微生物多样性保护与病原微生物资源保藏

本文从微生物物种的多样性保护以及病原微生物资源的保藏等方面详细阐述了微生物资源保护与保藏的相互关系与重要性,介绍了微生物多样性保护及其研究进展和意义,病原微生物保藏的概述、资源的收集与共享,以及保藏机构相关信息。     

推进国家微生物资源平台建设,支撑微生物学科发展——“第七届全国微生物资源学术暨国际微生物系统与分类学研讨会”专刊序言

微生物资源是国家战略性生物资源之一,是支撑微生物学科发展与技术创新的重要基础。中国作为微生物资源的大国,近年来,通过"国家微生物资源平台"项目的建设,在微生物资源的分离、收集、保藏与共享等方面都取得了较大的发展。在我国微生物资源科技工作者的共同努力下,微生物新种的分离与发表也跃居世界首位。《微生物学通报》组织了本期"微生物资源"主题刊,旨在展示微生物资源学领域的最新进展,加强微生物资源学领域学术交流,提升我国微生物资源分类和系统学研究水平,促进微生物资源学科发展,推进国家微生物资源平台建设。     

中国微生物资源研究现状及未来发展态势分析

[目的]微生物资源由于其对于生命科学基础研究和生物经济的重要价值,一直是全球生物技术竞争的战略重点。中国目前已经成为在生命科学研究领域最有影响力的国家之一,每年发表的论文数量居全球第二位。通过微生物资源的保藏和利用的分析能够一定程度反映我国微生物研究的整体状况和进展,并进一步反映生命科学研究和生物产业的发展趋势。[方法]本文通过分析我国微生物资源保藏、文献、专利等数据,阐述了我国微生物资源的保藏和利用现状,并同相关国家进行了比较,基于此分析,为我国微生物资源挖掘与利用提供战略方向和建议。[结论]近年来,我国建立了微生物资源国家平台,每年发表论文数量居全球第二位,申请和授权专利数量居全球第一位,充分反映了我国微生物资源研究及其在生物产业的应用现状。我国正在形成一个微生物资源保藏、研究和应用的完整体系,为我国乃至全球的生物经济的发展提供支撑。     

我国海洋微生物菌种资源保藏与共享服务现状

海洋微生物多样性丰富。我国近年来在海洋微生物多样性调查、资源获取与开发利用等多方面取得重要进展。为促进资源的可持续高效利用,建立了专业的海洋微生物菌种保藏中心,目前库藏海洋微生物菌种2. 2万株。本文介绍了目前中国海洋微生物菌种保藏管理中心库藏资源概况与共享利用情况,以共享记录为基础,从已共享菌株的多样性、库藏资源共享利用以及共享用户等方面开展了统计分析。统计结果显示,共享菌株中超过80%为细菌,其次依次为丝状真菌、酵母、古菌及噬菌体。在菌株水平,已共享细菌覆盖了库藏细菌的28%;在种的水平,已共享细菌覆盖了库藏细菌的47%,包括变形菌纲3 178株,芽胞杆菌纲951株,放线菌纲817株。目前,库藏资源总共享比例约为30%,覆盖了库藏57%的属和49%的种。共享用户目前达266家,其中国内用户244家,国外用户22家。为大洋课题、国家973课题、863课题、自然基金、行业公益性项目、科技支撑及企业项目等各种科技计划,提供了重要的菌种资源保障。据不完全统计,共支撑发表SCI论文达500余篇。中国海洋微生物菌种保藏管理中心在菌株资源的收集、整理和共享等方面,为我国的科研事业提供了大量的资源支撑,取得了较好的社会效益。     

辽宁省微生物菌种保藏中心

<正>简介辽宁省微生物菌种保藏中心是2005年经辽宁省科技厅批准、依托辽宁省微生物科学研究,院组建的东北三省唯一的微生物菌种专业保藏管理机构,主要从事微生物菌种资源分离、收集、鉴定、评价,优良菌种选育、保藏、供应及对外交流开展微生物菌种保藏与应用技术研究。本中心拥有完备的菌种保藏管理设施,拥有可容纳50000株菌种的低温保藏库和可保藏     

微生物资源：发掘、利用、展望与挑战

微生物资源是国家战略性生物资源,是支撑微生物学科发展与技术创新的重要基础。可直接开发为食品原料或用以酿造生产,也可作为服务农牧业生产菌剂产品或用于生产医疗药品和清洁能源,已经在工业、农业、食品、酿造、医药、能源及环境等领域得到广泛应用。近年来,随着生物技术及分子生物学等研究的发展,在微生物资源的分离、评价、保藏等方面都取得了较大进展。《微生物学通报》组织了本期“微生物资源：发掘、利用、展望与挑战”专栏,旨在展示微生物资源学领域的最新进展,加强微生物种质资源的发掘、利用,助力微生物资源学科和科技创新战略发展。     

黑龙江省菌种保藏中心

黑龙江省菌种保藏中心成立于1984年,前身是黑龙江省科学院微生物研究所菌种保藏研究室（成立于1971年）。从事微生物种质资源收集、分离、鉴定、保藏及相关应用研究。设有普通微生物茼种库和专业微生物菌种库,保藏有各类微生物种质5000余株,遗传物质、代谢产物近千份,涵盖了农业、医药、食品与发酵、环保、林业等行业。保藏种类包括食药用真菌、铜绿假单胞菌、大豆根瘤菌、小型丝状真菌、放线菌、枯草芽孢杆菌等,为黑龙江省内最大的公益性专业菌种保藏机构。中心具备完善的工作流程和科学管理制度,人才队伍齐备,技术手段先进,开展微生物种质资源保藏、鉴定及生物学评价等工作,可满足保藏微生物资源的安全性、溯源性和便捷性等要求。     

黑龙江省菌种保藏中心

黑龙江省菌种保藏中心成立于1984年,前身是黑龙江省科学院微生物研究所茵种保藏研究室（成立于1971年）。从事微生物种质资源收集、分离、鉴定、保藏及相关应用研究。设有普通微生物菌种库和专业微生物菌种库,保藏有各类微生物种质5000余株,遗传物质、代谢产物近千份,涵盖了农业、医药、食品与发酵、环保、林业等行业。保藏种类包括食药用真菌、铜绿假单胞菌、大豆根瘤茵、小型丝状真菌、放线菌、枯草芽孢杆菌等,为黑龙江省内最大的公益性专业菌种保藏机构。中心具备完善的工作流程和科学管理制度,人才队伍齐备,技术手段先进,开展微生物种质资源保藏、鉴定及生物学评价等工作,可满足保藏微生物资源的安全性、溯源性和便捷性等要求。     

微生物资源的保护

对保护微生物资源的必要性 ,重要性以及保护微生物资源的措施进行了简要综述     

我国海洋细菌新物种鉴定与资源研发进展

近年来国际上对海洋微生物资源的发掘方兴未艾。本文综述了2000年以来我国在海洋细菌新物种鉴定与资源研发方面的进展,统计分析了国内相关单位海洋细菌新物种鉴定发表的数量及多样性,介绍了国内相关科研机构在海洋细菌系统学方面的工作进展,以及国内海洋微生物资源保藏与开发现状。比较了世界范围内海洋细菌系统学研究进展,并探讨了海洋细菌分离培养的主要方法,最后小结了我国海洋细菌资源研究领域存在的问题及未来发展的前景,为其进一步研发利用提供参考。     

微生物絮凝剂概况及发展前景

微生物絮凝剂作为一种高效、安全、无毒和无二次污染的天然高分子絮凝剂已备受关注.介绍了微生物絮凝剂的研发背景及历史,对微生物絮凝剂的特性、分类、机理以及应用现状作了分析,并指出了其发展方向.     

Risk Assessment,Microbial Communities,and Pollution-Induced Community Tolerance

Until recently, parameters from microorganisms were generally not included in risk assessment at a comparable level to animals and plants. However, the major part of global biomass, biodiversity, and ecosystem processes is present in the microbial world and microbiological techniques applicable to risk assessment are becoming available. Two microbial indicators are described based on the usage of multiwell plates with different substrates and a redox indicator for monitoring mineralisation. With both techniques autochthonous microbial communities are analysed. Producing functional fingerprints of the microbial community gives insights into the composition of different functions. This is equivalent to observations of ecological abundance and species composition. When lack of reference sites or reference data renders risk assessment difficult, measurement of the pollution-induced community tolerance (PICT) can provide useful information.     

Microbial diversity: the importance of exploration and conservation

Microbial diversity is fundamental to maintenance and conservation of global genetic resources. As extreme environments are explored, the richness of microbial diversity is increasingly evident. Measures must be taken to estimate, record, and conserve microbial diversity, not only to sustain human health but also to enrich the human condition globally through wise use and conservation of genetic resources of the microbial world. Received 24 April 1996/ Accepted in revised form 07 January 1997     

木质纤维素的微生物降解

木质纤维素广泛存在于自然界中,因结构复杂,其高效降解需要多种微生物的协同互作,由于参与木质纤维素降解的微生物种类繁多,其协同降解机理尚不完全明确。随着微生物分子生物学和组学技术的快速发展,将为微生物协同降解木质纤维素机制的研究提供新的方法和思路。笔者前期研究发现,细菌复合菌系在50℃下表现出强大的木质纤维素降解能力,菌系由可分离培养和暂时不可分离培养细菌组成,但是可分离培养细菌没有降解能力。通过宏基因组和宏转录组研究表明,与木质纤维素降解相关的某些基因表达量发生显著变化,通过组学方法有可能更加深入解释微生物协同降解木质纤维素的微生物学和酶学机理。文中从酶、纯培养菌株和复合菌群三个方面综述了木质纤维素微生物降解研究进展,着重介绍了组学技术在解析复合菌群作用机理方面的现状和应用前景,以期为探索微生物群落协同降解木质纤维素的机理提供借鉴。     

rRNA技术及其在分子微生物生态上的应用

传统的基于微生物培养与纯种分离的技术所具有的局限性,以及分子生物学及其有关技术的长足进展,使微生物生态学的研究进入了分子的阶段.其中rRNA技术的建立、发展及其成功应用,为分子微生物生态和微生物系统分类学的研究掀开了崭新的一页.对rRNA分子技术的研究进展、以之为基础的主要方法及其在环境微生物研究中的应用,以及应用过程中所存在的一些潜在问题及其解决办法等作了详细综述.     

微生物发酵生产辅酶Q10的研究进展

利用微生物发酵生产辅酶Q1 0 产物活性好 ,并可通过规模放大提高生产能力 ,因而颇受国内外学者的关注。文章综述菌种的选择和遗传改造 ,发酵条件的优化及其分离纯化     

施用微生物制剂对育蚌水体微生物区系的影响

研究了育蚌水体分别施用微生物制剂利水素与鱼虾菌乐后水样中微生物区系的变化。试验结果表明:施用利水素的水样革兰氏阴性杆菌和嗜水气单胞菌含量分别下降26.67%、20%,芽胞杆菌和表皮葡萄球菌含量分别上升13.33%、26.67%;施用鱼虾菌乐的水样革兰阴性杆菌和嗜水气单胞菌含量分别下降20%、13.33%,芽胞杆菌和表皮葡萄球菌含量分别上升6.67%、13.33%;未施用微生物制剂的水样革兰阴性杆菌和嗜水气单胞菌含量均上升13.33%,芽胞杆菌消失,新增肠杆菌和链球菌。施用微生物制剂利水素和鱼虾菌乐,可有效优化养殖水体微生物种群结构,改良养殖水质环境。     

菌肥的作用研究及其资源开发

论述了菌肥对作物及土壤的作用 ,分别归纳了菌肥中自生性肥料、共生性肥料、抗生性肥料各自的作用 ,以及菌肥资源的开发现状及前景     

Microbial ecology in the age of genomics and metagenomics: concepts, tools, and recent advances

Microbial ecology examines the diversity and activity of micro-organisms in Earth's biosphere. In the last 20 years, the application of genomics tools have revolutionized microbial ecological studies and drastically expanded our view on the previously underappreciated microbial world. This review first introduces the basic concepts in microbial ecology and the main genomics methods that have been used to examine natural microbial populations and communities. In the ensuing three specific sections, the applications of the genomics in microbial ecological research are highlighted. The first describes the widespread application of multilocus sequence typing and representational difference analysis in studying genetic variation within microbial species. Such investigations have identified that migration, horizontal gene transfer and recombination are common in natural microbial populations and that microbial strains can be highly variable in genome size and gene content. The second section highlights and summarizes the use of four specific genomics methods (phylogenetic analysis of ribosomal RNA, DNA-DNA re-association kinetics, metagenomics, and micro-arrays) in analysing the diversity and potential activity of microbial populations and communities from a variety of terrestrial and aquatic environments. Such analyses have identified many unexpected phylogenetic lineages in viruses, bacteria, archaea, and microbial eukaryotes. Functional analyses of environmental DNA also revealed highly prevalent, but previously unknown, metabolic processes in natural microbial communities. In the third section, the ecological implications of sequenced microbial genomes are briefly discussed. Comparative analyses of prokaryotic genomic sequences suggest the importance of ecology in determining microbial genome size and gene content. The significant variability in genome size and gene content among strains and species of prokaryotes indicate the highly fluid nature of prokaryotic genomes, a result consistent with those from multilocus sequence typing and representational difference analyses. The integration of various levels of ecological analyses coupled to the application and further development of high throughput technologies are accelerating the pace of discovery in microbial ecology.     

Transporter Engineering for Microbial Manufacturing

Microbes play an important role in biotransformation and biosynthesis of biofuels, natural products, and polymers. Therefore, microbial manufacturing has been widely used in medicine, industry, and agriculture. However, common strategies including enzyme engineering, pathway optimization, and host engineering are generally inadequate to obtain an efficient microbial production system. Transporter engineering provides an alternative strategy to promote the transmembrane transfer of substrates, intermediates, and final products in microbial cells and thus enhances production by alleviating feedback inhibition and cytotoxicity caused by final products. According to the current studies in transport engineering, native transporters usually have low expression and poor transportation ability, resulting in inefficient transport processes and microbial production. In this review, current approaches for transporter mining, characterization, and verification are comprehensively summarized. Practical approaches to enhance the transport system in engineered cells, such as balancing transporter overexpression and cell growth, and evolution of native transporters are discussed. Furthermore, the applications of transporter engineering in microbial manufacturing, including enhancement of substrate utilization, concentration of metabolic flux to the target pathway, and acceleration of efflux and recovery of products, demonstrate its outstanding advantages and promising prospects.