大熊猫遗传多样性评估的微卫星分型体系优化 |
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引用本文: | 寇洁,李严,王鹏,刘红,刘佳文,王涓,王也,张亮,沈富军.大熊猫遗传多样性评估的微卫星分型体系优化[J].遗传,2022(3):253-275. |
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作者姓名: | 寇洁 李严 王鹏 刘红 刘佳文 王涓 王也 张亮 沈富军 |
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作者单位: | 1. 成都大熊猫繁育研究基地;2. 四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室;3. 西南科技大学生命科学与工程学院 |
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基金项目: | 成都大熊猫繁育研究基金项目(编号:CPF-2014-08); |
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摘 要: | 微卫星作为重要的分子标记之一,已被证明在大熊猫种群规模评估、亲子鉴定和遗传多样性分析方面是有效的。目前微卫星标记在大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)染色体上物理定位方面的报道较少,而且缺乏微卫星基因分型系统的效能评估以及PCR扩增条件的优化。本研究基于大熊猫基因组参考序列(ASM200744v2),分析了34个大熊猫微卫星位点的染色体定位特征并评价了位点的应用价值。通过优化34个STR-PCR反应体系和扩增程序,结合微卫星的染色体定位数据确定了Ame-μ10标记的较低应用价值以及gpz-6重新筛选引物的必要性。本研究有助于提高基因分型结果的重复性和可靠性,对促进《大熊猫种群遗传档案建立技术规程》规范化应用和制定大熊猫保护策略具有重要意义。
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关 键 词: | 大熊猫 遗传多样性 微卫星标记 STR-PCR |
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