基于人类信号网络和表达谱数据研究静脉血栓复发机制

目的:静脉血栓是一种高复发风险和高致死率的疾病,其形成和复发的分子机制尚不明确。基于人类信号网络和基因表达谱数据可针对静脉血栓经华法令抗凝治疗后的复发机制进行研究。方法:结合表达谱数据和人类信号网络,设计差异模块筛选策略,通过功能分析、差异表达分析和已知血栓相关基因及药物靶基因的互作关联研究,获得与静脉血栓复发相关的显著差异模块。结果:最终获得8个与静脉血栓复发密切相关的显著差异模块,评估了华法令治疗静脉血栓的效能,提出了联合用药的3种可能途径。结论:应用本文提出的整合筛选策略,能识别与静脉血栓复发相关的模块,探究静脉血栓复发的分子机制和评估华法令的治疗效能。还提供了潜在的联合用药途径,这对治愈血栓、防治血栓复发及复发机制的研究具有重要意义。     

植物水孔蛋白基因PIP1a在爪蟾卵母细胞中的表达和功能测定

水孔蛋白（sopaporins,AQPs）是近年来兴起的一个新的研究领域。它的发现,大大增强了人们对水分进出细胞机理的认识。1992年hatoD等［’1首先证实动物红细胞的CHlffis（channe－fornungmtwtrlselllr）。pro－tein,CHIP）是一种水孔蛋白,并广泛分布在红细胞膜、肾近曲小管中     

基于SNP 互作识别潜在冠心病致病基因

目的:基于全基因组关联分析(Genomewideassociationstudy,GWAS)数据与生物信息学方法,识别冠心病潜在致病基因。方法:利用生物信息学方法和GWAS数据,对单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphisms,SNP)进行疾病风险打分,依据特定距离阈值内的SNP-SNP互作关系,筛选出疾病相关SNP显著风险模块,识别潜在致病基因。结果:设定阈值20kb,经筛选获得279个SNP显著风险模块,映射到79个基因,文献验证率为71.01%。结论:基于SNP互作识别的潜在致病基因,能更加准确的分析冠心病的发生发展过程。     

基于人类信号网络和表达谱数据挖掘动脉粥样硬化相关模块

目的:动脉粥样硬化是一种高致死率的慢性炎症疾病,其发生和发展的机制尚不明确。本文基于人类信号网络和基因表达谱数据对动脉粥样硬化相关模块进行挖掘,以探究其在疾病发生发展中的作用机制。方法:结合人类信号网络和基因表达谱数据,设计显著差异模块筛选策略,通过功能分析,挖掘动脉粥样硬化相关模块,对动脉粥样硬化的致病机制进行研究。结果:基于网络模块的平均表达值改变量,采用两种随机方法,进行显著差异模块筛选,最终获得8个动脉粥样硬化相关的显著差异模块。结论:应用本文提出的整合筛选策略,能识别与动脉粥样硬化相关的模块,获得潜在的致病基因,并从外周血的基因表达改变来探究动脉粥样硬化致病机制,这对动脉粥样硬化的诊断、治疗以及发生发展机制的研究具有重要意义。     

谷氨酰胺对脓毒症患者肠粘膜屏障功能和免疫功能的影响

目的:研究谷氨酰胺对脓毒症患者肠道黏膜屏障功能和免疫功能的影响。方法:将2012年10月至2013年10本院收治的40例脓毒症患者随机分为治疗组和对照组,每组20例。两组患者均给予常规对症治疗,治疗组在此基础上加用谷氨酰胺治疗,对照组接受安慰剂治疗。采用分光光度法监测其血清D-乳酸水平,高效液相色谱法监测尿乳果糖/甘露醇(L/M)值。对比两组肠道黏膜屏障功能和免疫功能指标及ARDS、MODS发生率。结果:治疗后,治疗组ARDS和MODS发生率分别为24.1%,17.2%,均低于对照组的38.9%,33.3%,两组比较差异均有统计学意义(P0.05);治疗14 d后,治疗组D-乳酸及尿L/M水平较对照组明显降低,血清Ig G、Ig M、CD4+和CD4+/CD8+水平均增高,两组比较差异均有统计学意义(P0.05)。结论:谷氨酰胺治疗脓毒性患能明显改善肠道黏膜屏障功能,促进患者免疫功能和营养状态的提高,同时还能够降低患者肠道细菌、内毒素移位。     

NaCl胁迫对小麦抗盐突变体根液包膜H^＋—ATP酶和H^＋—PP酶活性的影响

随着盐胁迫强度（ＮａＣｌ０～１５０ｍｍｏｌ／Ｌ）和时间（０～７２ｈ）的增加,小麦抗盐突变体根液泡膜Ｈ＾＋－ＡＴＰ酶和Ｈ＾＋－ＰＰ酶活性显著增加,虽然野生型酶活性在盐胁迫下也有增加,但其增加的幅度显著低于突变体,Ｈ＾＋－ＰＰ酶活性的差异更为显著。Ｈ＾＋－ＡＴＰ酶和Ｈ＾＋－ＰＰ酶的最适ｐＨ值在两者之间以及盐胁迫前后均无改变,分别为７．０和８．０。无盐胁迫下野生型液胞泡５８ｋＤ蛋白带缺失,盐胁迫下这一蛋     

整合冠心病风险SNPs功能及分子网络特征筛选疾病易感基因

目的:冠心病(Coronary Heart Disease,CHD)是一种由多因素(遗传因素、环境因素以及它们之间的相互作用)引起的复杂疾病。本文从遗传因素和分子互作模式识别新的冠心病易感基因。方法:结合冠心病群体遗传SNPs数据和PPI数据,通过群体遗传数据的风险评估、功能SNPs的判定和PPI网络基因的分类,以功能SNPs属性、网络拓扑属性和基因功能属性为特征,利用两步分类的方法筛选新的冠心病易感基因。结果:获得了69个新的冠心病易感基因,其中43个被文献证实与冠心病的发生发展密切相关,且识别的新的易感基因注释的KEGG通路中有很多是已知的易感基因所没有注释到的,如MAPK signaling pathway,Calcium signaling pathway,Focal adhesion和Chemokine signaling pathway等,其中Chemokine signaling pathway被证实是CHD发展的关键通路。结论:应用本文提出的整合筛选策略,能识别与冠心病相关的新的易感基因,可为冠心病的预防、诊断和治疗提供新的研究方向。     

基于纳米信号标签的表面增强拉曼散射在病原菌检测中的应用

表面增强拉曼散射(surface-enhanced Raman scattering,SERS)技术由于其灵敏度高、检测速度快、高特异性和无损等优点,在病原菌检测领域受到了广泛的关注。主要总结了近年来基于纳米信号标签的SERS方法在检测病原菌领域中的研究进展,并介绍了多功能SERS检测平台的构建及在病原菌检测中的应用。最后,对SERS这一技术作为实时、高效和可靠的病原菌检测工具的未来发展进行了展望。     

珍珠黄杨矮化基因BsGAI2的克隆及功能分析

GA信号转导途径或生物合成受阻是导致植物矮化的重要因素,而DELLA蛋白是GA信号传导通路中一类重要的负调节因子。本研究利用同源克隆和RACE技术,从珍珠黄杨中克隆得到BsGAI2基因的c DNA序列,全长为2305 bp,包括1836 bp完整的ORF。实时荧光定量表达分析表明,BsGAI2基因在珍珠黄杨茎中表达量最高,在根中表达量最低;BsGAI2转基因烟草呈明显矮化,节间变短,长势较慢,延迟开花等特征。利用GFP荧光检测方法鉴定转化型烟草,发现转化苗的叶、茎中均有荧光信号,并且茎木质部有明亮富集的荧光信号。这些结果均表明BsGAI2基因可能在珍珠黄杨茎节间缩短导致矮化的过程中扮演重要角色。本研究分析了BsGAI2基因编码蛋白的理化性质和功能鉴定,为今后进一步研究BsGAI2基因及DELLA蛋白家族的功能提供了理论依据。