香鱼精氨酸酶Ⅱ基因的cDNA克隆及其表达与鳗弧菌感染的相关性

精氨酸酶II(arginase II,Arg-II)是精氨酸酶的一种,不仅可以参与机体尿素循环,还与机体病理过程密切相关。通过香鱼(Plecoglossus altivelis)单核/巨噬细胞转录组测序获得香鱼Arg-II基因全长c DNA序列,结果表明,Arg-II基因由4 707个核苷酸组成,包含一个大的开放阅读框,编码348个氨基酸,预测分子量为38.09 k D,等电点为6.15。氨基酸序列多重比对结果显示,香鱼Arg-Ⅱ具有典型的Arg-Ⅱ结构特征,与虹鳟(Oncorhynchus mykiss)Arg-Ⅱ同源性最高,为85.3%;系统进化树分析表明,鱼类Arg-Ⅱ形成一个大簇,香鱼Arg-Ⅱ与虹鳟Arg-Ⅱ进行相关性最高。实时荧光定量PCR(quantitive real-time PCR,q RTPCR)结果显示,香鱼Arg-Ⅱ基因m RNA主要在健康香鱼肝、脑、头肾和单核/巨噬细胞中表达;鳗弧菌(Vibrio anguillarum)感染后,香鱼肝、脑、头肾和单核/巨噬细胞Arg-Ⅱ基因m RNA的表达量显著上调。综上,香鱼Arg-Ⅱ基因的表达与鳗弧菌感染紧密相关,揭示其可能在鱼类抗感染免疫应答中发挥重要作用。     

香鱼镉胁迫相关基因UraD的特征和表达分析

2-氧-4-羟基-4-羧基-5-脲基咪唑啉脱羧酶(UraD)是嘌呤代谢反应酶,目前鱼类UraD基因仅在斑马鱼等少数物种得到克隆分析。从香鱼克隆获得UraD的cDNA序列,全长为967 bp,编码一个由174 aa组成的分子量为19.6kDa的蛋白,等电点为5.42。系统进化树分析显示香鱼UraD位于鱼类UraD簇中,与爬行类和哺乳类的亲缘关系较远,香鱼与斑马鱼UraD的蛋白序列相似性最高达70%。香鱼UraD表达经过反转录PCR(RT-PCR)检测发现在香鱼肝、心和肠中具有较高表达。香鱼肝组织中UraD表达量经过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测,发现镉胁迫下显著减少,香鱼UraD表达在盐度胁迫和鳗利斯顿氏菌感染下表达量保持不变。上述结果揭示香鱼UraD基因的基本特征,说明香鱼UraD基因表达与镉胁迫密切相关。     

我国渤海沿岸的香鱼

香鱼Plecoglossus altivelis Temminck et Schlegel属鲱形目,鲑鳟亚目,香鱼科,香鱼属,在辽东半岛称“秋生子”,渤海西岸称“海胎鱼”(图1)。 体细长而侧扁,全身被小圆鳞。背鳍一个,无硬刺,鳍条3,9,后方有一个小脂鳍,臀鳍2,14,尾叉形。口大,吻下垂,坚实而厚。幼鱼时上下颌皆具犬齿,等到     

陆封型和洄游型香鱼体肾组织的蛋白质组学分析

香鱼（Plecoglossusaltivelis）是典型的降海洄游鱼类,由于地理原因,一些香鱼在繁殖季无法回到海中产卵,形成陆封型香鱼。陆封型和洄游型香鱼相比,其体型明显偏小。鱼类的体肾组织可以调控渗透压,从而影响生长,因此我们采用蛋白质组学的方法研究陆封型和洄游型香鱼体肾组织蛋白质组的差异。双向电泳（2一DE）分析筛选到25个差异表达蛋白点,质谱分析成功鉴定出21个蛋白。与洄游型香鱼相比,陆封型香鱼体肾组织中NADH脱氢酶、异柠檬酸脱氢酶、Or．．微管蛋白、热适应相关蛋白65（Wap65）、热休克蛋白60（HSP60）、丙酮酸脱氢酶（E1）、碳酸酐酶、烯醇酶和乳酸脱氢酶表达量较高。同时陆封型香鱼的B一肌动蛋白、铁蛋白、氨基酰化酶、甲硫氨酸腺苷转移酶、过氧化物酶、丙氨酸乙醛酸转移酶和磷酸烯醇丙酮酸羧激酶则表达量较低。它们主要参与能量代谢、应激反应、氨基酸代谢等过程。由于wap65、HSP60和E13种蛋白在蛋白质组学结果中表达改变,且与应激和能量代谢有关,可能影响鱼类生长,因此采用荧光定量PCR（RT—PCR）验证陆封型和洄游型香鱼体肾wap65、HSP60和E1基因mR-NA表达差异,结果表明这3个基因mRNA表达均在陆封型香鱼体肾中较高,与蛋白质组学结果一致。综上,陆封型香鱼的几个糖酵解相关酶和应激蛋白表达量比洄游型香鱼高,而蛋白代谢相关酶表达量较低,揭示陆封型和洄游型香鱼在环境应激和能量代谢等层面有明显的差异。     

香鱼hepcidin基因的克隆、序列分析及组织表达特征

Hepcidin是一类富含半胱氨酸的抗菌肽,在鱼类非特异性免疫中起重要作用,具有调节铁代谢的功能。该研究克隆了香鱼hepcidin基因cDNA序列,全长763个核苷酸,包含一个完整的开放阅读框,推测编码一个由85个氨基酸组成的相对分子质量为9.7k的多肽,N端24个氨基酸是信号肽序列。香鱼hepcidin的成熟肽序列由25个氨基酸组成,含有8个半胱氨酸,可形成4个分子内二硫键结构。系统进化树分析表明,hepcidin的物种进化关系与目前接受的物种分类关系基本一致,香鱼hepcidin位于鱼类hepcidin簇中,与大西洋鲑hepcidin的亲缘关系最近,达60%。香鱼hepcidin在肝脏中表达量最大,在脾、肾、心脏和肌肉中也有表达。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明,鳗利斯顿氏菌(Listonella anguillarum)感染以后香鱼肝组织中hepcidin基因mRNA表达量显著增加,在12h增加了8.26倍。hepcidin基因可能在香鱼抗外界病原物感染过程中起重要作用。     

梵净山及邻近地区鱼类资源的现状

为了了解梵净山及邻近地区鱼类资源的现状及变化趋势,2001–2003年对这一地区乌江水系和沅江水系鱼类进行了系统的调查。本调查设立了19个调查点,共采集鱼类标本3614号,经鉴定为85种(亚种),分属5目14科61属。除胡子鲇(Clariasfuscus)为外来种外,其他均为土著鱼类。海南拟餐(PseudohemiculterHainanensis)、峨眉后平鳅(Metahomalopteraomeiensisomeiensis)和福建纹胸鱼兆(Glyptothoraxfukiensisfukiensis)为本地区土著鱼类新记录种。鱼类组成以鲤形目鲤科为主体,并以适应急流生活的鱼类占多数,小型野杂鱼类所占比例较高。乌江水系和沅江水系鱼类物种组成存在差异,分别属于长江上游鱼类区系成分和长江中下游区系成分。结果还表明这一地区土著鱼类物种数呈下降趋势,其中鲤形目鱼类物种数减少较多。导致该地区土著鱼类物种数下降的原因是酷渔滥捕和水域生境的破坏。     

香鱼半乳糖凝集素3基因的克隆、鉴定和功能初探

半乳糖凝集素3(galectin-3,Gal3)是凝集素的一类,在哺乳动物非特异性免疫中具有重要作用,但在鱼类中尚未见研究报道。该研究通过香鱼(Plecoglossus altivelis)单核/巨噬细胞转录组测序获得Gal3(Pa Gal3)的c DNA序列,全长2 009个核苷酸,包含一个完整的开放阅读框,推测其编码一个由380个氨基酸组成、相对分子质量为38.28 k Da的蛋白,等电点为4.58,N-末端无信号肽。多重序列比对表明,Pa Gal3具有Galectin(Gal)家族成员典型的结构特征。系统进化树揭示,各物种Gal3的进化关系符合目前广泛认可的动物分类关系,Pa Gal3与虹鳟(Oncorhynchus mykiss)Gal3紧密成簇,氨基酸序列同源性达77%。实时荧光定量PCR结果表明,鳗弧菌(Vibrio anguillarum)侵染后,香鱼肝、肾、脾等组织和单核/巨噬细胞中Pa Gal3的m RNA表达量显著上调。Western blot结果表明,Pa Gal3存在于香鱼血清中。抗体封闭Pa Gal3后,香鱼单核/巨噬细胞吞噬细菌能力和杀菌活性均显著下降,揭示Pa Gal3可以增强香鱼单核/巨噬细胞功能。综上,Pa Gal3与鱼类免疫紧密相关,可能在香鱼炎症免疫中具有重要作用。     

多形小克银汉霉、暗孢小克银汉霉和褐孢小克银汉霉应否被接受为独立的种?

多形小克银汉霉(Cunninghamella polymorpha Pisnek)、暗孢小克银汉霉(Cunninghamella phaeospora Boedijn)和褐孢小克银汉霉(Cunninghamella brunnea J.N. Rai,S.C. Agarwal & J.P. Tewari)自分别在1929, 1958, 1968年发表以来,一直存在着不同意见上的争论,或承认或不承认,或合并到这个种或合并到那个种等等.我们在研究中国的小克银汉霉属的过程中,分离得到了九株多形小克银汉霉的菌株。为了确定这个种的分类地位以及澄清它与其他一些相关种的关系,我们将这些菌株与从国外交换获得的一些相关种的模式后代作了比较研究,所得结果表明多形小克银汉霉、暗孢小克银汉霉及褐孢小克银汉霉三种既不能相互合并亦不能合并到其他任何一种中去,而应作为独立的种被人们所接受。在我们的工作之前,这三个种的有性型均未有报道。我们在国内尚未发现暗孢小克银汉霉和褐孢小克银汉霉,只找到了多形小克银汉霉,但同时也找到了它的有性型.因此,多形小克银汉霉为我国的新记录种,其有性型的发现则为全世界的首次报道。多形小克银汉霉的主要区别性特征为孢囊梗主枝形成顶生泡囊或不形成而在顶部叉分为二至数个分枝,同一孢囊梗上的分枝长短不齐,接合孢子囊不正球形,配囊柄细长可达80微米等等.暗孢小克银汉霉的主要区别性特征为孢囊梗分枝很少或不分枝,在同一孢囊梗上分枝相距很远且都很短,泡囊形状多不规则且略呈多角形。褐孢小克银汉霉更易与其他种相区别,它的孢囊梗分枝很多,分枝成堆且指向不同的方向,泡囊典型地呈多角形,内外璧不重合。这三个种首次发表时以及后来经过不同作者重新研究后发表的描述及绘图均过于简单而未能充分显示出它们的区别性特征,因此我们在本文中再次作了描述并再次提供了详尽的线条图和显微照相。     

长江下游发现香鱼的稚鱼

长江靖江江段位于长江最下游,接近河口段。在对这一江段沿岸的鱼类进行调查的过程中,发现在2004年5月11日的渔获物中,有1尾体长70.8mm、体重3．34g的香鱼（Plecoglossus altivelis）稚鱼。这是香鱼在长江流域的首次分布报道。     

香鱼凝血因子X基因表达与鳗利斯顿氏菌感染的相关性

凝血途径的关键因子——凝血因子X(coagulation factor X,FX),是一种与免疫调控密切相关的维生素K依赖型丝氨酸蛋白酶.该研究克隆了香鱼(Plecoglossus altivelis) FX基因全长cDNA序列,它由1817个核苷酸组成,包含一个大的开放阅读框,编码一个由453个氨基酸组成的相对分子质量为5.07×104的蛋白.香鱼FX与已知的哺乳动物FX的结构相似,N端24个残基为信号肽序列.序列比较表明,香鱼FX与斑马鱼FX的氨基酸同一性最高,为53％.在健康香鱼中,FX基因mRNA主要在肝组织中表达,脑和鳃中也有少量表达.实时荧光定量PCR分析揭示,鳗利斯顿氏菌感染后香鱼肝组织中FX基因mRNA表达显著上调,16h时达到5.43倍.通过原核表达系统表达了香鱼FX丝氨酸蛋白酶结构域,并制备了抗血清.Western blotting分析显示,鳗利斯顿氏菌感染后香鱼血清中FX含量显著增加,并随着时间延长上调倍数不断增大,在36h时达到3.68倍.据此,FX基因mRNA及蛋白的表达与鳗利斯顿氏菌感染香鱼的过程紧密相关,揭示它可能在鱼类抗细菌感染的免疫反应中起重要作用.     

(鱼日女)鮡鱼类的系统分类及演化谱系,包括一新属和一新亚种的描述

一、前言 (鱼日女)鮡鱼类(glyptosternoid fishes)是鲇形目鮡科(Sisoridae)中一群鱼类的统称,它们在形态上的共同特征是没有胸吸着器,胸、腹鳍水平展开,第一根鳍条完全分节或在外缘生出许多软骨细条,被外表皮所裹,在腹面看到的是许多与分节或软骨细条大致对应的横纹绉褶,具有附着功能,以适应流水环境。这群鱼类包括8属22种(包括亚种)。因为在     

鱼类标本的剥制方法

鱼类标本的剥制,属于脊椎动物标本制作的一种。在实际工作中,小型鱼类标本多为浸制保存,而大型标本(如鲟形目、鲶形目的鱼类)往往采用剥制的方法保存。文中仅以鲟形目大型鱼类标本剥制的体会作些介绍。     

梁子湖黄颡鱼的繁殖和食性的研究

黄颡魚Pseudobagrus fulvidraco(Richardson)俗名■■,在我国分布较广,是一种小型的经济鱼类。在长江中、下游的湖泊中,数量甚多,有专门的渔具(如螺螄钩)捕捞。如在湖北省梁子湖,一年四季皆可捕到这种鱼,以春、夏两季的产量较高,捕捞的个体一般体长11-19厘米,体重30-100克,最大的个体重达120克。关于黄颡鱼的生活习性,国内过去尚未进行较详细的研究,对这一种淡水鱼类资源的利用意义,未能充分了解,对这一种焦的特殊繁殖习性的观察也是很不够的。此项工作是1956年6月和1957年4月至7月在     

长江上游青衣江支流周公河鱼类资源现状

为了解长江上游青衣江一级支流周公河的鱼类资源现状,于2015年4月—2016年2月对周公河18个采样点进行了5次调查,共采集鱼类4 924尾,隶属于3目8科27属34种。其中,鲤形目Cypriniformes 20属24种,鲇形目Siluriformes 6属8种,鲈形目Perciformes 1属2种;鲤形目中鲤科Cyprinidae鱼类最多,共15种,占总种数的44. 12%。四川省重点保护鱼类有重口裂腹鱼Schizothorax (Racoma) davidi 1种,长江上游特有鱼类9种,列入《中国脊椎动物红色名录》的鱼类有重口裂腹鱼(濒危EN)、齐口裂腹鱼S.(S.) prenanti (易危VU)和白缘Liobagrus marginatus(易危VU)。周公河现有分布的鱼类以小型种类为主,钝吻棒花鱼Abbottina obtusirostris和宽鳍Zacco platypus为优势种。梯级水电开发可能对周公河鱼类资源造成了不利影响。     

洞穴鱼类:概念、多样性及研究进展

洞穴鱼类是淡水鱼类中一个特殊的生态类群,其生活史的自然完成离不开洞穴或地下水环境。洞穴鱼类可分为典型和非典型两种类型,前者具有易辨识的特殊适应性形态结构(如眼消失、身体透明等),后者此类特征不明显。目前世界典型洞穴鱼类共记录有107种,其中鲤形目和鲇形目的种类最多,分别占49.5%和24.3%;在科级水平上以鲤科和爬鳅科最为丰富。东南亚和中南美是洞穴鱼类多样性最高的地区,有着世界上75.0%的典型洞穴鱼类。中国的洞穴鱼类具有物种多样性高、但集中出现在个别类群(如金线鲃属(Sinocyclocheilus)和高原鳅属(Triplophysa))、物种分化强烈、分布范围狭窄、种群数量小等特点。洞穴鱼类学是一门交叉科学,研究涉及系统学、生态学、生理学、保护生物学等众多学科领域,但目前研究仍多围绕演化问题展开。中国洞穴鱼类研究还处于系统分类和区系研究水平,其他有关学科的研究有待开展。     

封面说明:榆社鲴

榆社鲴(Xemocypris Yushensis)属于硬骨鱼类里的鲤形目的鱼类.化石标本长达182mm.鱼的外形较侧扁,胸鳍长位置低,腹鳍小,它与背鳍在鱼的背、腹两侧的起点几乎相对.     

世界自然遗产预选地施秉鱼类物种组成

通过对贵州省中国南方喀斯特第二批世界自然遗产提名预选地施秉县的鱼类物种组成进行调查,共采集到鱼类46种,隶属于7目15科39属,其中鲤形目(Cypriniformes) 有28种,占本次调查的61％.在物种组成上,土著鱼类是该区域河流的主体,有40种,占87％;外来鱼类有6种,约占13％.其中外来入侵物种有食蚊鱼(Gambusia affinis);大银鱼(Protosalanx hyalocroaniah属于人工放养;从人工养殖地逃逸到野外的鱼类有4种,分别为草鱼(Ctenopryngodon idellus)、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、鳙(Aristichthys nobilis)和团头鲂(Megalobrama amblycephala).     

12种鲟形目鱼类mtDNA ND4L-ND4基因的序列变异及其分子系统学

鲟形目鱼类是一类在鱼类乃至脊椎动物进化史上占有很重要地位的古老濒危鱼类 ,长期悬而未决的系统演化关系为世人瞩目 .采用DNA测序技术首次测定了包括中国特有鲟形目鱼类在内的 1 2种鲟形目鱼类的mtDNA ND4L和ND4基因 ( 70 3bp)的序列 ,并进行了分子系统学分析 .从分子系统学的角度得出了如下结论 :( 1 )鳇属可以归并到鲟属 ;( 2 )达氏鲟与中华鲟的亲缘关系最近 ,很有可能为中华鲟的一陆封类型 ;( 3)环太平洋地区的鲟科鱼类可能有共同的起源 ;( 4)ND4L和ND4基因是进行鲟形目鱼类系统演化研究很好的遗传标记 .     

中华鲟、白鲟组织生化成分分析初报

中华鲟(Acipenser sinensis Cray)隶属鲟形目、鲟科,在生态类群中属河海洄游鱼类,主要分布于我国长江,也见于渤海(烟台)、黄河下游、钱塘江、闽江及珠江等水域。白鲟(Psephurus gladius Martens)隶属鲟形目、白鲟科,也是一种河海洄游性鱼类,主要分布在长江水系中,自四川宜宾至江苏崇明,有时见于大型湖泊(如洞庭湖)。       

水利建设对辽东半岛香鱼Plecoglossus altivelis的影响

辽东半岛水利建设造成洄游型香鱼资源下降,并在碧流河水库、转角楼水库形成了陆封型香鱼。陆封型香鱼发生了①个体小型化：体长和体重由洄游型香鱼的２０─２５ｃｍ（平均２２．６ｃｍ）,１５０─２５０ｇ（平均２０４ｇ）,分别下降到１０─１８ｃｍ（平均１３．６ｃｍ）,和１３─７３ｇ（平均３６．５ｇ）。②性状变异：洄游型香鱼体长为体高的３．７─４．７倍,为头长的４．５─５．３倍,而陆封型香鱼体长为体高的４．３─６．５倍,为头长的３．９─４．３倍。③怀卵量减少,产卵期提前：洄游型香鱼怀卵量为１．０─８．５万粒（平均３．１万位）．产卵盛期为９月底至１０月上旬,而陆封型香鱼的怀卵量为０．３２─０．６１万粒（平均０．４０万粒）,产卵盛期为９月上旬至下旬,提前２０ｄ左右。