棉花胚珠内种皮特异基因GhIAA16的分离鉴定

棉花(Gossypium hirsutum L.)纤维是由胚珠外珠被表皮细胞发育形成的一种单细胞表皮毛.为了分析鉴定与棉花胚珠发育相关的基因,本文通过cDNA阵列方法分离了25个在开花前后棉花胚珠中差异表达的基因.其中一个基因与拟南芥IAA16具有很高的同源性,并命名为GhIAAl6.该基因编码一个208个氨基酸组成预测蛋白.分子生物学分析表明它在棉花基因组中以单拷贝形式存在,而且在棉花胚珠内种皮(endothelium)中特异表达.GhIAAl6是棉花中第一个分离到的内种皮特异表达的基因,本文对它在棉花胚珠发育中的可能功能进行了讨论.     

棉花胚珠内种皮特异基因GhIAA16的分离鉴定

棉花(Gossypium hirsutum L.)纤维是由胚珠外珠被表皮细胞发育形成的一种单细胞表皮毛。为了分析鉴定与棉花胚珠发育相关的基因,本文通过cDNA阵列方法分离了25个在开花前后棉花胚珠中差异表达的基因。其中一个基因与拟南芥IAA16具有很高的同源性,并命名为GhIAA16。 该基因编码一个208个氨基酸组成预测蛋白。分子生物学分析表明它在棉花基因组中以单拷贝形式存在,而且在棉花胚珠内种皮(endothelium)中特异表达。GhIAA16是棉花中第一个分离到的内种皮特异表达的基因,本文对它在棉花胚珠发育中的可能功能进行了讨论。     

cDNA文库的快速构建法

ｃＤＮＡ文库的快速构建法周立,任东路（中国科学院发育生物学研究所,北京１０００８０）ｃＤＮＡ文库的构建是现代分子生物学中一门重要的技术。它主要用于基因的筛选。通过这种方法能够得到完整的编码蛋白质的目的片段。通过构建表达型ｃＤＮＡ文库还能分离到调控基因转录的蛋白质因子的基因。此外,差别筛选（ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｓｃｒｅｅｎｉｎｇ）技术有助于我们获得在发育的不同阶段特异表达的基因片段。     

橡胶树凝集因子hevein基因及其启动子序列的分离与分析

橡胶树( Hevea brasiliensis Muell.-Arg.)凝集因子hevein是引起橡胶粒子凝集的主要因素,它是胶乳中黄色体内主要的蛋白质,具有几丁结合的功能.通过PCR技术扩增并克隆了橡胶树hevein基因共680 bp的序列.继而通过步移法分离启动子区域1 306 bp的序列,序列含典型的TATA盒和CAAT盒以及ABA效应元件的同源序列.为证实该基因在乳管中特异表达,利用Northern blot分析hevein基因在胶乳和叶片中的表达,同时,分析乙烯和ABA处理后hevein基因的表达.结果表明,hevein基因主要在胶乳中表达,乙烯和ABA对基因的表达有诱导作用.     

启动子诱捕在棉花基因组中的功能分析

利用根癌农杆菌介导的遗传转化,将启动子诱捕（Promoter trapping）元件插入到棉花基因组,获得141个独立的转化子,其中97％的转化子经PCR扩增为阳性。不同组织中GUS基因的表达频率为：根部48％,茎的微管组织9．2％,叶5．2％,花51％;同时检测了不同植株中GUS基因的表达模式,发现GUS基因在不同株系的植株间的表达模式呈现较大的差异,有些植株中GUS基因是组织特异表达,有些则是器官特异表达,有些则在多个器官中均有表达。所建立的启动子诱捕系统中的GUS基因高频率、多模式和时空特异性表达为分离基因及其调节序列、开展功能基因组研究奠定了坚实的基础。     

大豆油酸脱氢酶基因启动子的克隆及其表达活性分析

大豆油酸脱氢酶(FAD2-1B)基因是种子特异表达基因,利用PCR方法从大豆基因组DNA中分离FAD2-1B基因的启动子片段,命名为FP.PLACE在线启动子预测工具分析表明:序列中含有多种典型的种子特异性表达元件,如Skn-1 motif、AACACA、SEF4 motif、E-box、ACGT等.将克隆得到的FP片段替换pCAMBIA1301中的CaMV35S启动子,构建表达载体pCAM-FP.通过农杆菌介导法在大豆各组织中进行瞬时表达,GUS组织化学染色显示FP驱动GUS基因在大豆根、茎、叶中基本不表达,在种子中有较高的表达活性,推测FP启动子具有种子特异表达活性.     

橡胶树凝集因子hevein基因及其启动子序列的分离与分析

橡胶树 (HeveabrasiliensisMuell._Arg .)凝集因子hevein是引起橡胶粒子凝集的主要因素 ,它是胶乳中黄色体内主要的蛋白质 ,具有几丁结合的功能。通过PCR技术扩增并克隆了橡胶树hevein基因共 6 80bp的序列。继而通过步移法分离启动子区域 130 6bp的序列 ,序列含典型的TATA盒和CAAT盒以及ABA效应元件的同源序列。为证实该基因在乳管中特异表达 ,利用Northernblot分析hevein基因在胶乳和叶片中的表达 ,同时 ,分析乙烯和ABA处理后hevein基因的表达。结果表明 ,hevein基因主要在胶乳中表达 ,乙烯和ABA对基因的表达有诱导作用。     

异源Oct-4基因启动子在猪、兔和小鼠早期胚胎中的时空表达活性

Oct-4是一种哺乳动物早期胚胎中特异表达的转录因子,它与细胞多能性的维持有关．异源Oct-4基因在早期胚胎中的表达模式尚不明确．构建了一个以完整的牛Oct-4调控区指导GFP表达的转基因结构pOct-4(p)-GFP,通过单精子注射的方法将其导入猪、兔和小鼠的受精卵中,分析其在胚胎发育过程中的表达情况．结果显示：牛Oct-4启动子驱动的GFP基因在3个物种的2-细胞胚胎就已经开始表达,在囊胚期表达加强且只特异表达于内细胞团中,而不表达于滋养层．研究表明：牛的Oct-4启动子在其他物种中也具有表达活性,异源性Oct-4启动子在不同物种的早期胚胎中具有相似的表达模式．     

植物根特异性基因表达研究

植物根中基因表达的调控近几年渐始受到注意,一些分离自植物病原的外源基因启动子能在植物根中特异性地启动编码基因表达,部分植物基因组基因查明存在根特异表达调控元件和反式作用因子,已分离和克隆了部分未知功能的根特异性表达基因。     

植物根特异性基因表达研究

植物根中基因表达的调控近几年渐始受到注意,一些分离自植物病原的外源基因启劝子能在植物根中特异性地启动编码基因表达。部分植物基因组基因查明存在根特异表达调控元件和反式作用因子,已分离和克隆了部分未知功能的根特异性表达基因。     

mRNA差异显示

分离差异表达的基因是研究生命调节过程的重要手段,mRNA差异显示技术是一种能成功分离差异表达基因的方法,文章对该方法的基本原理、方法步骤及其应用作了较为详细的介绍。     

差异显示技术及其研究进展

差异显示技术是分离差异表达基因的重要方法与手段,同其它研究基因差异表达的方法如RDA,SSH,SAGE相比,差异显示技术是其中使用频率较高的方法。该技术自1992年创立以来,经过各国研究者不断完善与改进,现已大大克服以往诸多不足,扩大了应用领域。本文就差异显示技术的原理及主要优缺点作以简要概述,并着重就引物设计、降低假阳性、鉴定差异表达基因及差异显示技术的衍生技术这4个方面的研究进展作以详尽介绍。     

一种快速mRNA差异显示技术及用于分离辐射诱导转录子

介绍一种从不同类型细胞或不同生长状态细胞中分离差异表达基因的快速ｍＲＮＡ差异显示技术．其特点是不用同位素标记,操作简便,在普通琼脂糖凝胶电泳中就能分辨差异显示的ｃＤＮＡ带,便于ＤＮＡ回收和进一步重组克隆．用此方法成功地分离到电离辐射诱导转录子．     

Characterization of novel genes expressed specifically in the sexual organs of the planarian Dugesia ryukyuensis

The planarian Dugesia ryukyuensis reproduces both asexually (fissiparous) and sexually (oviparous) and can switch from the asexual mode to the sexual mode. By feeding with mature Bdellocephala brunnea oviparous worms, the fissiparous worms, which do not possess sexual organs, can be converted to fully sexualized worms in a process termed sexualization. As sexualization proceeds, the sexual organs are formed uniformly and five stages (stages 15) of the process have been identified histologically. In order to clarify the sexualization process, we attempted to isolate the genes expressed specifically at stage 5 by the differential display method. We isolated five genes expressed in the testis and two genes expressed in the yolk gland, which is an organ specific to sexualized worms. By BLAST search, one of the testis-specific genes was coded as testis-specific alpha-tubulin and two yolk gland-specific genes are similar to ribose-phosphate pyrophosphokinase I and F-box/SPRY-domain protein 1. Drs1, Drs2 and Drs3 were expressed in spermatocytes and spermatids from the early stage of spermatogenesis and Drs4 and Drs5 were expressed in spermatogonia, spermatocytes and spermatids. These genes are useful markers for elucidating the sexualization process.     

Identification of two gene clusters involved in cyclohexanone oxidation in Brevibacterium epidermidis strain HCU

Brevibacterium epidermidis HCU can grow on cyclic ketones and alcohols as a sole carbon source. We have previously reported the identification of two cyclohexanone-induced Bayer-Villiger monooxygenase genes by mRNA differential display. Using the related technique of Out-PCR, we have amplified large DNA fragments flanking the two monooxygenase genes. Two large gene clusters were sequenced. Several ORFs in each gene cluster encoded proteins homologous to cyclohexanol and cyclohexanone oxidation enzymes from Acinetobacter. However, the structure of these two gene clusters differs significantly from that of Acinetobacter, where the complete pathway has been described. To assess activity of these genes, they were cloned and expressed in Escherichia coli. In vivo and in vitro assays enabled us to assign functions to the expressed ORFs. These ORFs included a cyclohexanol dehydrogenase, two different epsilon-caprolactone hydrolases and two 6-hydroxyhexanoate dehydrogenases belonging to different enzyme families. Because this environmental isolate is difficult to manipulate, we cannot determine at this time which cluster is involved in the degradation of cyclohexanone under physiological conditions. However, the original differential display experiments and some of the experiments reported here suggest the involvement of both gene clusters in the oxidation of cyclic ketones.