西太平洋浮游有孔虫Globigerinita glutinata种内SSU rDNA多样性研究

有孔虫分子鉴定和分子多样性研究多基于SSU rDNA序列片段分析,但某些浮游种内可能存在基因组内rDNA变化,影响分类学和分子生态学的研究结果。为了研究浮游有孔虫物种内是否存在rDNA多样性,本工作以采自热带西太平洋的浮游有孔虫Globigerinita glutinata活体标本作为研究对象,经形态学鉴定后,利用单细胞PCR和克隆技术,获得5个虫体的20条SSU rDNA目的片段(300—400 bp),同时对其序列结构进行了研究。结果显示,同种G.glutinata出现了四类不同的SSU rDNA核酸类型。序列成对分析显示,该种遗传距离差异最长可达0.249,远高于其它物种。此外,同一样本不同克隆片段中,出现了高达四个不同的SSU rDNA核酸型。序列的差异主要集中在三个不同的高变异区,高可变区的长度范围为21 bp到63 bp。从差异序列的间隔分布推断,核糖体基因簇的重组可能是不同SSU rDNA核酸型出现的原因。本工作在国内首次揭示了热带西太平洋浮游有孔虫G.glutinata种内的SSU rD NA核酸型,研究结果表明G.glutinata的种内SSU rDNA变异性极大,复杂的生活史以及假基因的存在或许是造成该现象的原因。     

利用改良培养基探究西太平洋海水可培养细菌多样性

【目的】西太平洋复杂的海洋生态环境孕育了其独特的生物群落,蕴含着种类丰富的海洋微生物资源。本研究基于分离培养技术探究了西太平洋海域不同水深细菌的多样性,并尝试通过改良培养基提高海洋细菌可培养性。【方法】采用改良的2216E固体培养基(IMA)、R2A固体培养基(R2A)、MBM固体培养基(MBM)、TCBS固体培养基(TCBS)和改良的2216E液体富集培养基(IMB) 5种不同培养基进行微生物培养,通过菌株分离纯化、16SrRNA基因序列鉴定,分析西太平洋表层至6000m水深可培养细菌的多样性以及不同培养基在分离培养异养细菌方面的优势。【结果】本研究共获得1293株异养细菌,分属于4门7纲14目26科52属119种,其中变形菌门(Proteobacteria)为主导类群。纲水平上,γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)和放线菌纲(Actinobacteria_c)为优势菌群。5种培养基所获得的最优势门都为变形菌门,最优势纲都为γ-变形菌纲,除TCBS培养基优势目是弧菌目(Vibrionales),最优势目都为交替单胞菌目(Alteromonadales)。此外,5种培养基在各分类水平上均体现出不同的选择性。5种培养基在种水平上可培养细菌多样性由高到低依次为R2A、IMA、MBM、TCBS以及IMB。分离自R2A的特有属数目最多,可达10个。随水深增加,可培养异养微生物属的数量呈减少趋势。分得菌株中共有68株为潜在新菌,新菌率在IMA、R2A和MBM中相对较高。【结论】本研究用5种不同培养基从西太平洋海水中获得大量可培养细菌,具有较高的多样性,同时揭示了不同培养基对可培养海洋细菌的选择性。本研究为进一步的生态学研究和分子生物学研究等提供了宝贵的种质资源,也为未来利用改良培养基分离难培养海洋微生物带来启发。     

西太平洋浮游动物种类多样性

西太平洋区是全球海洋生物种源中心,许多类群的最高物种多样性都出现于该区域,因此,在该区开展种类多样性的研究不仅重要和必要,而且具有在跨国尺度上进行综合管理和相互合作的迫切性。本文在西太平洋的浮游动物样品鉴定分类、编目、文献资料整理和分析的基础上,记录和编入西太平洋10个浮游动物类群2,658种(含亚种),隶属于206科675属,其中水螅水母类99科251属697种,栉水母类12科22属59种,浮游软体动物14科35属86种,介形类8科89属416种,桡足类51科156属908种,糠虾类4科58属202种,磷虾类2科8属56种,十足类8科22属105种,毛颚类5科8属48种,被囊类5科26属81种。     

热带西太平洋浮游有孔虫Globigerinoides ruber(白色)的基因型研究及其古海洋学意义

Globigerinoides ruber是最常见的热带-亚热带浮游有孔虫种类,被广泛地应用于古环境重建。本实验通过浮游生物垂直拖网采集热带西太平洋海区目标站位表层200 m以浅水体中的浮游有孔虫,在体视显微镜下挑选出单个活体G.ruber(白色)个体,采用DOC法提取虫体的总DNA,利用有孔虫特异性引物扩增SSU rDNA目的片段。我们通过构建系统发育树研究了G.ruber(白色)基因型多样性,并比较了不同基因型G.ruber(白色)的形态差异和分布特点。ML/BI树显示:在热带西太平洋海区获得的G.ruber(白色)样本中,有两大基因型Type I和Type II,Type I又包括Type Ia、Type Ib2两种类型。Type I和Type II个体的形态特征和栖息环境存在明显差异:Type I个体的三个房室呈显著的球状,主要分布在表层30 m以浅的水体中;Type II个体的三个房室呈扁平的近似球状,主要分布在水深30 m以下的水体中。本工作是对热带西太平洋浮游有孔虫DNA分子数据的重要补充,旨在为古海洋学重建提供更加精确的替代性指标。     

西太平洋热带水域长体翻车鲀鱼卵和仔稚鱼的空间分布及其形态特征

1978年10月利用向阳红5号调查船对西太平洋14°00′-17°00′S、171°00′-174°00′E热带水域进行鱼类浮游生物调查。调查期间共采集到长体翻车鱼卵27粒和仔稚鱼11尾。长体翻车鱼卵集中分布于调查海域东南部的15°28.4′-16°17.3′S、172°43.8′-173°29.0′E海区,而仔稚鱼主要分布于调查海域东南部的15°28.4′-16°17.3′S、172°43.8′-173°29.0′E和西北部的14°29.0′S、171°48.4′E海域。鱼卵和仔稚鱼的密度分别为1-14粒/100m3和1-3尾/100m3。出现鱼卵和仔稚鱼分布海域的水温和盐度分别为25.72-26.22℃、35.10-35.32和25.72-27.02℃、34.80-35.50。鱼卵和仔稚鱼均出现在海洋锋面处。长体翻车鱼卵为圆球型、浮性、卵膜光滑、透明,卵子直径1.40-1.60mm(1.50±0.054mm,n=27),多油球,20-30个,其直径为0.06-0.16mm(0.10±0.064mm,n=27),卵黄均匀无龟裂。当胚胎发育到尾芽期,可数肌节20对,胚体背部和油球表面出现黑色素细胞分布,皮质体壳已初步形成。孵化前,皮质体壳的表面布满了浓密、细微的小泡,唯尾部和胸鳍外,整个胚体被体壳包住。仔鱼的肛前长为1.20mm(全长1.80mm,体长1.68mm)时,体壳已退化脱尽,肛前长为3.20mm(体长4.00mm)时,鱼体上的部分棘开始退化、变小,尾鳍完全退化、消失,尾锥体萎缩成瘤状,腹部的棘与棘之间出现许多锯齿状小刺。卵子的形状和大小、卵膜的结构、油球的数量、黑色素的分布以及体棘的形状和数量等是区别于其它形目鱼类的卵子和仔稚鱼的依据。     

西太平洋挑战者深渊海底浅表层的硅藻软泥

对我国首次在西太平洋挑战者深渊采集的硅藻软泥沉积物开展硅藻分析,结果表明硅藻软泥由数量巨大的大筛盘藻[Ethmodiscus rex(Rattray)Hendey]碎片组成,并伴生有少量热带远洋浮游种类硅藻。硅藻软泥属于大筛盘藻软泥类型,推测可能形成于更新世中后期,代表着大规模E.rex勃发事件发生。其形成机制与冰期时段南极深层水入侵西北太平洋增加水体硅含量、减弱硅藻溶蚀作用,并补充次表层水体硅含量而激发E.rex竞争优势密切相关。本文为理解低纬度海沟区硅藻微体生物随全球气候和区域海洋环境变迁而发生显著变化提供了基础材料。