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鸡肠道微生物菌群经PCR-DGGE分析,回收PCR-DGGE分析胶上的一条DNA片段,回收的DNA片段再重复进行2次PCR-DGGE分析,以及分别用PCR反复循环扩增和PCR高保真酶扩增后再进行DGGE分析等方法研究PCR-DGGE分析中多条带产生原因。结果显示PCR-DGGE分析中多条带产生原因可能是作PCR扩增模板的DNA混杂有少量其他DNA片段,多条带现象不易被消除。DGGE分析胶上的DNA片段测序时,将该DNA片段回收、PCR扩增后克隆,提取多个阳性克隆菌的质粒DNA片段,分别与其原目的DNA片段进行DGGE分析,在DGGE分析胶上选取与原目的DNA片段处于同一电泳位置的质粒DNA测序,提高测序的准确性。 相似文献
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《生命科学研究》2015,(4):299-302
介绍一种从琼脂糖凝胶同步回收DNA和琼脂糖的方法。利用0.25 mol/L异硫氰酸胍溶液(p H 8.0)溶解含有目的 DNA片段的的凝胶条,胶条溶解后,静置冰上10 min再加入预冷的异丙醇,琼脂糖呈颗粒状析出,通过离心即可初步分离DNA和琼脂糖。上清液用异丙醇沉淀回收DNA片段,利用50%PEG溶液沉淀琼脂糖。分别对0.2 kb、1 kb和10 kb长度的DNA片段进行回收,回收率分别为19.44%、36.40%、13.49%,回收的DNA纯度高,电泳条带清晰。琼脂糖均回收率为62.52%,回收琼脂糖脱水后的状态为白色颗粒。该方法切实可行,回收成本低廉,回收的DNA和琼脂糖可用于后续实验。 相似文献
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碳酸钙沉淀法回收琼脂糖凝胶中DNA的探讨 总被引:5,自引:2,他引:3
采用碳酸钙沉淀法回收琼脂糖凝胶中的DNA,达到分离纯化目的,回收后的DNA可用于重组、PCR等研究。首先将含有目的DNA的琼脂糖凝胶用Nal溶液融解,然后加入cacl2,和NaHCO3,生成CaCO3,沉淀,DNA与cac03形成复合物,通过离心分离出沉淀复合物,利用稀酸溶解沉淀,再用无水乙醇沉降,即可回收目标DNA。利用该方法回收了质粒、毛白杨和转基因羊基因组DNA,同收率为20%~50%,0D260/OD280,为1.7~19,最大回收了21kb片段,最小回收250bp片段,回收后的DNA样品进行了PCR扩增和限制性内切酶反应,PCR可以扩增出目的片段,同时限制性内切酶可以将回收后的DNA切开,表明DNA质量良好。利用碳酸钙沉淀法可以回收琼脂糖凝胶中的DNA,此法简单、易行,较为有效。 相似文献
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从凝胶中分离DNA或DNA片断是基因工程中常用的手段.在重组DNA、分子杂交、基因诊断等实验中,经常需要从凝胶中分离并回收核酸或核酸片断.目前分离DNA片断的方法很多.常用的如电洗脱法、冻融法等操作烦琐且得率较低;低融点琼(王旨)糖法得率较高,但价格昂贵,特别是回收的DNA片断常混有细小琼(王旨)糖颗粒,影响以后的酶切、连接等.我们摸索了一种简便方法,能够从琼(王旨)糖凝胶中高纯度、高得率地分离核酸或核酸片断,回收所得的DNA片断可以直接用于各种酶切反应和基因重组实验.现以分离P~(ZB24)重组质粒中2.3kb的大R蠖核多角体基因片断为例,说明如下: 相似文献
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琼脂糖凝胶电泳对于快速分离不同分子量的DNA片段是极为有效的,但把DNA片段从凝胶中回收回来有时要碰到一些困难,如回收的DNA易受凝胶中硫酸多糖的污染(该成分是许多酶的抑制剂,如内切酶、连接酶、激酶、聚合酶等);大片段DNA回收 相似文献
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PCR特异产物回收纯化方法的比较 总被引:1,自引:1,他引:0
方法:采用三种方法对苹果褪绿叶斑病毒RT-PCR的特异DNA产物进行回收纯化。目的:针对不同情况,选择适宜的回收纯化方法。结果:用普通琼脂糖替代低融点琼脂糖,回收纯化后产物的浓度及纯度与低融点琼脂糖法基本一致,完全可以用普通琼脂糖替代低融点琼脂糖进行DNA片段的回收纯化,从而降低成本,简化操作。玻璃奶法的回收纯度明显高于低融点琼脂糖法和普通琼脂糖法,且更快速安全,是采用普通琼脂糖法还是采用玻璃奶法回收纯化DAN片段应以实际需要而定。 相似文献
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《生物技术通报》2020,(7)
外源DNA插入片段为40 kb左右的Fosmid文库在基因组学研究中有广泛的应用,但长期以来,40 kb外源片段的分离与纯化依赖于传统的切胶并电洗脱至透析袋的方法,难以得到足够量的DNA片段,极大降低Fosmid文库构建的成功率。通过改进全自动核酸/蛋白质回收系统SageELF的操作流程,建立一种简单、便捷、高效地回收40 kb左右DNA片段的方法,并用其成功地构建高质量的Fosmid文库。从文库中随机挑选的25个单克隆,经过测序及酶切分析,发现该文库中插入的DNA片段大小为37.9±5.2 kb。以上结果表明,利用改良的操作方法回收40 kb基因组DNA,操作简捷、高效,片段大小精准;另外,用该DNA片段构建的Fosmid文库,插入片段比较集中,有利于后续的基因组学分析。 相似文献
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胸腺肽基因多元植物表达载体的构建 总被引:2,自引:0,他引:2
Gus基因是最为常用的报告基因之一,为了便于对胸腺肽目的基因进行检测,在该研究中,胸腺肽目的基因、PRIB分泌基因和GUS报告基因DNA片段用DNA纯化回收试剂盒回收,然后用T4 DNA连接酶连接,构建成几个基因相融合的多元植物表达载体,并通过酶切进行鉴定。用基因枪转化法对胡萝卜愈伤组织进行了遗传转化,转化的胡萝卜愈伤组织经Southern杂交检测和X-Gluc染色,结果表明,多元表达载体成功地被导入胡萝卜愈伤组织。 相似文献
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一种有效回收短片段PCR产物的方法 总被引:3,自引:1,他引:2
目的:为了有效地回收小于200bp的短片段PCR产物。方法:研究了在-20℃条件下,用无水乙醇和3mol/l醋酸钠共沉淀短片段的PCR产物的方法。结果和结论:用这种共沉淀PCR产物的方法,它能够有效地回收小于200bp以下的DNA片段,并且回收到的片段能够有效的进行酶切反应和T-载体连接反应。这种方法也能够回收酶切后的短DNA片段,并对后来的连接反应没有影响。这种共沉淀回收短片段DNA方法相对于其他方法来不仅具有可行性,而且有经济和操作简单的优点。 相似文献
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从琼脂糖凝胶中回收 DNA片段是重组 DNA实验中经常需要进行的操作。这里介绍一种用自制的微型电泳槽电泳回收 DNA片段的方法。取 4块各长 1cm,宽 0 .5cm,厚 2 mm的聚乙烯条板 ,用氯仿将它们粘合到一块长 2 cm,宽 1cm的聚乙烯板中央 ,制成一四周密闭的小槽。在相对的两块挡板内侧底边各置一条铂金丝 ,两端用蜡固定。两条铂金丝在相对的两角都向上延伸至顶部并翻出 ,用蜡固定在挡板外侧。这样就制成了一个微型电泳槽。铂金丝外露部分可用带导线的夹子与电泳仪相联 ,通电后可进行潜水电泳。DNA样品按常规的琼脂糖凝胶电泳分离后 ,用 EB染… 相似文献
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限制性核酸内切酶EcoRl酶切枯草芽孢杆菌(Bactllus subtlis) SR 22的 DNA,用琼脂糖凝胶电泳分离了色氨酸C基因(trpC)的片段,位于凝肢柱的10—11厘米处。冷冻挤压回收该段的DNA,荧电光分光光度计直接测定回收液中DNA的含量。电泳后比电泳前trpC 转化活性提高了37.7倍。这一段DNA的平均分子量为5.1×106,trpC片段的纯度为9.3%。 相似文献
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用普通琼脂糖代替低熔点胶回收DNA片段 总被引:6,自引:0,他引:6
为了建立一种直接从普通琼脂糖凝胶中回收DNA片段的简便实用的方法,采用聚合酶链式反应扩增人P53基因外显子7、8和其间的内含子7序列,用普通琼脂糖凝胶电泳,直接从凝胶中切下产物带,用加热熔化法回收DNA;紫外比色法测定回收率;用测序法鉴定回收产物质量。并用QIAquick Spin纯化柱对照。结果表明,本法回收的产物质量明显优于用QIAquick Spin柱回收,本法回收的产物用于测序效果极佳,回收率达80%,用QIAquick Spin柱回收率不到20%,差异非常显著(P<0.01)。证明这种方法回收PCR产物质量可靠,能代替低熔点胶回收DNA,有较大的实用价值。
Abstract: In order to find a simple and efficient method to isolate single or double?strand DNA fragment amplified by polymerase chain reaction (PCR),we used PCR method to amplify exon 7,exon 8 and intron 7 of human P53 gene, electrophoresis to identify products,fusion and phenol-chlorofom extraction (FPC) to isolate specific DNA from agarose gel,ultraviolet colorimetry to deteminate collected rate,and direct sequencing to identify the quality of recollected DNA. A control test was also made by using QIAquick Spin Colum.The results showed that the quality of PCR products recollected by using FPC method was very good.When the recollected DNA was used in sequencing,no matter what was single or double-strand DNA,the sequence data was clear and even,with low noise.The recollected rate of using FPC,which was over 80 per cent, was higher than that of using colum (lessthan 20 per cent), there were statistical significances (P<0.01).In the control test, it had a little non-specific DNA in the collected products,and the sequencing experiment of using double-strand products was failure.All above mentioned suggested that general agarose gelis efficient in place of low melting-temperature for isolating DNA fragment. 相似文献
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以紫茎泽兰暗培养幼嫩叶片为材料,在细胞核提取缓冲液中加入PVP、抗坏血酸和氨基甲酸钠3种强抗氧化剂,较好地去除了多糖多酚等次生代谢物,经低熔点琼脂糖包埋细胞核及蛋白酶K原位裂解DNA胶块,以获得大分子量DNA;最后分别采用2种不同的限制性内切酶(BamH Ⅰ和HindⅢ)和5个浓度梯度(0 U、0.2U、0.4U、0.6U、0.8 U)进行酶切,并对不同的回收方法进行比较分析.结果表明:经脉冲电泳检测,本方法提取的DNA片段长度>600 kb,基本无细胞器DNA和蛋白质污染;酶切条件以0.4U酶浓度HindⅢ的效果最好,酶切后的DNA片段主要集中在100~300 kb之间,DNA片段大小满足构建BAC文库的要求;对回收方法进行比较分析,电洗脱法回收的大片段DNA浓度远远大于琼脂糖酶切法,大于8mg·L-1,这完全能够满足构建大片段基因组文库对DNA浓度的要求. 相似文献