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单级自养脱氮系统中厌氧氨氧化菌的分子生物学鉴定 总被引:3,自引:0,他引:3
对具有厌氧氨氧化作用的细菌进行更深入的分析有助于了解该菌在生物脱氮过程的应用。对稳定运行、氨氮转化率及总氮去除率分别达到90%及80%左右的单级自养脱氮系统的底部取活性污泥,采用分子生物学方法提取活性污泥细菌总DNA,利用特异引物Pla46rc/Amx820对单级自养脱氮系统中的厌氧氨氧化菌16S rDNA基因进行PCR扩增。扩增产物经克隆、测序及BLAST分析,结果表明该单级自养脱氮系统中存在的厌氧氨氧化菌与Candidatus Kueneniastuttgartiensis和Candidatus Brocadia anammoxidans的16S rDNA序列同源性达99%,进化分析证明与Candidatus Kuenenia stuttgartiensis进化上较为接近。 相似文献
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水稻高叶绿素含量基因DET1 cDNA的克隆、生物信息学分析及超表达载体的构建 总被引:1,自引:0,他引:1
提高水稻叶片中叶绿素含量可以提高光合作用效率。以水稻高叶绿素含量突变体为材料,在前期精细定位的基础上,克隆了高叶绿素含量基因DET1(DE-ETIOLATED 1)cDNA。测序结果显示:DET1基因全长cDNA为1536 bp,由11个外显子组成,编码512个氨基酸。与野生型珍汕97B相比,DET1基因在第7个外显子上有T-C的转换,该转换引入了一个EcoR I酶切位点,并导致第328位的亮氨酸(L)改变为丝氨酸(S),且突变位点处于高度保守区域内。DET1基因的氨基酸序列与玉米等其它高等植物的氨基酸序列同源性高达62%以上。利用生物信息学方法对DET1基因的序列、进化树、理化性质及亲疏水性等进行分析,并构建了水稻超表达载体pCUPHN-DET1,为水稻高叶绿素含量突变基因DET1的功能验证奠定基础。 相似文献
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β-甘露聚糖酶产生菌的分离、鉴定及产β-甘露聚糖酶最适条件的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
以采集的土壤样品为试验材料,经过富集培养及分离纯化,筛选出2株产β-甘露聚糖酶的菌株.采用摇瓶培养分别测定其酶活力,其中1株菌株酶活力较高,酶活力达50.36 U/ml.生理生化性质鉴定及16S rDNA序列相似性结果表明该菌为假单孢菌(Pseudomonas sp.).产酶的最适条件研究发现,1 g/100 ml玉米粉,2 g/100 ml魔芋粉,pH6.0,32℃为最优产酶条件,酶活力达185.37 U/ml,是优化前的3.68倍.该菌产酶迅速,培养12 h后已达产酶高峰.粗酶的性质研究发现,该酶是一种酸性的甘露聚糖酶,作用的最适pH为4.0,最适反应温度为55℃;该酶的稳定性较好,在pH4.0~6.0、温度为40~55℃保持较好的稳定性. 相似文献
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植物病原细菌Ralstonia solanacearum GMI1000中分泌蛋白信号肽分析 总被引:2,自引:0,他引:2
利用SignalP 3.0、TMHMM 2.0、TargetP 1.01、LipoP 1.0和PSORTb蛋白分析软件并结合L值计算,对植物病原细菌Ralstonia solanacearum GMI1000菌株基因组中的全部3 440个ORFs进行了分析预测,确定其中186个ORFs所编码蛋白质的N-端有信号肽序列,且它们的氨基酸残基相对保守.其中134条具有分泌型信号肽,22条具有RR-motif型信号肽,30条具有信号肽酶Ⅱ型信号肽.对各类信号肽及其结构域的长度作了系统的分析.未发现Prepilin-like信号肽和细菌素和信息素信号肽. 相似文献
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