长链非编码RNA HULC与消化系统肿瘤的相关性研究及作用机制*

随着全基因组测序技术的快速发展,越来越多的长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)分子被发现,逐渐成为新的研究热点。LncRNA HULC(highly up-regulated in liver cancer)是一种在肝癌中呈异常上调表达的长链非编码RNA,并参与调控了肝癌细胞增殖、抗凋亡、侵袭及上皮间质化等诸多肿瘤恶性生物学行为。随着研究的不断深入,发现HULC于其他消化系统肿瘤(胃癌、胰腺癌、结肠癌等)中同样呈现上调表达,可通过不同作用机制调控肿瘤的发生发展,并有望成为新型肿瘤诊断标志物和精准分子治疗的靶点。本文就近年来LncRNA HULC与消化系统肿瘤的相关性研究及其作用机制进行综述。     

长链非编码RNA研究进展

长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNAs)是一类长度超过200nt的非编码RNA分子,通过信号分子、诱饵分子、引导分子、支架分子等4种方式在转录水平和转录后水平调控基因的表达。lncRNAs的表达水平相对于蛋白编码基因较低,但它们在X染色体沉默、基因组印迹、染色体修饰、转录激活、转录干扰以及核内运输等方面具有重要的功能。相对于研究较多的非编码小RNA,lncRNAs的功能目前尚不完全清楚。该文从lncRNAs的起源、分类、分子机制、功能和进化等方面综述了lncRNAs的研究进展,为进一步探究lncRNAs的功能和作用机制提供依据。     

动物长链非编码RNA研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类广泛存在于动植物体内、长度大于200nt、基本不编码蛋白质的转录本。研究表明,lncRNA能够协助蛋白质复合体转运、参与基因和染色体的激活与失活调控等,在胚胎发育、肌肉生长、脂肪沉积以及免疫应答等过程中发挥重要作用。近年来,在人类基因组计划和ENCODE(The Encyclopedia of DNA Elements)计划推动下,在动物中不仅鉴定出数量众多的lncRNA,而且在lncRNA调控脂肪代谢、肌肉发育以及免疫抗病等重要生物学过程的机理研究方面也取得了突破性的进展。这些研究结果颠覆了lncRNA不编码蛋白的传统观念,提出了lncRNA编码功能性小肽调控生物学过程的新模型。本文主要介绍了动物lncRNA的特征与类型、常用数据库、生物学功能、分子调控模型以及未来lncRNA的研究方向,以期为动物lncRNA功能研究提供参考信息。     

与眼部疾病相关的长链非编码RNA的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度大于200个核苷酸不具备编码蛋白质功能的转录子,在表观遗传、转录或转录后水平调节基因的表达,维持细胞稳态。研究表明多种LncRNA的表达失衡在肿瘤细胞的增殖、转移、干细胞的全能性、免疫细胞的发育及应答过程中发挥重要。新近的研究显示许多LncRNAs特异表达与眼部疾病发生密切相关。本文主要对目前报道的与眼部常见疾病如翼状胬肉、白内障、青光眼、糖尿病视网膜病变、眼部肿瘤等差异表达LncRNAs的功能和作用机制进行了综述,以期为LncRNAs作为眼部疾病的生物学标记和潜在治疗靶点的的应用提供参考资料。     

与眼部疾病相关的长链非编码RNA的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度大于200个核苷酸不具备编码蛋白质功能的转录子,在表观遗传、转录或转录后水平调节基因的表达,维持细胞稳态。研究表明多种LncRNA的表达失衡在肿瘤细胞的增殖、转移、干细胞的全能性、免疫细胞的发育及应答过程中发挥重要。新近的研究显示许多LncRNAs特异表达与眼部疾病发生密切相关。本文主要对目前报道的与眼部常见疾病如翼状胬肉、白内障、青光眼、糖尿病视网膜病变、眼部肿瘤等差异表达LncRNAs的功能和作用机制进行了综述,以期为LncRNAs作为眼部疾病的生物学标记和潜在治疗靶点的的应用提供参考资料。     

植物长链非编码RNA研究进展

长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)长度大于200个核苷酸,大量存在于生物体中并具有多种生物学功能。目前,植物中发现的lncRNA大多由RNA聚合酶Ⅱ转录,并通过目标模仿、转录干扰、组蛋白甲基化和DNA甲基化等多种机制介导基因的表达,在植物开花、雄性不育、营养代谢、生物和非生物胁迫等生物过程中起着调节因子的作用。文章综述了近年来发现的植物lncRNA数据库、预测方法、表达及可能的生物学功能。     

植物长链非编码RNA的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lnc RNAs)是真核生物中一类长度大于200个核苷酸、无蛋白编码能力或编码能力极低的RNA转录本。lnc RNA种类和功能的多样性导致了对其进行研究的复杂性,特别是对植物中lnc RNA的认识相当有限。该文就近年来植物中已发现的lnc RNA的种类、相关转录酶、参与的生物学过程、发挥功能的分子机制以及其相关的研究策略等方面进行综述和展望,以期为深入认识植物lnc RNA提供借鉴。     

综述: 长链非编码RNA对动脉粥样硬化等疾病影响的研究新进展

动脉粥样硬化是一种以胆固醇等脂质代谢紊乱为主要特征的病理过程,严重影响人类健康．随着遗传学和生物信息学研究的发展,曾被认为无作用的非编码基因序列逐步受到研究者的关注．长链非编码RNA(lncRNA)通过表观遗传调控、转录调控和转录后调控等途径参与剂量补偿效应、基因组印记、细胞发育分化等重要生物学过程,从而影响人类的生长发育、代谢、衰老及疾病等进程．最新研究发现,lncRNA可参与血管内皮细胞的损伤与修复、血管平滑肌细胞的增殖与迁移、巨噬细胞胆固醇的流出与炎症反应、脂质的沉积与斑块的形成等过程,从而影响动脉粥样硬化及其他心血管疾病的发生与发展．     

长链非编码RNA作为潜在药物靶点的研究进展

随着生命科学的不断发展,2012年DNA元件百科全书（ENCODE）项目进一步丰富了人类基因组功能元件的相关信息。该项目 发现人类基因组超过80%的序列会被转录,其中大部分转录本是非编码RNA（ncRNA）。目前,在这些非编码RNA中,小RNA的研究 相对深入,而长链非编码RNA（lncRNA）的研究相对较少。越来越多研究表明,很多lncRNA参与到人类重大疾病的发生、发展过程之 中,并且一些动物实验证实lncRNA可作为药物靶点。因此,从lncRNA角度筛选新的药物靶点也越来越受到研究者的关注。重点总结了 lncRNA的生物学功能及作为潜在药物靶点的研究进展。     

长链非编码RNA HIT在肝癌中的表达及意义

目的:探讨长链非编码RNA HIT(lncRNA-HIT)在原发性肝癌中的表达及其与患者临床病理特征的相关性,寻找肝癌治疗的新靶点。方法:收集并筛选2015年1月至2018年1月在空军军医大学第一附属医院行手术治疗的80例经病理证实的肝细胞癌患者的肝癌组织和癌旁组织。采用实时定量聚合酶连反应(q RT-PCR)法检测患者手术切除的肝癌组织及相应的癌旁组织中lncRNA-HIT的表达,并分析HIT与患者临床病理参数之间的关系。结果:原发性肝癌组织中lncRNA-HIT的表达(6.17±4.38)明显高于癌旁组织(2.81±2.58),约为癌旁组织的2.20倍(P0.05),肝癌组织中HIT的表达与肝癌TNM分期、肿瘤大小和数量显著相关(P0.05),而与性别、年龄、肝硬化、HBV、AFP无显著相关性(P0.05)。结论:lncRNA-HIT在肝癌组织中呈高表达,可能在肝癌发生发展过程起重要作用,并可能作为肝癌治疗的新靶点。     

长链非编码RNA HOXA11-AS在胶质瘤中的表达及其临床意义的研究

目的:探讨长链非编码RNA HOXA11-AS在胶质瘤组织中的表达以及与胶质瘤患者临床预后的相关性。方法:首先,应用RT-PCR法检测人胶质瘤组织以及正常脑组织中HOXA11-AS的表达情况;其次,分析HOXA11-AS的表达水平与胶质瘤患者临床病理学特征之间的关系;最后,探讨HOXA11-AS的表达水平与胶质瘤患者预后之间的相关性。结果:RT-PCR显示,较之于正常脑组织(1.00±0.17),HOXA11-AS在胶质瘤组织(3.89±0.34)中的表达水平显著升高(P0.001),且随着肿瘤学分级的增高,HOXA11-AS的表达水平也随着升高(Grade Ⅰ-Ⅱ, 2.96±0.21 vs. Grade Ⅲ-Ⅳ, 4.83±0.50, p=0.003)。x~2检验提示HOXA11-AS表达水平与胶质瘤患者的肿瘤学分级、KPS评分以及患者的复发情况具有显著相关性,而与患者的年龄、性别、肿瘤大小等无相关性。Kaplan-Meier分析患者生存率,结果显示,HOXA11-AS低表达组患者的生存率明显高于HOXA11-AS高表达组患者,差异具有统计学意义(P0.001)。最后,我们的研究结果发现,HOXA11-AS的高表达水平、肿瘤学分级的增高、KPS评分80分均为影响胶质瘤患者预后的独立危险因素(P0.05)。结论:HOXA11-AS与胶质瘤患者预后密切相关,且为预测患者预后的独立因素。     

特定环状RNA表达与衰老的关系研究*

目的:研究小鼠不同组织器官中环状RNA的表达量在年老与年幼中的差异,揭示环状RNA与衰老的联系。方法:通过对不同组织器官的总RNA的提取,分别逆转录,并扩增circUSP34、circTCF4、circTCF20、circZFP64、circPWWP2A、circLIN54,通过凝胶电泳比较其在年轻小鼠与年老小鼠的组织器官中的表达情况,明确上述环状RNA与衰老的联系。结果:环状RNA在不同年龄小鼠的组织器官中存在广泛性的差异性表达,不同组织不同环状RNA有着不同的表达量的改变,其与衰老存在联系。在卵巢中除circTCF4,其余五种环状RNA表达量均与年龄负相关;在肾脏中,除circTCF4与circPWWP2A,其余与年龄呈负相关;在乳腺中只有circUSP3与衰老呈负相关;而在肠道与生长相关的只有上述后三种环状RNA,均呈正相关。其他样本与组织的发育阶段有不同的相关性,具体在结果体现。结论:环状RNA的表达量在组织中与年龄的增大有着显著相关性,环状RNA可能广泛地参与了不同的衰老通路,起到不同的生物学作用,其在衰老的产生中扮演重要角色。     

长链非编码RNA PVT1在肝癌组织中的表达与临床意义

目的:探讨长链非编码RNA PVT1 (lncRNA-PVT1)在肝癌组织中的表达以及在肝癌诊治中的临床意义。方法:采用qRT-PCR法检测肝癌组织和癌旁肝组织中lncRNA-PVT1的表达情况,通过x2检验分析lncRNA-PVT1的表达水平与肝癌患者临床病理指标之间的相关性,采用Kaplan-Meier法绘制患者术后生存曲线,Log-rank检验比较生存率的差异,单因素和多因素分析评估影响肝癌患者预后的独立危险因素。结果:肝癌组织中lncRNA-PVT1的表达水平显著高于癌旁肝组织(P0.05)。肝癌组织lncRNA-PVT1的表达水平与其Edmondson分级、TNM分期、分化程度和是否发生血管转移具有显著相关性(P0.05),而与患者的年龄、性别、血AFP水平、肿瘤直径、肿瘤数目以及是否有肝炎病史无关(P0.05)。lncRNA-PVT1高表达组患者的术后生存率明显低于lncRNA-PVT1低表达组患者,高表达水平的lncRNA-PVT1、Edmondson分级、TNM分期、分化程度和是否发生血管转移均是影响肝癌患者预后的独立危险因素。结论:lncRNA-PVT1在肝癌组织中呈高表达,高表达水平的lncRNA-PVT1与肝癌患者的临床预后不良密切相关,有望成为今后肝癌治疗的新靶点。     

长非编码RNA 的表达与前列腺癌的研究进展

前列腺癌是全球发病率第二的男性恶性肿瘤,近年来我国前列腺癌的发病率显著上升。最近,大量研究发现,长非编码RNA表达水平的改变与前列腺癌的发生、发展、诊断、治疗和预后密切相关。该文就长非编码RNA与前列腺癌的关系及相关机理进行综述,有助于读者了解长非编码RNA在前列腺癌发病过程中的重要性,为前列腺癌的综合防治提供线索。     

Long non-coding RNA FTX predicts a poor prognosis of human cancers: a meta-analysis

Background: Several studies have assessed the relationship between long non-coding RNA five prime to Xist (FTX) expression, clinicopathological features, and survival outcomes in patients with cancer with conflicting results. This meta-analysis synthesized existing data to clarify the association between FTX with cancer prognosis.Methods: PubMed, Embase, Cochrane library, Web of Science, Chinese CNKI, and the Chinese WanFang databases were used to search for relevant studies. The role of FTX in cancers was evaluated by pooled odds ratios (ORs) and hazard ratios (HRs) with 95% confidence intervals (CIs).Results: Eleven studies comprising 1210 participants including colorectal cancer (CRC), hepatocellular carcinoma (HCC), gastric cancer (GC), renal cell carcinoma (RCC), osteosarcoma (OSC), and glioma were enrolled in this analysis. The meta-analysis showed that high FTX expression was significantly associated with several clinicopathological characteristics, including lymph node metastasis in patients with CRC, GC, HCC, and RCC, distant metastasis in patients with CRC, GC, HCC, and OSC, larger tumor size in patients with CRC, GC, HCC, RCC, and OSC, and subsequently TNM/clinical stage in patients with CRC, GC, HCC, OSC, and glioma. The pooled results from the survival analysis revealed a significant correlation between high FTX expression and shorter OS in patients with HCC, CRC, GC, OSC, and glioma. Further, FTX overexpression could be an independent predictive marker for shorter OS in patients with CRC, HCC, OSC, and glioma.Conclusions: FTX may be a potential oncogene, with high FTX expression being associated with a poorer prognosis in patients with CRC, HCC, OSC, and glioma.     

Long non-coding RNA: The functional regulator of mesenchymal stem cells

Mesenchymal stem cells (MSCs) are a subset of multipotent stroma cells residing in various tissues of the body. Apart from supporting the hematopoietic stem cell niche, MSCs possess strong immunoregulatory ability and multiple differentiation potentials. These powerful capacities allow the extensive application of MSCs in clinical practice as an effective treatment for diseases. Therefore, illuminating the functional mechanism of MSCs will help to improve their curative effect and promote their clinical use. Long noncoding RNA (LncRNA) is a novel class of noncoding RNA longer than 200 nt. Recently, multiple studies have demonstrated that LncRNA is widely involved in growth and development through controlling the fate of cells, including MSCs. In this review, we highlight the role of LncRNA in regulating the functions of MSCs and discuss their participation in the pathogenesis of diseases and clinical use in diagnosis and treatment.     

长非编码RNA在基因调控和肿瘤形成中的作用

哺乳动物中,只有小部分基因转录成为编码蛋白质的RNA,大量的基因则转录为不能编码蛋白质的RNA,即ncRNA。长非 编码RNA(lncRNAs)是分子长度在200-100000 nt 之间的一类ncRNA。lncRNAs 的数量超过蛋白质编码基因的数量。目前,对长非 编码RNA(lncRNAs)的生物学特性,转录调控以及其在肿瘤发生发展中的作用机制的研究任然是RNA研究的热点。lncRNAs 通 过控制染色质重塑,转录调控和录转录后调控而在基因的转录调节中发挥了重要作用。lncRNAs 与多种肿瘤相关,并且在抑制因 素和促进因素中都具有重要的作用。众多文献报道的结果表明lncRNAs 参与调控基因表达,在正常细胞与肿瘤细胞的转换中起 到至关重要的作用。