问:蛋白质、核酸都是通过缩聚反应形成的吗?

答:由于人们对教材内容机械引入或对教材语意曲解,因而众多的复习资料无论在介绍蛋白质、核酸的结构还是生命起源时都人为地强调氨基酸"缩合"形成蛋白质、核苷酸"聚合"形成核酸.     

N-甲基-2-溴代吡啶卤化盐在多肽合成中的应用

本文介绍了N-甲基-2-溴代吡啶卤化盐在多肽合成中应用的研究结果。N-保护氨基酸的三级铵盐在二氯甲烷或二甲基甲酰胺中与N-甲基-2-溴代吡啶卤化盐反应,先形成N-甲基-2-溴代吡啶卤化盐酯的活化中间体,然后在第二分子的三级胺的存在下与氨基酸或肽的酯缩合得到N-保护的肽酯。用该试剂进行缩合反应具有反应速度快、缩合率高、副产物容易去除等优点。我们用这个方法合成了一系列二肽衍生物,并用逐步递增法合成了亮氨酸脑啡肽(五肽)。N-保护的氨基酸活化后与胺基组分缩合成肽酯,其收率一般都在85%左右。     

多肽合成基本知识

<正> 一、概述所谓多肽,它和蛋白质一样都是由多个氨基酸有次序地进行氨端和羧端的缩合,通过肽键(酰胺键)共价连接成长短不一的链状化合物:     

蛋白质-核酸复合物界面氨基酸与核苷酸偏好性分析

蛋白质-核酸相互作用机制到目前还不是很清楚,尤其是蛋白质与RNA的相互作用。目前,可得到的蛋白质-核酸复合物结构数据不断增多,作者收集了Protein Data Bank数据库中所有的蛋白质-核酸复合物结构数据,对复合物中结合残基和结合核苷酸的偏好性进行了统计分析。发现：1）不同功能的蛋白质-核酸复合物间的结合残基数量存在显著差异;2）在蛋白 质-DNA和蛋白质-RNA复合物界面,碱性氨基酸都是最受欢迎的;3）氨基酸的极性大小及方向在决定它是否与RNA分子进行结合时起到重要的作用,同时发现氨基酸侧链形成的空间位阻会影响氨基酸残基与RNA分子的相互作用;4）随着定义结合残基距离阈值的增大,其氨基酸使用的特异性降低,而受欢迎与不受欢迎的氨基酸种类均没有变化。     

高灵敏显色降解试剂4-N，N-二甲氨基偶氮苯-4′-异硫氰酸酯(DABITC)在蛋白质顺序分析中的应用

一、序言 Edman降解是蛋白质顺序分析最有效的方法。它由三步反应组成,首先,异硫氰酸苯酯(PITC)在碱性pH下与肽或蛋白质的N-端氨基酸反应生成苯基氨荒酰(PTC)衍生物,然后在酸性pH下生成比原先的肽少一个氨基酸的肽与苯基噻唑啉酮(PTZ)衍生物,后者在酸性     

用片段固相缩合法全合成结晶胰高血糖素

遵照毛主席关于“要认真总结经验”的教导,作者在回顾十年来多肽合成发展过程的基础上,运用一分为二的唯物辩证观点分析了目前已有的两类合成方法都难以合成含100个氨基酸残基以上的大蛋白质的内在矛盾,指出了可能解决矛盾的途径之一,一个新的合成方案——片段固相缩合法。在“独立自主、自力更生”方针的指引下,通过反复实践,我们合成了初步满足新方法所需要的新材料——表层树脂。本文报导合成胰高血糖素(29肽)的结果,目的是对新方法进行一次考验:先将用经典法合成的四个肽片段(5,6,9,6)在三肽树脂上依次进行缩合,每次缩合率皆达95%以上,全合成以后经过氟化氢处理,两次柱分离纯化,便可获得氨基酸组成、层析及碟状电泳等物化行为与天然品相同的,具有高效增血糖活力的胰高血糖素结晶——正交十二面体。全过程总得率可达17%。根据在胰高血糖素的组成中含有侧链功能团氨基酸较多的特点,在虽然给人工合成过程带来不利影响的情况下仍能获得较高缩合率及通过简单分离即能纯化结晶的结果,说明这一方法有可能为人工合成具有严格结构的较大蛋白质提供一条发展途径。     

非蛋白氨基酸的功能与应用

<正> 非蛋白氨基酸是跟以肽键构成高分子蛋白质有所不同的一些氨基酸,它是以游离或小肽形式存在。当生物组织用乙醇溶液浸提时,不会随蛋白质沉淀,而是留在溶液之中,一般认为非蛋白质氨基酸不是构成机体结构物质,也不作能源物质。故不象蛋白质氨基酸那样,与生物机体生长发育直接相关。而且由于它含量少,发现迟,还被人们误以为     

分子进化的概念、理论和方法

严格地说,“分子进化”有两层含意。一层含意是 指生命起源时期的化学进化,即有机分子由简单向复 杂的演变〔们;另一层含意是指生物进化过程中,构成生 物体的大分子,如蛋白质、核酸的演变。由于分子生物 学研究的迅速进展,已经搞清了许多生物大分子的一 级结构。从某些同源蛋白质（或核酸）的比较中,人们发 现,不同生物之间,同源蛋白质（或核酸）结构上的差异 各不相同,亲缘关系近的差异较小,反之则差异较大, 即这些生物大分子象生物的表型一样,能反映物种间 的亲缘关系,体现物种的演化过程。现在,当提及分子 进化时,一般都是指后一层意思。     

一种特异性识别小细胞肺癌细胞的小分子肽

应用“一个珠子一个化合物”的组合化学肽库技术,筛选得到特异性识别小细胞肺癌细胞(DMS53)的小分子肽.初次筛选共得到32个与DMS53阳性结合的珠子,经氨基酸序列分析后发现,含有cNGRXXXc或cXNGRXXc肽链结构的序列共有10个.再次合成三种有代表性的小分子肽,发现cFNGRQQc与DMS53的结合率明显高于其他小分子肽.选择cFNGRQQc作进一步的细胞特异性研究,发现cFNGRQQc与DMS53的粘附特异性明显高于其他细胞系,对cFNGRQQc的结构分析显示,-NGR-及六肽长度对小分子肽与DMS53细胞的粘附非常重要.用抗整合素、E-cadherin、NCAM及ICAM的抗体或多肽阻断小分子肽与DMS53细胞表面的相应受体结合,未见明显的阻断效应.小分子肽与DMS53细胞表面的结合位点有待于进一步证实.     

D—氨基酸生物化学的进展

<正> 人们对氨基酸的认识,最初是从蛋白质水解物中得到,自然界中氨基酸也主要以蛋白质的结合态存在,由于蛋白质中所得到的氨基酸均为L型,所以很自然把天然氨基酸都认为是L型。而D-氨基酸则是实验室人工合成后才认识的。由于它是人工合成的于是认为它属非天然氨基酸而打入“另册”。这种认识延续了近百年成为传统观念。可是近二十年来新发现氨基酸种数剧增(达400多种),其中包括不少D—氦基酸在微生     

用混合氨基酸接肽的方法合成OX型肽亚库

肽库合成是药物研究组合化学策略的重要技术之一。建立合成OX型肽亚库的固相合成方法 ,接肽反应采用等摩尔的Fmoc氨基酸混合物和DIC HOBt缩合方法 ,以高浓度的缩合剂和不断缩减溶剂的策略促进偶联反应进行完全。产物的氨基酸组成分析结果显示 ,所使用的常见氨基酸都能以相近的摩尔比例接肽至X位置。推测经多次接肽后最终形成的肽亚库中 ,含低活力氨基酸较多的肽其浓度虽然会较低一些 ,但影响不会太大 ,且本合成方法成本相对较低 ,故可为抗原表位分析、多肽药物筛选及构效关系分析提供一种有用的工具。     

DABITC／PITC双偶合法在蛋白质手工固相顺序分析中的应用

Edman化学降解法迄今仍然是蛋白质(或多肽)顺序分析中最基本和最有效的方法。根据蛋白质(或多肽)在反应中的状态不同,可分液相顺序分析法和固相顺序分析法。固相顺序方法,由于操作方便,洗涤干净,肽不会因洗涤和抽提而受损失等优点而迅速发展。但是由于Edman降解反应产物PTH-氨基酸检出的局限性,影响了Edman液相和固相顺序法的灵敏度和精确度。近十年来,发展的高灵敏的顺序方法,主要集中于二点:一是采用放射性同位素,荧光基团或有色Edman试剂;二是     

蛋白质酸水解液用过甲酸氧化处理对胱氨酸的测定

<正> 蛋白质在酸水解过程中,其中的半胱氨酸和胱氨酸易受到氧化而破坏。特别是在用茚三酮显色反应来检测氨基酸的柱层析法中,半胱氨酸不与茚三酮产生显色反应,因而对它无法测定。所以在测定这两个氨基酸时,通常采用过甲酸氧化法。即用过甲酸将蛋白质中的这两个氨基酸氧化为半胱磺酸进行测定。但这一方法操作烦杂,其中的过甲酸不易除去,而会在酸水解过程中使     

中心法则对生物学的影响及其面临的挑战

ＦｒａｎｃｉｓＣｒｉｃｋ 1 95 7年在实验动物学会年会上作了题为“关于蛋白质合成”的报告 ,该文发表于 1 95 8年。在这篇论文中 ,Ｃｒｉｃｋ首次列出了 2 0个氨基酸残基的标准位点 ,并提出了核酸碱基序列可以独特的表达一段核酸的特异性 ,该序列编码某一特定蛋白质的氨基酸序列 ;还提出了蛋白质三维空间的形成是由它的氨基酸序列所决定的论据 ;并指出蛋白质合成一定是连续的 ,阐明了在核糖体上合成蛋白质由“中间体 (ａｄａｐｔｏｒ)”分子介导的假说。最重要的是Ｃｒｉｃｋ提出了“中心法则”。中心法则在过去和现在一直在影响着分子生…     

泛肽的结构与功能

泛肽(ubiquitin)是一种活细胞内普遍存在的小分子蛋白质,分子量仅8565道尔顿,为76个氨基酸组成的单链多肽。以前根据牛和人泛肽氨基酸顺序测定的结果,认为它是一条羧基末端含精氨酸的74肽;后来才知道,76肽才是泛肽的真正活性分子。从不同种属分离提取的泛肽,在进化过程中其氨基酸顺序保存得完好,例如,从昆虫、乌龟、牛及人红细胞里鉴定出的泛肽,其1～74位氨基酸顺序完全相同。泛肽的理化性质颇为独特,它虽含有7个赖氨酸和4个精氨酸,但却能耐受胰蛋白酶特异性消化,pH 与温度变化也不影响其稳定性。核磁共振(NMR)研究表明,pH1.18～8.48和23～80℃温差范围     

生命起源的途径：关于多分子体系形成的看法

生命的起源问题,是一个古老的哲学问题,也是现代自然科学的重大课题之一。根据科学的推算,我们居住的地球从诞生到现在约有46亿年的历史,在地球诞生后经历了近十亿年的化学进化才产生了生命——蛋白质和核酸相互作用的生命体系。目前关于生命起源的化学进化过程大体可划分为四个阶段:(1)由无机小分子物质形成有机小分子物质;(2)由有机小分子物质形成生物大分子;(3)由生物大分子组成多分子体系;(4)由多分子体系演变为原始生命。据推测,原始地球大气是还原性的,主要有甲烷、氨、氮、氢、水蒸汽和二氧化碳等,此外还有一些硫化氢(H_2S),氰化氢(HCN)等其它成分。经过了30多年的     

提高易自聚合蛋白质与核酸相互作用效率的一种简单方法

对蛋白质、DNA和RNA的相互作用(结合)的研究是分子生物学的基本课题.多数DNA和RNA的结合蛋白都具有自聚合倾向,在体外实验中会造成难以和DNA或RNA形成结合物而影响实验的结果.用荧光素异硫氰酸酯(FITC)标记蛋白质能显著抑制这种自聚合倾向,而大幅度提高其与核酸分子的结合效率.这一简单方法已用于在细胞角蛋白18与转录因子C/EBPβ3′UTR RNA结合研究中.     

小红参的抗癌环己肽配糖体

从小红参中分离得到１个具有抗癌活性的环己肽配糖体新成分ＲＹ－Ｉ,经化学及光谱学方法确定了其结构,证明此化合物由２个Ｌ－丙氨酸,１个Ｄ－丙氨酸,３个Ｎ－甲基－Ｌ－酪氨酸６个氨基酸经肽键缩合与１个葡萄糖构成的环己肽配糖体,６个氨基酸缩合形成十八员环,其中两个酪氨酸之间的苯环经氧桥连接又形成１个具有较大张力的十四员环。活性测试表明ＲＹ－Ｉ具有抗癌活性。此外还分离得到ＲＹ－Ｉ的甙元ＲＡ－Ｖ,也是１个抗癌活     

运用 mRNA 体外展示技术筛选胸苷酸合成酶 RNA 亲和肽

以体外选择方法筛选不同功能的核酸、肽和蛋白质是近年的研究热点, mRNA 体外展示是一种新兴的高效多肽选择技术,其基本原理是通过含嘌呤霉素寡核苷酸的 Linker 使 mRNA 与它编码的肽或蛋白质共价结合,形成 mRNA- 蛋白质融合体,这一方法已用于多种功能肽的鉴定 . 以 mRNA 体外展示技术进行了由大容量多肽库中 (>1013) 筛选胸苷酸合成酶 (thymidylate synthase , TS) RNA 亲和肽的研究,通过精密的实验设计,建立了一套完整有效的筛选方法,并对实验条件进行了优化 . 已进行了 8 轮筛选,结果表明,以 mRNA 体外展示技术获得的多肽分子,可以与 TS mRNA 亲和 . 将测序结果与初始肽库进行比较,发现亲和肽中碱性氨基酸及芳香族氨基酸含量明显增加,说明其在与 RNA 结合中具有重要作用 . mRNA 展示技术作为一种大容量文库的体外筛选方法,将广泛应用于与固定化靶物质具高度亲和性及特异性的多肽和蛋白质的筛选 .     

小分子肽的Tricine-SDS-PAGE分离方法

在蛋白质的生化分析和基因表达产物的分离纯化中 ,经常要把某种或某些蛋白质成分分离开来。聚丙烯酰胺凝胶电泳 ( SDS- PAGE)是分离蛋白质的常用生化方法 ,样品的蛋白质分子热变性解聚后与 SDS结合形成带负电的蛋白质 - SDS复合物 ,复合物在电泳中的迁移率取决于蛋白质的分子大小 ,使用均匀浓度的 SDS-PAGE来分析分子量在 15～ 2 0 0 k D的蛋白质时 ,电泳迁移率与分子量的对数成线性关系。但常规定 Tris-甘氨酸 -盐酸系统中电泳分离分子量小于 10 k D的多肽效果差。作者在分离小分子肽的实验中改进了一套较简便的分离小分子肽的 T…