三种旧大陆狐蝠科蝙蝠舌长度及结构比较

为探讨旧大陆食果和食蜜蝙蝠的食性类型不同是否造成其取食器官舌长度及结构的差异,本研究以2种食果蝙蝠犬蝠（Cynopterus sphinx）和棕果蝠（Rousettus leschenaultii）以及1种食蜜蝙蝠长舌果蝠（Eonycteris spelaea）为研究对象,比较了这3个物种间舌的差异。犬蝠、棕果蝠和长舌果蝠伸入直径为2 cm试管的最大舌长度L1（包括伸入试管的吻部和吻部以外的舌长）,分别为（29.19?0.52）mm、（35.05?0.82）mm、（49.34?1.64）mm;伸出吻端外部的舌长L3分别为（16.25?0.53）mm、（19.25?0.79）mm、（31.88?1.56）mm;与体重转换后的最大舌长度,即转换L1分别为（8.57?0.17）mm/3√g、（7.90?0.27）mm/3√g、（12.41?0.40）mm/3√g;与体重转换后的伸出吻端外部的舌长,即转换L3分别为（4.77?0.16）mm/3√g、（4.34?0.22）mm/3√g、（8.01?0.38）mm/3√g;与体重转换后的解剖舌长分别为（5.56?0.16）mm/3√g、（5.35?0.14）mm/3√g、（6.65?0.38）mm/3√g。此5个参数种间比较均差异显著,食蜜类的长舌果蝠的5个参数均显著长于食果类犬蝠和棕果蝠的。通过比较3种蝙蝠的舌结构发现,长舌果蝠的舌尖尖细且具有毛刷状丝状乳头结构,舌面及两侧凹槽较多;犬蝠和棕果蝠的舌尖钝圆,舌面乳头和凹槽较少而平缓。本文结果表明,旧大陆食蜜蝙蝠与食果蝙蝠在舌长度和舌结构上存在明显差异,可能与捕食行为上的差异有关。     

狐蝠科3种蝙蝠舌长度及结构比较

为探讨旧大陆食果和食蜜蝙蝠的食性类型不同是否造成其取食器官舌长度及结构的差异,本研究以2种食果蝙蝠犬蝠(Cynopterus sphinx)和棕果蝠(Rousettus leschenaultii)以及1种食蜜蝙蝠长舌果蝠(Eonycteris spelaea)为研究对象,比较了这3个物种间舌的差异.犬蝠、棕果蝠和长舌果蝠伸入直径为2 cm试管的最大舌长度L1(包括伸入试管的吻部和吻部以外的舌长)分别为(29.19±0.52)mm、(35.05±0.82) mm、(49.34±1.64) mm;伸出吻端外部的舌长L3分别为(16.25±0.53)mm、(19.25±0.79) mm、(31.88 ± 1.56) mm;与体重转换后的最大舌长度,即转换L1分别为(8.57±0.17) mm/g1/3、(7.90 ±0.27) mm/g1/3、(12.41 ±0.40) mm/g1/3;与体重转换后的伸出吻端外部的舌长,即转换L3分别为(4.77±0.16) mm/g1/3、(4.34±0.22) mm/g1/3、(8.01 ±0.38) mm/g1/3;与体重转换后的解剖舌长分别为(5.56 ±0.16) mm/g1/3、(5.35 ±0.14) mm/g1/3、(6.65±0.38)mm/g1/3.此5个参数种间比较均差异显著,食蜜类的长舌果蝠的5个参数均显著长于食果类犬蝠和棕果蝠的相应参数.通过比较3种蝙蝠的舌结构发现,长舌果蝠的舌尖尖细且具有毛刷状丝状乳头结构,舌面及两侧凹槽较多;犬蝠和棕果蝠的舌尖钝圆,舌面乳头和凹槽较少而平缓.本文结果表明,旧大陆食蜜蝙蝠与食果蝙蝠在舌长度和舌结构上存在明显差异,可能与捕食行为的差异有关.     

栖息洞穴干扰对特有种大卫鼠耳蝠种群数量和基因丰富度的影响

大卫鼠耳蝠(Myotis davidii)为中国特有蝙蝠物种。选用8个微卫星位点,研究并评价了大卫鼠耳蝠种群数量、遗传多样性与其栖息洞穴干扰的关系。结果表明,各微卫星位点遵循HW平衡。在124个个体的8个微卫星位点中共检测到130个等位基因。平均NA、He和Ho分别为16.25、0.71和0.62。单位洞穴长度内大卫鼠耳蝠个体数量和等位基因丰富度随干扰强度增加呈现降低趋势。洞穴单位长度内个体数量则受湿度、干扰强度的显著影响。等位基因丰富度不受个体数量的影响,而受洞穴大小和干扰强度的显著影响。通过对大卫鼠耳蝠栖息洞穴的综合评价,82.35%的栖息洞穴已受到人类活动的影响。此外,种群瓶颈效应事件的出现和洞穴微环境的改变,将进一步影响大卫鼠耳蝠种群及其遗传多样性。因此,建议政府部门及当地群众要尽量缩减对其栖息洞穴的开发规划,减少人为干扰,加强就地保护以有效维持其种群良性发展。     

西双版纳地区犬蝠和棕果蝠食性的初步研究

犬蝠和棕果蝠是西双版纳地区较为常见的两个果蝠物种,大多数时间内它们同域分布,共同利用当地许多野生果实。从2004年6月至12月,我们采用拾遗法、粪便分析法以及种子萌发鉴定法并结合雾网采样对西双版纳地区这两种果蝠的食性进行了初步研究。结果发现犬蝠利用11科18种植物的果实,2科2种植物的叶片;而棕果蝠利用9科12种植物的果实,1科1种植物的叶片。研究发现雨季(6－10月)两种果蝠食物类型在本地区重叠程度较高,它们共同利用的植物类型占记录植物类型总数的65%。在干旱季节(11－12月),棕果蝠避开与犬蝠在食物方面的竞争而去别的地力开拓食物资源。     

微卫星标记在分子生态学中的应用及其位点的分离策略

微卫星DNA作为一种优良的遗传标记在分子生态学领域得到了广泛应用,本文综述了其在分子种群生物学、分子环境遗传学、分子适应等研究领域中的应用情况.微卫星位点的获得是开展各项研究的前提,传统的构建微卫星文库再杂交筛选的方法工作量大、效率低,因而在实践过程中又产生了富集文库法、PIMA法、FIASCO法等新的分离策略.本文对几种微卫星位点分离技术进行介绍并对其进行分析比较,为分子生态学研究过程中微卫星位点筛选方法的选择提供参考.     

黑头酸臭蚁微卫星标记的分离与开发(英文)

【目的】本研究旨在分离黑头酸臭蚁Tapinoma melanocephalum基因组微卫星标记,确定这些微卫星位点的多态性。【方法】使用454 GS-FLX焦磷酸测序技术开发来自中国华南陆地和岛屿的11个黑头酸臭蚁地理种群基因组微卫星位点。从随机设计的100对微卫星引物中筛选出10对引物,用于确定黑头酸臭蚁4个地理种群［东澳岛(DAD)、荷包岛(HBD)、梅州(MZ)和山咀(SJ)］10个微卫星位点的多态性,分析种群遗传多样性和种群分化。【结果】从11个黑头酸臭蚁地理种群基因组中成功开发和分离10对微卫星引物。在DAD, HBD, MZ和SJ 4个地理种群中,10个微卫星位点中7个有高多态性,这10个位点均显著偏离Hardy-Weinberg平衡;每个位点的等位基因数量(A)是3.50~9.00个,每个地理种群每个位点等位基因丰富度(A_R)在1.992~12.938之间。岛屿地理种群(DAD和HBD)的AR和预期杂合度(H_E)与大陆地理种群(MZ和SJ)的相比差异不显著。4个地理种群均显示高水平遗传分化(F_ST=0.15969);HBD和MZ种群与其他配对地理种群相比,遗传分化较高(F_ST=0.185),基因流较低,说明这两个种群基因流被限制。此外,遗传变异来自种群内个体之间。【结论】筛选新的微卫星位点能够为研究黑头酸臭蚁种群结构和繁殖结构提供有效工具,以深入了解其传播机制。     

大熊猫遗传多样性评估的微卫星分型体系优化

微卫星作为重要的分子标记之一,已被证明在大熊猫种群规模评估、亲子鉴定和遗传多样性分析方面是有效的。目前微卫星标记在大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)染色体上物理定位方面的报道较少,而且缺乏微卫星基因分型系统的效能评估以及PCR扩增条件的优化。本研究基于大熊猫基因组参考序列(ASM200744v2),分析了34个大熊猫微卫星位点的染色体定位特征并评价了位点的应用价值。通过优化34个STR-PCR反应体系和扩增程序,结合微卫星的染色体定位数据确定了Ame-μ10标记的较低应用价值以及gpz-6重新筛选引物的必要性。本研究有助于提高基因分型结果的重复性和可靠性,对促进《大熊猫种群遗传档案建立技术规程》规范化应用和制定大熊猫保护策略具有重要意义。     

微卫星标记在种群生物学研究中的应用

微卫星是以几个碱基 (一般为 1～ 6个 )为重复单位组成的简单的串联重复序列 ,具有丰度高、多态性高、共显性标记、选择中性、可自动检测等优点。本文着重介绍了微卫星在种群生物学研究中的应用。微卫星位点可以提供具高分辨率的遗传信息 ,这一特点使微卫星既适合于个体水平上的研究 ,又适合于种群水平上的研究。在个体水平上包括个体识别、交配系统和亲本分析、基因流等研究。微卫星是常用的个体识别手段 ,但在克隆植物遗传结构研究方面的应用还很有限 ;微卫星提高了交配系统和亲本分析、基因流等研究的准确性。在种群水平上微卫星可用于遗传结构、有效种群大小、种群的系统发育重建等研究。微卫星在很多物种 (包括珍稀物种 )的遗传结构研究中得到应用 ;利用微卫星标记确定有效种群大小、检测有效种群大小的波动可以促使我们正确理解种群遗传结构动态和种群进化过程 ;微卫星在种群的系统发育重建研究方面有很大的应用潜力。然而微卫星并不是研究所有问题的唯一选择。文中还讨论了在实际工作中应如何正确利用分子标记等问题     

天麻基因组微卫星特征分析与分子标记开发

该研究基于第二代测序技术建立了天麻的基因文库,筛选微卫星序列,并对微卫星位点的类型、丰度、长度、偏好性等进行了分析与比较;并为60条重复次数高的微卫星序列设计了引物,运用4个种群80个样本进行了PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。结果表明:(1)天麻基因组测序得到61 048条基因序列,检测出微卫星位点12 107个,其中二核苷酸重复最多、长度变异大。(2)设计的60对微卫星引物中的20对能扩增出清晰条带且有多态性,每个位点的复等位基因数(N_a)在4~14之间,平均为8.40;多态性信息含量(PIC)平均为0.77。该研究开发的天麻微卫星分子标记为开展天麻遗传学研究及种质资源鉴定等工作奠定了基础。     

中国4种蝙蝠的G-带和C-带

首次报道了中国4种蝙蝠的G-带和C-带核型。大长舌果蝠(Eonycteris spelaea)二倍染色体数目(2n)为36,常染色体臂数(FN)为56;马来假吸血蝠(Megaderma spasma)2n=38,FN=70;黑髯墓蝠(Taphozous melanopogon)2n=42,FN=64;皱唇蝠(Chaerephon plicata)2n=48,FN=54。通过C-带显示,除着丝粒异染色质外,在皱唇蝠的许多染色体臂内和马来假吸血蝠染色体的端粒处也有较多的插入异染色质,大长舌果蝠的基因组中既有臂内异染色质也有端粒异染色质。     

高原鼠兔四个地理种群的遗传多样性与遗传分化

采用7 个多态微卫星DNA 标记分析了4 个高原鼠兔地理种群(海晏种群、西大滩东种群、西大滩西种群和昆仑山种群)的遗传多样性和遗传分化。采用多态信息含量(PIC)、期望杂合度(H_e )、观测杂合度(H_o)、基因流(N_m )和基因分化系数(F_st )对种群及物种的遗传多样性水平进行分析;计算各种群间的遗传距离(GD)、遗传相似度(GI)以及遗传距离与地理距离的相关系数,并进行UPGMA 聚类分析。研究结果显示,高原鼠兔的遗传多样性在小哺乳动物中处于较高水平, 其H_e 和H_o 的平均值分别为0. 5332 和0. 6003, 其F_st 为0. 0975,即有9. 75% 的变异存在于种群之间,即变异主要存在于种群内部。4 个种群间的杂合度与多态信息含量均无显著差异,说明它们的遗传多样性水平基本相当。海晏种群与其余3 个种群的遗传分化均达到了中度分化水平(F_st = 0.1043),而另3 个种群间几乎没有分化(F_st = 0. 0253)。Mantel test 结果表明地理距离与遗传距离间没有显著的相关性。     

小兴安岭地区黑熊的食性分析

2004 年5 月至2005 年11 月,在黑熊主要分布区小兴安岭利用无线电遥测技术跟踪黑熊并判定黑熊取食生境,收集黑熊粪便51 堆,利用粪便组织学分析方法对黑熊食物组成成分以及食物的选择性进行分析。结果表明:春初、秋末黑熊觅食生境为海拔400 ～ 560 m 的针叶林、针阔混交林;春末、夏初觅食生境为阔叶林、针阔混交林;夏季、秋初觅食生境为阔叶林、针阔混交林、河岸杂木林等。黑熊的大宗食物为植物,即使是夏季食物种类丰富季节,食物中植物成分仍近70% 。黑熊食物表现出季节性变化,季节不同采食种类不同,采食植物性食物的部位也不同。春季黑熊的食物种类最少,食物多样性指数为2.317,食物均匀性指数为0.5923,夏季的食物种类最丰富,食物多样性指数2.628,食物均匀性指数0.6367,秋季食物种类比春季丰富,但没有夏季丰富,食物多样性指数为2.361,食物均匀性最小,仅为0 5173。黑熊对植物类食物具有选择性,对红松、蒙古栎、核桃楸等坚果和猕猴桃、山桃等浆果类食物表现为正选择性;而对木贼、禾本科、榆、宽叶苔草、色木、桦、杨、柳表现为负选择性。      

饶阳地区三种农田啮齿类头骨形态比较及性二型

关于动物头骨形态方面的研究报道曾受到了较多的关注（Cesani et al., 2003）.头骨形态是动物形态特征的一个重要方面,受遗传和环境因素的共同影响,存在着种间、性别和地理差异（张焱等,1999）.头骨的形态特征不仅是动物生理上的一个基本解剖指标,同时也是动物分类（李晓晨和王廷正,1992）和年龄鉴定（张洁,1989）的重要依据,是动物生态研究的重要指标.对头骨形态的研究,不仅对动物的种间、种内关系（Yom et al.,1999）和生态特征（Barlow et al.,1997）等方面的研究具有重要的参考价值,在动物的地理演化、发育生物学以及进化生态学的研究中也具有十分重要的意义.     

应用凝血反应检测杀鼠灵抗药性褐家鼠的可行性研究

为探讨凝血反应在鼠类抗药性检测中的应用前景,以褐家鼠为对象,在摄食实验基础上筛选抗药性褐家鼠,并在区分剂量12 mg/kg作用下分析抗药性和敏感性褐家鼠的凝血能力的变化情况。结果显示,抗药性个体在区分剂量作用下,凝血酶活动度虽有所下降,下降幅度可达正常水平的17%,但在2～3 d 内可恢复到正常凝血水平;而敏感性褐家鼠的凝血酶下降到很低,且在随后不能恢复。另外,对褐家鼠凝血酶活动度的分布及其存活的关系研究也提示,区分剂量可促使凝血酶活动度的种群分布从单峰型向双峰型分化,其中敏感个体的凝血酶活动度在0～3.16之间,而抗药性个体则在17～100 之间。并发现用药4 d 后的凝血酶活动度基本上可代表其未来的存活率,这提示了凝血反应与摄食实验结果的一致性。因此,以施药后4 d 凝血酶活动度PCA=17 或INR=5.0 作为阈值来区分抗药性和敏感性个体的凝血反应状况,进行家栖鼠抗药性测定是可行的。     

东方田鼠四个种群线粒体D-loop 区遗传多态性分析

东方田鼠(Microtus fortis)主要分布在我国和俄罗斯、朝鲜、蒙古等地,我国是东方田鼠主要分布区,在东北、西北、黄河流域、长江流域和浙江、福建等省都有分布.     

Rapid expansion of microsatellite sequences in pines

Microsatellite persistence time and evolutionary change was studied among five species of pines, which included a pair of closely related species (Pinus sylvestris and Pinus resinosa) in the subgenus Pinus, their relative Pinus radiata, and another closely related species pair (Pinus strobus and Pinus lambertiana) in the subgenus Strobus. The effective population sizes of these species are known to have ranged from the very small bottlenecks of P. resinosa to vast populations of P. sylvestris. This background allowed us to place the microsatellite evolution in a well-defined phylogenetic setting. Of 30 loci originating from P. strobus and P. radiata, we were able to consistently amplify 4 in most of the these pine species. These priming sites had been conserved for over 100 Myr. The four microsatellites were sequenced in the five species. Flanking sequences were compared to establish that the loci were orthologous. All microsatellites had persisted in these species, despite very different population sizes. We found a recent microsatellite duplication: a closely related pair of loci in P. strobus, where the other four species had just one locus. On two independent occasions, the repeat area of this same microsatellite (locus RPS 105a/b) had grown from a very low repeat number to 15 or 17 in the last 10-25 Myr. Other parts of the same compound microsatellite had remained virtually unchanged. Locus PR 4.6 is known to be polymorphic in both P. radiata and P. sylvestris, but the polymorphism in the two species is due to different motifs. The very large pine genomes are highly repetitive, and microsatellite loci also occur as gene families.     

Isolation and characterization of new microsatellite markers in shea tree (Vitellaria paradoxa C. F. Gaertn)

Vitellaria paradoxa is one of the major components of African parkland agroforestry systems. In order to assess the genetic diversity and population structure of this species, we isolated and characterized 14 polymorphic nuclear microsatellite loci. Primers developed to amplify these loci were used to analyse 200 individuals of a shea tree population in Mali. Loci have shown a high number of alleles ranging from four to 26, and display an observed level of heterozygosity between 0.37 and 0.85. These new very polymorphic microsatellite markers will be useful for genetic and ecological studies of V. paradoxa.     

Eleven novel microsatellite markers for the Chinese alligator (Alligator sinensis)

Chinese alligator (Alligator sinensis) is a critically endangered species endemic to China. In this study, we developed 11 novel microsatellite loci for this rare species and applied them to examine genetic variation of indigenous alligators from Changxing Nature Reserve and America-born Chinese alligators. The 11 polymorphic microsatellites presented a total of 31 alleles among 57 individuals scored, yielding an average of 2.82 alleles per locus. One allele was unique to the American population but four private alleles were detected in the Changxing population. The average expected and observed heterozygosities were 0.400 and 0.482 for the Changxing alligators and 0.520 and 0.621 for the America-born individuals, respectively. These microsatellite markers would be useful tools in the genetic examination of this endangered species.     

Identification of microsatellite loci in Collinsia verna (Veronicaceae)

We developed eight polymorphic microsatellite loci for Collinsia verna (Veronicaceae). In a sample of 18–35 individuals from a single population, we found two to 15 alleles per locus (mean 8.3). We also tested these loci for cross‐amplification in all 22 species in the tribe Collinseae. Overall, more than half the species in the tribe amplified one microsatellite while three species most closely related to C. verna (Collinsia violacea, Collinsia parviflora and Collinsia grandiflora) amplified multiple microsatellite loci. These microsatellite loci will be used in future studies of mating system in this tribe and other quantitative genetic and population genetic studies.     

Thirteen polymorphic microsatellite loci in the Neotropical fish Prochilodus argenteus (Characiformes,Prochilodontidae)

Prochilodus species inhabit the main river systems of South America and usually present commercial value to inland fishing. In the present study, we describe the isolation and characterization of 13 novel microsatellite loci in Prochilodus argenteus. The number of alleles per polymorphic locus varied from four to 22 and the observed heterozygosity ranged from 0.333 to 0.893. Additionally, cross‐species amplification was successful in two other Prochilodus species. These loci will be useful for studies of the population genetic structure in this fish group.