2009年云南省边境地区健康儿童肠道病毒测序定型和ECHO7、ECHO13病毒的基因特征分析

了解2009年缅甸入境健康儿童和云南省口岸地区健康儿童肠道病毒(enterovirus,EV)带毒情况并对埃柯病毒7型(ECHO7)和埃柯病毒13型(ECHO13)的基因特征进行了描述。采集9个边境口岸小于15岁的健康儿童粪便标本271份,进行病毒分离和基因测序定型。271份便标本中共检测到EV30株(带毒率为11.1%),其中脊髓灰质炎病毒(poliovirus,PV)6株(阳性率2.8%),均为疫苗株,未发现脊灰野病毒;检测到非脊灰病毒(NPV)24株(阳性率8.9%)。经VP1区核苷酸序列测定,24株NPV全部为人类肠道病毒B组(HEV-B,6个血清型),其中13株为埃柯病毒7型(echovirus 7,ECHO7,占54.17%),5株为ECHO13(占20.83%)。未分离到HEV-A组,HEV-C组和HEV-D组病毒。2009年缅甸入境健康儿童和云南省口岸地区健康儿童中肠道病毒携带率较高,且均为HEV-B组病毒,其中主要型别为ECHO7和ECHO13,这两种病毒存在基因多样性特点(即存在不同的基因型)。     

Etude d'infections à virus ECHO 9

At Ste. Justine Hospital, Montreal, during the period 1957-61, ECHO 9 virus was isolated in 27 cases, in 20 of these during the summer of 1961. All had evidence of meningeal irritation, accompanied by fever and headache. Four of the 20 patients diagnosed during the summer of 1961 had convulsions; 12 presented with a rash; and two simulated meningococcemia. Of the 27 patients, two were paralyzed and one case was diagnosed as transverse myelitis. ECHO 9 virus was isolated from stools and from throat specimens in equal proportion; it was isolated from cerebrospinal fluid in only two instances. Pathogenicity for suckling mice was observed in two of 22 inoculated directly with the specimen material and in 10 of 11 inoculated with the cultured material.     

肠道病毒ECHO13中国分离株的基因特征

为研究ECHO13病毒中国分离株的分子特征及其与世界其它分离株之间的基因关系,对1998年、2000年从中国福建省分离到2株ECHO13病毒进行基因序列对比分析.2株病毒分别命名为Fujian98-1和Fujian00-1,用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出VP1蛋白编码基因全长861个核苷酸片段并进行序列测定,将2株ECHO13病毒的VP1序列与所有已发表的ECHO13病毒VP1基因全长进行同源性比较.结果显示,福建分离株之间核苷酸同源性为79.6%,氨基酸同源性为93.4%;与遗传距离最近的法国CF1089-91(AJ537604)毒株的核苷酸同源性分别为80%和88%,与代表株Del Carmen的核苷酸同源性分别为75.8%和77.9%.通过VP1基因分析,福建2株病毒均属于ECHO13病毒,与血清中和试验鉴定结果一致.下载所有已发表的ECHO13病毒VP1序列并构建进化树,发现福建2株病毒分属不同的分枝,提示这2株病毒来自不同的病毒传播链.进一步分析发现,整个ECHO13病毒可划分为3个不同的基因型:A、B和C基因型.福建Fujian98-1和Fujian00-1分别被划分在基因型B和C中,各基因型之间的核苷酸差异均大于20%.为验证该分型方法,将26株来自不同国家和时间的ECHO13病毒和2株福建分离ECHO13病毒部分VP1基因序列进行对比分析,建立进化树.结果显示,所有ECHO13病毒被分在A、B和C3个基因型中,而2株福建分离病毒仍然被分在B和C基因型中.除了B基因型1株病毒以外,所有3个基因型之间的核苷酸差异均大于15%,与VP1全长分型结果基本一致,说明部分VP1序列的基因分析也能用于对ECHO13病毒进行规律和分子流行病学的研究中.该研究首次报道了ECHO13病毒中国分离株的VP1蛋白基因全长序列,并推荐按VP1基因全长核苷酸差异≥20%作为划分基因型的标准,将已知的ECHO13病毒划分为A、B和C3个基因型.同时也可用病毒VP1基因5′端部分序列替代VP1全长序列来划分基因型.     

基于群体感应表征生物学震荡Operation ECHO

清华大学干队(清华A)利用matlab建立不同的浓度梯度下,两个分别表达红色荧光和绿色荧光的大肠杆菌群体相互作用的转录调控模型。与湿队合作深入探索"生物振荡器"的研究。     

肠道病毒ECHO25河南分离株基因特征分析

首次对ECHO25病毒进行分子生物学分析,阐明ECHO25(Entric Cytopathic Human Orphanviruses Type25)病毒河南分离株的分子生物学特征及其与世界其它分离株的基因关系。逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出VP1蛋白编码基因并进行序列测定,将所测4株ECHO25病毒的VP1序列与GenBank上已发表的ECH-O25病毒VP1区进行同源性比较及遗传进化分析发现:河南省4株ECHO25与标准株JV-4核苷酸同源性为79.2%～80.1%,氨基酸同源性为89.0%～92.4%;河南省4株ECHO25核苷酸同源性为93.0%～99.0%,氨基酸同源性为92.4%～97.5%;HN-01分离株与HN-26分离株高度同源,其核苷酸同源性达99.0%;河南省4株ECHO25同属B1基因亚型。     

我国新分离ECHO30病毒VP1序列分析

测定了引起2003年苏北地区无菌性脑膜炎暴发流行的病因病毒FDJS03分离株的VP1基因序列,并与国外同型流行毒株做比较,以了解本流行株的分子生物学特点及遗传变异规律。随机选取FDJS03分离毒株中的4株,用肠道病毒、VP1序列的特异性引物008／011进行RT-PCR,扩增产物经凝胶纯化后测序。将序列输入GenBank,用BLAgr程序进行核苷酸和氨基酸序列比对;选取32株不同地区不同年代的ECHO30分离毒株,在PHYLIP3．573C和TREE-PUZZLE5．0中构建进化树,比较它们完整VP1序列(876nt)的进化关系。核苷酸和氨基酸同源性比较结果证明：4株分离病毒均为ECHO30。进化树分析显示：本次FDJS03分离株与欧美20世纪70、80年代流行株亲缘关系最近,但自成一簇,与国外毒株仍然有地区差别。ECHO30的VP1基因进化有时间效应,但存在地区差异。本次流行的病原可能是单一基因型的ECHO30病毒。     

急性弛缓性麻痹病例中ECHO11病毒的基因特征分析

该文首次分析了我国ECHO11病毒的分子流行病学资料。1999~2004年,ECHO11病毒是山东省急性弛缓性麻痹(AFP)病例中分离到的优势毒株,2003年从山东省482例AFP病例中共分离到11株ECHO11病毒,其中相关的10例病例分布跨越山东省大部分地区,但发病日期集中在7月和12月。该研究试图通过对VP1编码基因全序列的测定和分析,为探讨ECHO11病毒与AFP之间的病因关系提供线索。分子流行病学研究提示,11株E-CHO11毒株都位于同一传播链,核苷酸同源性为97.2%~100%,氨基酸同源性为99.6%~100%,其中7月和12月的分离株之间相差8~9个核苷酸,氨基酸序列一致。这说明山东省2003年7月和12月分别发生了ECHO11病毒流行,但这些毒株与AFP的病因关系尚需进一步研究。11株病毒组成了A基因型中的一个新亚型,在进化树上单独呈密切相关的一簇,与同基因型内的其它亚型的核苷酸同源性为82.2%~84.7%,氨基酸同源性为94.8%~97.6%。     

肠道病毒ECHO20血清型鉴定和VP1序列初步分析

肠道病毒(Enterovirus)是最常见的人类致病病毒之一,包括脊髓灰质炎病毒、柯萨奇A组病毒、柯萨奇B组病毒和ECHO病毒。一般认为大多数肠道病毒感染症状轻微或不明显,然而有时肠道病毒感染也可能是严重甚至致命的[1]。2004年云南省潞西县局部地区发生小规模的甲肝流行,我们从当地     

肠道病毒ECHO20血清型鉴定和VP1序列初步分析

肠道病毒(Enterovirus)是最常见的人类致病病毒之一,包括脊髓灰质炎病毒、柯萨奇A组病毒、柯萨奇B组病毒和ECHO病毒.一般认为大多数肠道病毒感染症状轻微或不明显,然而有时肠道病毒感染也可能是严重甚至致命的[1].2004年云南省潞西县局部地区发生小规模的甲肝流行,我们从当地部分患者粪便标本中分离到多株甲肝病毒,同时,经过肠道病毒组合血清和单价血清的中和试验,证明患者为甲肝和ECHO20病毒双重感染.通过文献检索我们发现,国内对ECHO20病毒的相关研究极少,且多限于病毒的血清学分离鉴定,而对其重要的衣壳蛋白编码基因vp1的测定和分析尚未见报道,为阐明ECHO20分离株的分子流行病学特征,分析其基因变异规律,探讨我国分离株和国外分离株的区别和联系,我们测定了编码重要抗原决定簇的整个vp1序列,并和GenBank中已有的ECHO20病毒vp1基因序列进行了比较分析.     

引起甘肃省一起病毒性脑炎疫情的ECHO30全基因组序列分析

为了解引起2015年甘肃省酒泉市瓜州县病毒性脑炎疫情的ECHO30的基因特点,分析其重组变异和进化规律,对从患者脑脊液标本中分离到的3株ECHO30进行全基因序列测定和分析,采用Simplot3.5.1软件进行重组分析,并利用MEGA6.0软件构建系统进化树。结果表明,本次疫情中分离到的ECHO30与E30/SD/2010/CHN株的相似度最高(92%~99%)。重组分析表明甘肃ECHO30株在非结构蛋白区P2区和P3区出现了多处重组现象。由于对当地流行的肠道病毒谱不清楚,虽然发现此次流行的病毒存在重组,但是对重组片段的来源尚不明确,因此需要加强对甘肃省流行肠道病毒的本底调查工作和遗传背景的研究工作。     

一起传染病暴发中肠道病毒血清型鉴定和ECHO30基因特征分析

2003年5～9月,山东省泰安市发生了由肠道病毒(Enterovirus,EV)感染所致的传染病暴发,临床症状以手足口病(HFMD)为主,同时有心肌炎和无菌性脑膜炎等中枢神经系统症状患者也占较大比例。131份病人(粪便、咽拭子、脑脊液)标本中共分离到EV62株,其中ECHO1939株,EV716株,ECHO304株,其它肠道病毒13株。4株ECHO30病毒中的2株分离自2个患者的粪便标本,但用WHO肠道组合血清中和试验未能定出型别。另外2株分离自同一患者的粪便和脑脊液标本。病原学分析表明,ECHO30是引起该患者无菌性脑膜炎的病原。抗E—CHO30标准株的血清中和这4株病毒的滴度低于标准株5～20倍。VP1区全基因序列测定和同源性比较分析表明,4株ECHO30分离株病毒核苷酸同源性在98．0％～98．5％,氨基酸同源性在98．9％～99．3％,提示这4株病毒来源于同一传播链,2003年5～9月ECHO30在该地区可能有局部流行。系统进化树分析表明,ECHO30病毒可以划分为6个基因型,其中基因型1～5为GenBank中已发表的ECHO30分离株,山东分离株与其它5个基因型成员核苷酸差异分别在9．4％～24．4％,在进化树上形成了较独立的分支,是一个新基因型,将其划分为第6基因型。     

不同细胞对ECHO 6 D’Amorl毒株的血凝能力改变的影响

(一)ECHO 6 D’Amori毒株10-0及10-3稀释的病毒在原代人腎细胞上传至第四代就出现血凝,即可以使无血凝能力的毒株变为有血凝能力的毒株。用10-5,及终稀释度的病毒传代,刖不能产生血凝。 (二)D’Amori毒株无论是10-0、10-3或10-5,在原代人羊膜细胞上传代均无血凝出现,但已获得血疑能力的D’Amori毒株传于原代人羊膜细胞,则能保持其原有的血凝能力。 (三)已获得血凝能力的D’Amori毒株在KB细胞上传1一20代均无血凝出现,但一旦传回至原代人肾细胞,就能产生血凝。 (四)本文就不同细胞对D’Amori毒株的血凝能力影响的机制进行了讨论。     

蛇油、蛇肉、蛇血、蛇胆、蛇毒、蛇蜕的应用

蛇 ,早在《本草纲目》就有记载 ,其性温平 ,入肝、脾二经 ,治诸风、顽癣、皮肤不红风疹 ,清内火 ,清热解毒等 ,其内走脏腑 ,外彻皮肤 ,自然界中的蛇无论有毒无毒皆具食用和药用价值。1　蛇油　　中医常用来治疗冻疮及烫伤 ,近年研究发现蛇油中以不饱和脂肪酸为主 ,其对皮肤粘膜有较强的亲和渗透性易被皮肤吸收 ,所以近年多用来制成美容护肤的化妆品 ,研究证明蛇油具有加速皮肤的新陈代谢 ,增强细胞活力 ,抗皮肤衰老 ,增加光泽等功效 ,1 999年笔者曾用蛇油加入适量血竭、儿茶成功治愈 1例十年臁疮患者 ,患者老年男性 ,因多处医治无效 ,就诊时…     

鲢、鳙、青、草鱼地理分布的研究

鲢、鳙、青、草鱼是我国最重要的四种淡水家养鱼类,自1958年人工繁育成功后,现已被各处广为引种养殖,其原来的自然分布区迄今尚无专文研究,为了避免将来无从查考,本文根据较早文献记载及有关鱼化石的研究等,对其自然分布区作了归纳,并对其分布规律作了较详的分析及说明。     

鲤鱼、白鲢、鳊鱼的鱼苗、鱼种耗氧量的研究

应用测定流水中溶氧量的方法,测定了红鲤、鲤鱼、白鲢和鳊鱼鱼苗、鱼种的耗氧量。温度为20℃。 四种鱼耗氧量与体重的关系式为:红鲤Y=0.00104X~(0.84);鲤鱼Y=0.00085X~(0.89);白鲢Y=0.00091X~(0.88);鳊鱼Y=0.00082X~(0.91)。在同一体重组内,四种鱼耗氧量没有明显差异。但鱼苗长重关系不同,因此,种间代谢水平有别。 根根据的方程式,估计了红鲤、白鲢和鳊鱼鱼苗发育过程中的饵料消耗量。发现在本实验条件下,红鲤饵料系数最低,白鲢次之,鳊鱼最高。 证实了红鲤鱼苗、鱼种耗氧量存在昼夜变化,鱼种的情况较为明显。 根据鱼苗耗氧量特点,提出生产实践应注意的措施,供参考。     

四川粮食、蔬菜中锌、铜、铁、锰的含量

一、前言锌、铜、铁、锰是与人和动物的生命活动密切相关的微量元素。当这些元素过量时,人与动物会中毒;但这些元素缺乏时也会引起人和动物发生缺乏性的疾病。人与动物所需要的锌、铜、铁、锰主要来源于食物和饲料。粮食和蔬菜是人的食物和动物的饲料的重要组分。因此,测定粮食、蔬菜中的锌、铜、铁、锰的含量对研究人和动物的微量元素营养有着重要的意义。锌、铜、铁、锰也是植物生长发育必不可少的微量养分。近年来,随着科学研究的深入和发展,在缺乏这些微量元素的土壤上,这些     

贵州布依族、仡佬族、仫佬族、毛南族、壮族Y-SNP的初步研究

为分析贵州布依族、仡佬族、仫佬族、毛南族、壮族父系遗传结构, 探讨其起源及迁徒。通过聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性(PCR-RFLP)方法检测贵州境内5个民族10个SNP位点构成的Y染色体单倍型, 并以省内苗族为对照分析其父系遗传结构。结果显示5个民族集中于Y-SNP中H8单倍型, 苗族样本集中于Y-SNP中的H8、H11与H12单倍型。说明贵州省布依族、仡佬族、仫佬族、毛南族、壮族5个民族之间有密切联系, 且与国内其他地域有较大的遗传差异, 是一个相对独立的群体。