线粒体D-loop序列变异与东方鲀属鱼类系统发育

东方鲀属的红鳍东方鲀（Takifugu rubripes）是后基因组时代的一种重要模式生物。本研究中,利用东方鲀属11种鱼类（18尾）的D-loop基因序列,对东方鲀属鱼类的系统发育关系进行研究。经序列比对排定后,分析中D-loop序列有841个位点,其中395个位点为可变位点,267个位点为系统发育信息位点。分别采用邻接法（NJ）、最大简约法（MP）、最大似然法（ML）和贝叶斯方法构建了分子系统树。研究结果表明：（1）东方鲀属鱼类为一单系类群;（2）由横纹东方鲀（T. oblongus）和铅点东方鲀（T. alboplumbeus）构成的姊妹群位于这个类群的基部。此外,本属鱼类物种分类现状还需要进一步的澄清。     

革鲀科鳞片构造的扫描电镜观察和比较研究

革鲀科的鳞片构造不同于一般真骨鱼类的骨鳞,由特化的基板和鳞棘两部分组成。中国有革鲀科鱼类12属19种,本文研究了其中10属14种的鳞片构造,运用扫描电镜进行了观察和比较。根据基板表面棱突的特征,可将革鲀科基板构造分为3个式型、2个亚型;根据鳞棘数目、形状及排列方式的不同,可以划分为4个式型。革鲀科各种间的鳞片具有不同的性状,而且比较稳定,因此可以作为分类鉴定的依据之一。     

河鲀古文观止

自古以来,人们与河鲀就结下了不解之缘。河鲀肉味腴美,但又有剧毒所,以一向为人们所重视。我国是研究河鲀最早的国家,有关河鲀研究的历史可追溯至远久。约在三千年前,人们已知河鲀含有一种有毒物质。一、名称的记载鲀类(Tetraodontoid)。属硬骨鱼纲,鲀形目(Tetrodontiformes)。鲀科(Te-odontiae)中各属鱼类(如东方鲀属 Fugu,兔鲀属 Lagocephalus,腹刺鲀属(Gastr-ophysus,宽吻鲀属 Amblyrhynchotes,凹鼻鲀属 Chelonodon,叉鼻鲀属 Arothron,     

中国鲀科鱼类一新纪录种(英文)

2010年3月和5月分别在北部湾口附近采获鲀科Tetraodontidae兔头鲀属Lagocephalus鱼类标本2尾,经形态学和DNA条形码分析,鉴定为兔头鲀L.lagocephalus(Linnaeus,1758),系我国鱼类1新纪录种。并对新纪录种——兔头鲀的分类地位进行了探讨。研究标本保存于广东海洋大学水产学院。     

4种河鲀全基因组微卫星分布特征分析

本研究利用MISA软件对四种河鲀全基因组中的微卫星进行筛选并分析.结果如下:在红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)(391.49 Mb)、菊黄东方鲀(T.flavidus)(366.29 Mb)、双斑东方鲀(T.bimaculatus)(371.68 Mb)及黑青斑河鲀(Tetraodon nigroviridis)(342.40 Mb)全基因组中,分别筛选出142 885个、135 009个、147 549个和179 703个完整型微卫星.相对丰度分别为365个/Mb,369个/Mb,397个/Mb和525个/Mb.微卫星总长度分别为2 876 322 bp,2 689 710 bp,3 140 445 bp 和3 615 069 bp,分别占基因组序列总长度的0.73％,0.73％,0.84％和1.06％.在1～6个不同碱基重复类型完整型微卫星中,四种河鲀的6种碱基类型数目排序是一致的.均是单碱基重复数目最多,然后依次是二碱基、三碱基、四碱基、五碱基和六碱基.其中AC,A,C,AG,AGG,AT,AAT和AAC是四种河鲀共有的常见核心重复类别.东方鲀属(Takifugu)三种河鲀基因组微卫星分布特征极为相似,分析红鳍东方鲀和双斑东方鲀的遗传距离可能更为接近.鲀属(Tetraodon)黑青斑河鲀与其他三种东方鲀属河鲀除部分微卫星特征相似外,在微卫星总数、微卫星相对丰度和密度、部分碱基类型数目及类别方面和东方鲀属差距较大.这可能与两属鱼类地理分布及进行滑动复制的碱基组成有关,推测东方鲀属和鲀属基因组可能具有独特的进化机制.本研究为多种河鲀基因组特征分析、多种河鲀微卫星引物设计、不同属种河鲀遗传距离及亲缘关系的探究等奠定了基础.     

基于轻量级卷积神经网络的红鳍东方鲀个体身份无损识别方法

文章充分利用红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)体侧纹理特征提出了一种基于轻量级卷积神经网络的鱼类个体身份识别方法,可在无损前提下实现红鳍东方鲀个体身份的高精度识别。首先,采用SOLOv2模型进行前景分割,并结合红鳍东方鲀体型特点,通过质心和哈希值计算方法完成数据集生成和筛选;随后,从多维度分别测试主流深度学习图像分类骨干网络和不同损失函数在红鳍东方鲀身份识别中的效果;继而,在MobileNet v2骨干网络基础上,耦合Softmax Loss函数,建立了一种适用于红鳍东方鲀的个体身份无损识别的最优组合方法。研究结果表明,文章方法准确率可达90.2%,优于其他相关主流方法(准确率73.6%—89.3%),相关研究成果将为循环水养殖鱼类个体身份无损识别和精准生物量估算提供技术支撑。     

中国东方鲀属鱼类分类研究

东方鲀属(Fugu Abe,1952)鱼类属于硬骨鱼纲、鲀形目。在我国沿海分布甚广,产量大。因体形似“豚”,常在河口捕到,故江、浙一带叫“河豚”。北方俗名叫廷巴,南方叫龟鱼。河鲀肉味鲜美,含蛋白质甚高,久为广大人民所喜好,有些种类列为出口品种,畅销国外。但河鲀系有毒鱼类,早在李时珍名著《本草纲目》中即载有:“河豚有大毒,味虽珍美,修治失法,食之杀人”。故食河鲀时必须将含有剧毒的肝脏、生殖腺和血液等剖洗干净后,     

南中国海野生海水鱼类外寄生车轮虫新记录

研究对采自南中国海的7种海水鱼类进行了调查研究, 并分离获得4种隶属于车轮虫属的种类,分别为浦氏车轮虫Trichodina puytoraci Lom, 1962; 日本车轮虫Trichodina japonica Imai, et al., 1991; 直钩车轮虫Trichodina rectuncinata Raabe, 1958 与鲀车轮虫Trichodina fugu Imai, et al., 1997。研究发现鲀车轮虫Trichodina fugu Imai, et al., 1997为寄主鱼虫纹东方鲀Takifugu vermicularis的病原, 且能在野生条件下将其致死。上述4种车轮虫的形态分类学数据均基于干银法标本获得。研究是对我国南中国海车轮虫的首次报道。       

暗纹东方鲀线粒体基因组核苷酸全序列测定与分析

以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝的线粒体DNA为模板,参照红鳍东方鲀(T.rubripes)等近源鱼类的线粒体基因组DNA序列,设计合成14对特异引物,进行PCR扩增并测序,首次获得了暗纹东方鲀线粒体基因组全序列。结果表明,暗纹东方鲀线粒体基因组序列全长16 444 bp(GenBank登录号为GQ409967),A+T含量为55.8%,其mtDNA结构与其他脊椎动物相似,由22个tRNA基因、2个rRNA基因、13个蛋白质编码基因和1段819 bp非编码的控制区(D-loop)所组成。蛋白质基因除COⅠ和ND6的起始密码子为GTG、CCT以外,均为典型的起始密码子ATG。ND1、ATPase8、COⅢ、ND4L、ND5、Cyt b使用典型的终止密码子TAA,其他的使用不完全终止密码子。除ND6和tRNAGln、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys、tRNATyr、tRNASer、tRNAGlu、tRNAPro在L-链上编码之外,其余基因均在H-链编码。基因排列顺序与已测定的鲀类一致,这显示了鲀类线粒体基因排列顺序上的保守性。tRNA基因核苷酸长度为64～73nt,预测了22个tRNA基因的二级结构,均呈较为典型的三叶草状。基于19种鲀类mtDNA全序列构建的进化树表明,暗纹东方鲀与红鳍东方鲀、中华东方鲀(T.chinensis)聚成一个姊妹群。结果还支持东方鲀属鱼类为一单系类群。     

南中国海野生海水鱼类外寄生车轮虫新记录（英文）

研究对采自南中国海的7种海水鱼类进行了调查研究,并分离获得4种隶属于车轮虫属的种类,分别为浦氏车轮虫Trichodina puytoraci Lom,1962;日本车轮虫Trichodina japonica Imai,et al.,1991;直钩车轮虫Trichodina rectuncinata Raabe,1958与鲀车轮虫Trichodina fugu Imai,et al.,1997。研究发现鲀车轮虫Trichodina fugu Imai,et al.,1997为寄主鱼虫纹东方鲀Takifugu vermicularis的病原,且能在野生条件下将其致死。上述4种车轮虫的形态分类学数据均基于干银法标本获得。研究是对我国南中国海车轮虫的首次报道。     

聚乙二醇-4000对暗纹东方鲀肠上皮电生理的影响

以暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)为研究对象,采用Ussing chamber技术研究了聚乙二醇-4000(PEG-4000)对肠上皮开路电压、短路电流(Isc)、短路电流变化("Isc)、电导(G)、跨膜电位(TEP)的影响。结果表明:PEG-4000在肠道中6 h残留浓度为1.83 g·L-1,显著高于其在水中浓度(P0.05),残留率达184%; PEG处理组暗纹东方鲀离体肠上皮Isc为69.20μA·cm~(-2),显著低于对照组(P0.05);ΔIsc显著低于对照组(P0.05),仅为对照组的68.57%; PEG处理组暗纹东方鲀离体肠上皮电导为24.97 m S·cm~(-2),显著低于对照组(36.22 m S·cm~(-2))(P0.05); PEG-4000在暗纹东方鲀肠道中极易残留、不易渗透,使得肠道上皮的转运蛋白或者离子通道受阻,从而显著影响肠上皮Isc、"Isc以及电导,降低了离子的主动流动量。本研究结果为鱼类肠道电生理平台的构建提供了技术参数,该平台不仅能用于评估PEG等污染物对鱼类肠道的影响,还能用于鱼类肠道上皮细胞离子转运机制的研究。     

鳜类系统发育的线粒体Cytb基因全序列分析

测定了鳜、大眼鳜、斑鳜、暗鳜、波纹鳜、长体鳜、中国少鳞鳜等7种鳜类12个个体的线粒体细胞色素b基因全序列。结合GenBank中的同源序列,共分析了9种鳜类的系统发育关系。序列分析表明,鳜属鱼类属内种间的遗传距离(0.015～0.093)明显小于少鳞鳜属鱼类属内种间的遗传距离(0.152～0.178)。在分子系统发育树上,长体鳜与鳜属的鳜、大眼鳜、斑鳜、波纹鳜、暗鳜聚合成一分支,少鳞鳜属的种类聚成另一分支;支持将长体鳜归入鳜属,鳜类分为鳜属和少鳞鳜属等二个属的分类处理。在鳜属鱼类中,鳜和大眼鳜亲缘关系十分密切;斑鳜与波纹鳜亲缘较近;长体鳜与鳜属其它5个种的亲缘关系较远。在少鳞鳜属鱼类中,中国少鳞鳜和日本少鳞鳜的亲缘关系较远,韩国少鳞鳜的系统位置较不明确。鳜类的单系性及其鳜类的系统位置仍有待进一步研究。     

暗纹东方鲀线粒体COI及其侧翼tRNA基因的克隆与序列分析

以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝脏的线粒体DNA为模板,按照红鳍东方鲀线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,克隆并测定了线粒体细胞色素氧化酶I亚基（COI）及其侧翼tRNA基因的全序列,结果显示,克隆了暗纹东方鲀COI基因1546bp及其5′端上游的tRNATyr基因和3′端下游的tRNASer基因序列共1766bp。用DNA分析软件对暗纹东方鲀与GenBank中10个目13种鱼类的COI序列进行比较分析,显示暗纹东方鲀与这些鱼类的COI基因具有较高的同源性,与同属红鳍东方鲀的同源性最高为97.6%,与同目不同科的矛尾翻车鲀和翻车鲀的同源性为76.5%和75.4%。根据暗纹东方鲀与其他13种鱼的COI基因序列同源性所建立的进化树,与传统的分类地位基本吻合。推定的这二种tRNA的二级结构都具有典型的三叶草型结构。     

野生和人工养殖的暗纹东方鲀毒性的比较

长江的鲀形目鱼类资源主要有两种,暗纹东方(Fugu obscurus Abe)和弓斑东方Fugu ocellatus(Linnaeus.研究结果表明 :与野生的弓斑东方鲀相比较,野生的暗纹东方鲀的毒性比较低。现在已有人工养殖的暗纹东方鲀,那么它们的毒性是否也像红鳍东方鲀一样,经过人工养殖后毒性有所下降,甚至变为无毒,因此食用更加安全了呢 ?为此,作者进行了研究。       

北祁连山东段早石炭世棘鱼类、辐鳍鱼类和软骨鱼类--北祁连山东段石炭纪鱼类序列研究之一

对甘肃靖远一带和内蒙古自治区黑山地区早石炭世前黑山组、臭牛沟组和靖远组中三亚纲鱼类微体化石进行了形态学和古组织学研究。这些化石涉及 7个目或亚目 ,含 4属 4种 ,其中有 2新种。文中记述的属均为全球广布的属。建立了 3个早石炭世鱼类组合 ,这是我国早石炭世第一个鱼类组合序列。辐鳍鱼类和软骨鱼类中 2个目的化石均为我国早石炭世鱼类的首次记录     

渤海鱼类的复殖吸虫——Ⅲ.动殖科吸虫一新种

1983年6月至11月,我们在天津塘沽检查了一批东方鲀属Fugu鱼类,采获动殖科Zoogonidae(Odhuer,1902)Odbner,1911一新种,现报道如下。 虫体与器官测量以毫米为单位。模式标本保存于南开大学生物系。     

暗纹东方鲀实验鱼的驯养

暗纹东方鲀(Fugu obscurus)俗称江河鲀.隶属鲀形目、鲀科,是一种海江洄游性鱼类.因其有较高的食用价值和经济价值,近年来国内许多地方已开始成批量地大面积养殖.但在其生物学特性及养殖技术方面还有待研究.研制出东方鲀鱼的专用饲料亦是目前养殖业亟待解决的问题.本文根据驯养东方鲀稚鱼和幼鱼实验鱼的实践经验向读者作一介绍.其中有关养殖的技术也可作为大面积养殖的参考资料.     

福建桐山溪鱼类资源调查初报

2011年对福建东北部入海河流桐山溪中的鱼类资源进行了调查.结果表明,桐山溪有淡水及河口鱼类47种,隶属10目16科39属.鱼类组成以鲤形目为主,有3科25属27种,占总种数的57.4％;鲈形目有5科7属7种,占总种数的14.9％;鲀形目有1科1属3种,占总种数的6.4％;鳗鲡目、鲇形目和鲽形目各有1科1属2种,分别占总种数的4.3％;合鳃目、鲑形目、脂鲤目和雀鳝目各有1科1属1种,分别占总种数的2.1％.47种鱼类中,25种为常见种,占总种数的53.2％;花鳗鲡Anguilla marmorata和条纹小鲃Puntius semifasciolatus为稀有种,占总数的4.3％;短盖巨脂鲤Colossoma brachypomus和眼斑雀鳝Lepisosteus oculatus为外来种,占总数的4.3％;其余18种为偶见种,占总数的38.2％.花鳗鲡是国家二级重点保护野生动物,台湾名古屋吻鰕虎鱼Rhinogobius nagoyae formosanus为中国大陆的新纪录种.     

滇池束丝藻水华毒性生物检测

近年来,由于外源污染物大量入湖,致使滇池水体呈富营养状态,蓝藻水华频繁爆发。束丝藻属与微囊藻属随季节演替,成为滇池蓝藻水华的两大优势种群。束丝藻水华暴发期间,滇池放养的滤食性鱼类出现死亡,其原因可能是由于丝状藻体堵塞鱼鳃部而引起,但也不能排除束丝藻毒素的影响。有毒束丝藻水华对鱼类的危害主要表现在几个方面:鱼类受到有毒束丝藻细胞所分泌毒素,如四氢嘌呤碱等毒性毒害;与束丝藻共生细菌毒害;或束丝藻死亡后分解消耗水体中溶解氧造成水体缺氧等都是可以使鱼致死的原因。       

GENOME SIZE

采用Feulgen-显微分光光度计方法,以鸡红细胞为标准DNA（3.22pg/2C）测定了长江白鲟、达氏鲟、中华鲟、史氏鲟和北美匙吻鲟的体细胞基因组大小（DNA含量）。结果表明,上述五种鲟鱼DNA含量分别为4.11、8.26、9.07、6.07和3.96pg。长江白鲟和北美匙吻鲟均属于四倍体鱼类,分布在长江水系的中华鲟和达氏鲟两种鲟属鱼类为八倍体类型。史氏鲟初步判断为八倍体,据分析可能存在四倍体的类型。根据所得到的结果并结合已发表的DNA含量和染色体资料,分析了鲟形目鱼类在细胞遗传上的进化特点。鲟形目鱼类全为多倍体起源的鱼类,在鲟形目的两科（白鲟科和鲟科）六个属中,除鲟属外,其他五个属均为四倍体,而鲟属已发现有四倍体、八倍体、十二倍体和十六倍体。说明在细胞水平的染色体加倍与鲟形目鱼类各科、属分化没有直接联系,只在鲟形目形成的早期和鲟形目形成后的鲟属种间分化中扮演着重要角色。鲟属鱼类的染色体剧烈分化可能是造成现今鲟属种类数最多（占整个鲟形目鱼类的65%以上）的重要原因。