| 麻竹EST-SSR标记开发及其对慈竹变异类型的分析研究 |
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| 引用本文： | 高志民,杨丽,李彩丽,刘青.麻竹EST-SSR标记开发及其对慈竹变异类型的分析研究[J].热带亚热带植物学报,2012,20(5):462-468. |
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| 作者姓名： | 高志民 杨丽 李彩丽 刘青 |
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| 作者单位： | 国际竹藤中心,竹藤科学与技术重点开放实验室,北京100102 |
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| 基金项目： | 林业公益性行业科研专项(201004005)资助 |
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| 摘 要： | 利用麻竹(Dendrocalamus latiflorus)已有的EST序列,开发了一批EST-SSR分子标记,并用于慈竹(Bambusa emeiensis)栽培变异类型的多态性研究。结果表明,在麻竹9574个EST中找到了331个EST,含有381个SSR位点,SSR出现的频率为3.98%。EST-SSR的重复类型共有59个,其中2个核苷酸的重复最多,占63.8%,其次是3个核苷酸的重复序列。根据含有SSR的EST序列设计出了44对引物,对慈竹及其变异类型进行了扩增效率、多态性及通用性检测,其中37对引物能够扩增出稳定且清晰的条带,且扩增具有多态性,扩增片段长度主要集中在100～1000 bp,引物有效率达84.1%。遗传相似性分析结果显示,所检测样品间遗传距离为0.263～0.840,平均为0.552,其中‘黑笋慈竹’与‘琴丝慈竹’‘、蛇头慈竹’与‘龙头慈竹’之间的遗传距离较近,而‘罗汉慈竹’与其他样品的遗传距离最远。
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| 关 键 词： | 麻竹 EST-SSR 分子标记 慈竹 栽培变异类型 遗传距离 |
| 收稿时间： | 2011/11/21 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2012/1/16 0:00:00 |
EST-SSR Molecular Marker Development from Dendrocalamus latiflorus and Its Application on Genetic Diversity Analysis of Variation Types from Bambusa emeiensis |
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| GAO Zhi-min,YANG Li,LI Cai-li and LIU Qing.EST-SSR Molecular Marker Development from Dendrocalamus latiflorus and Its Application on Genetic Diversity Analysis of Variation Types from Bambusa emeiensis[J].Journal of Tropical and Subtropical Botany,2012,20(5):462-468. |
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| Authors: | GAO Zhi-min YANG Li LI Cai-li and LIU Qing |
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| Institution: | International Center for Bamboo and Rattan, Key Laboratory on the Science and Technology of Bamboo and Rattan, China;International Center for Bamboo and Rattan, Key Laboratory on the Science and Technology of Bamboo and Rattan, China;International Center for Bamboo and Rattan, Key Laboratory on the Science and Technology of Bamboo and Rattan, China;International Center for Bamboo and Rattan, Key Laboratory on the Science and Technology of Bamboo and Rattan, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrocalamus latiflorus EST-SSR Molecular marker Bambusa emeiensis Cultivated variation type Genetic distance |
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