB1*14与尿毒症患病率呈正相关,可能是尿毒症的易感因素。尿毒症患者中抗HLA-DRB1*01/*13/*14抗体的水平显著低于其他抗HLA-DRB1抗体,这可能是由存在的共同表位77T所致。研究结果将为深入了解HLA-DRB1基因与尿毒症的关系奠定基础,对阐明HLA-DRB1基因在尿毒症及肾移植中的作用提供试验依据。     

同一染色体上基因转换在HLA多态性形成中的作用

摘要: 人类白细胞抗原(Human leukocyte antigens, HLA)是人类基因组中已知多态性最高的基因家族, 为人类面对异源多变的外界生物分子所必须。以往对HLA多态性形成的研究多集中在互换式重组机制上, 文章研究了基因转换这一重要的多态性形成机制在HLA-DRB基因多态性形成中的作用。应用已知的各基因座的等位基因序列对其进行多态性分析表明, HLA-DRB是一高度多态的基因家族。用Ester Betran模型检测到32个基因转换的区域, 最小的基因转换区域长2 bp, 最远差异位点间隔为204 bp。在71~75、18~221等几个区域上出现基因转换的频数高, 成为基因转换的热点。进一步的分析显示, 71~75、205~217等热点区域分别与东方人、高加索人这两个人群密切相关, 提示基因转换的热点可能具有一定的人群特异性     

应用PCR-SSOP技术研究中国汉族、维吾尔族HLA-A基因座基因多态性

人类白细胞抗原（Human Leukocyte Antigen,HLA)基因复合物位于6p21.3,有220多个不同的功能基因,是人类基因组最复杂的遗传多态系统。HLA等位基因的变异在医学、法医学、人类学等领域具有重要的意义。自从1964年以来,HLA分型一直采用经典的微量淋巴细胞毒实验,但该方法是血清学水平的分,不能识别很多特异性的等位基因,而且高质量的抗体也不易获得。从20世纪90年代起,在国家自然科学基金的资助下,首先开展HLAⅡ类位点基因分研究及大规模群体多态性调查,所获得的中国主要民族基因数据已应用于多个领域。相比之下,HLAⅠ类基因数量更丰富,包含了A、B、C、E、F、G和假基因H、J、K、L等10个位点;基因分子结构更复杂,更具多态性。因此,HLAⅠ类DNA分型比HLAⅡ类分型及行多困难。直至目前中国人群HLA－A基因座基因多态性和分布频率的研究尚未充分进行。而任何DNA标记用于遗传分析、法医鉴定等领域之前,必须先进行群体调查,建立不同民族基因数据库,这是不可逾越的基础工作。鉴于此,采用灵敏而非同位素污染的PCR－SSOP基因分型技术,对165个汉族和162个维吾尔族个体的HLA－A基因座多态性进行调查。结果在汉族群体中发现22种等位基因,频率最高的是HLA－A＊1101（19．7％）,其次是＊201（12．72％）;在维族群体中发现22种等位基因,频率最高的是＊2407（17．90％）,等位基因＊0101、＊0201和＊3301的频率均大于10％;HLA－A＊0203、＊0205、＊0302、＊2403和＊3302仅在汉族群体中检出;HLA－A＊0205、＊0211、＊2301、＊2502、＊68012和＊6802仅在维族群体中检出。按照Hardy-Weinberg平衡定律检验,两个民族各等位基因型频率的预期值与实际观察值相吻合（P＞0．05）,证明了所获得汉族、维吾尔族HLA－A位点基因频率具有可靠性;同时也表明各等位基因的遗传特征符合符合孟德尔规律。经计算机统计分析,汉族群体HLA－A基因座杂合度（Heterozygosity,H)、个体识别率（Discrimination Power,DP)和非父排排率（Proba-bility of Paternity Exclusion,EPP)分别为0．9029、0．9776和0．8592;维族群体H、DP和EEP分别为0．9063、0．9379和0．7885。和其他遗传标记（如VNTR、STR、SNP）的单一位点相比,HLA－A具有高度的杂合率、个体识别率和非父排除率。因此,HLA－A等位基因在法医个体识别、亲权鉴定、基因诊断、人类学等领域具有重要的应用价值。     

HLA-F研究进展

人类白细胞抗原（human leucocyte antigen,HLA）复合体是人体中基因多态性最高的基因复合体,其多态性与疾病遗传易感性显著相关。人类白细胞抗原-F（human leucocyte antigen-F,HLA-F）属于非经典HLA I类分子中的一员,与HLA-E、-G在结构上十分相似,具有有限的多态性。近年来多数学者聚焦于HLA-F基因转录及分子表达调控、HLA-F表达与临床相关性及HLA-F抗体研制,且取得了重要成果。就HLA-F的研究进展作一综述。