DNA超甲基化在小麦耐盐胁迫中的作用

运用高效液相色谱技术测定小麦(Triticum aestivumL.)耐盐品种‘德抗961’和盐敏感品种‘豫麦34’盐胁迫后叶片和根DNA中5-甲基胞嘧啶百分含量的变化,结果表明,经150 mmol/L NaCl处理6 d后,‘德抗961’叶片和根DNA中的5-甲基胞嘧啶的百分含量显著下降,但经150 mmol/L NaCl处理10 d后,耐盐品种‘德抗961’叶片和根DNA中的5-甲基胞嘧啶的百分含量都比盐敏感品种‘豫麦34’的高。由此推测DNA超甲基化可能是植物耐盐机制的一部分。     

水稻基因组中的小RNA

水稻是一种很重要的模式植物, 其基因组框架图的完成将对植物生物学和遗传进化学等学科的研究做出巨大贡献. 目前, 水稻科研工作者们在绘制水稻完成图谱的同时, 也正在对水稻中基因和非编码区序列进行着深入的研究. 非编码RNA在生物系统中有着很重要的作用. 小RNA是非编码RNA的一种, 我们在水稻基因组中寻找已知小RNA序列, 并且在拟南芥、玉米、酵母、线虫、老鼠和猪这6个物种中一一进行比对, 结果在552个小RNA的数据库中找到160个小RNA, 它们存在于水稻的108个Scaffold中, 其中绝大部分(99.41%)都位于基因预测的内含子区. 19个小RNA只存在于水稻基因组中. 发现了两段U14小RNA保守片段, 一段是位于同系列的5个小RNA ZMU14SNR9(s)中, 它们只出现在3个植物物种上, 其中86%序列都是和水稻、拟南芥、玉米重复的序列; 另一段保守的小RNA是XLHS7CU14, 它出现在除猪以外的其他6个物种中. 所有这些结果显示小RNA在植物和动物之间并没有明显的界限.     

芋ISSR-PCR扩增反应体系的建立

目的:获得清晰可靠、重复性较好的ISSR-PCR扩增反应体系,应用于芋种质资源进行遗传多样性的研究中.方法:以芋的幼叶提取基因组DNA为材料,采用正交试验设计L16(45),从模板DNA浓度、引物浓度、Mg2+浓度、dNTPs浓度及TaqDNA聚合酶的用量5因素4水平出发,构建芋最佳反应体系.结果:芋ISSR-PCR的最佳反应体系为:在25μl的反应体系中,40ng DNA模板、0.4μmol/L引物浓度、2.5 mmol/L Mg2+、0.2 mmol/L dNTPs、1 U Taq DNA聚合酶.结论:利用芋种质资源对最佳反应体系的验证,结果显示该反应体系具有扩增稳定性.     

Small RNA in rice genome

Rice has many characteristics of a model plant. The recent completion of the draft of the rice genome represents an important advance in our knowledge of plant biology and also has an important contribution to the understanding of general genomic evolution. Besides the rice genome finishing map, the next urgent step for rice researchers is to annotate the genes and non-coding functional sequences. The recent work shows that noncoding RNAs (ncRNAs) play significant roles in biological systems. We have explored all the known small RNAs (a kind of ncRNA) within rice genome and other six species sequences, including Arabidopsis, maize, yeast, worm, mouse and pig. As a result we find 160 out of 552 small RNAs (sRNAs) in database have ho-mologs in 108 rice scaffolds, and almost all of them (99.41 %) locate in intron regions of rice by gene predication. 19 sRNAs only appear in rice. More importantly, we find two special U14 sRNAs: one is located in a set of sRNA ZMU14SNR9(s) which only appears in three plants,     

慈姑种质资源表型性状多样性分析

对保存在国家种质武汉水生蔬菜资源圃内慈姑41份地方品种、26份野生资源的遗传多样性进行了分析。结果表明:各性状多样性指数均较大,数量性状遗传多样性指数(1.840～2.039)高于质量性状(1.033～1.382),说明这些慈姑种质资源具有广泛的遗传多样性,且数量性状遗传变异更丰富;与慈姑种质资源产品相关的性状变异系数较高(24.16%～62.01%),利用现有资源选育球茎大、产量高的品种成为可能。基于慈姑资源13个表型性状的聚类分析,将67份慈姑种质资源分为3类,第Ⅰ类为野生资源类群,该类可进一步分为3个亚类,第Ⅱ类为栽培黄慈姑类群,第Ⅲ类为栽培乌慈姑类群,该类亦可进一步分为2个亚类,大类或亚类间亲缘关系较远,在慈姑杂交育种时宜选择类群间或者亚类间的材料为亲本。     

Small RNA in rice genome

Rice has many characteristics of a model plant. The recent completion of the draft of the rice genome represents an important advance in our knowledge of plant biology and also has an important contribution to the understanding of general genomic evolution. Besides the rice genome finishing map, the next urgent step for rice researchers is to annotate the genes and noncoding functional sequences. The recent work shows that noncoding RNAs (ncRNAs) play significant roles in biological systems. We have explored all the known small RNAs (a kind of ncRNA) within rice genome and other six species sequences, including Arabidopsis, maize, yeast, worm, mouse and pig. As a result we find 160 out of 552 small RNAs (sRNAs) in database have homologs in 108 rice scaffolds, and almost all of them (99.41%) locate in intron regions of rice by gene predication. 19 sRNAs only appear in rice. More importantly, we find two special LJ14 sRNAs: one is located in a set of sRNA ZMU14SNR9(s) which only appears in three plants, 86% sequences of them can be compared as the same sequence in rice, Arabidopsis and maize; the other conserved sRNA XLHS7CU14 has a segment which appears in almost all these species from plants to animals. All these results indicate that sRNA do not have evident borderline between plants and animals.     

籼稻细胞色素P450超基因家族成员及其EST证据

将预测的籼稻基因同289个已知的拟南芥细胞色素P450基因进行蛋白质序列比对, 在籼稻(Oryza sativa L. ssp. indica)工作框架草图中找到了528个可能的细胞色素P450基因, 初步认定上述籼稻P450基因来自于已在拟南芥中确定的40个P450基因家族. 比较拟南芥和籼稻的细胞色素P450s在基因家族中的分布, 发现这两种植物P450基因的家族分布规律总体相似, 但也有不同, 例如: CYP71, CYP72, CYP76, CYP89, CYP94, CYP709等家族的成员在籼稻中远远多于拟南芥的; CYP705家族的成员在籼稻中没有, 但在拟南芥中却多达33个. 另外, 发现籼稻CYP71和CYP81家族的成员在基因组中成串联重复排列, 它们可能是进化过程中基因复制的结果. 进一步将这些籼稻P450基因的DNA序列同籼稻表达序列标签(expression sequence tags, ESTs)进行核酸序列比对, 为263个可能的籼稻P450s找到了ESTs的证据, 说明这些基因在转录水平上确实有所表达.     

胃癌患者血清CA125、CA724、CEA、CA199水平的表达及与临床病理特征的关系研究

目的:研究胃癌患者血清糖链抗原125(CA125)、糖链抗原724(CA724)、癌胚抗原(CEA)、糖链抗原199(CA199)水平的表达及与临床病理特征的关系。方法:选取2016年5月-2017年8月我院收治的胃癌患者94例记为胃癌组,胃部良性病变患者82例记为良性病变组,另取同期于我院接受体检的健康志愿者80例记为对照组。分别测定三组受试者血清CA125、CA724、CEA、CA199水平,并分析上述指标与胃癌患者临床病理特征的关系,并观察胃癌患者各指标单独检测和联合检测的阳性率。结果:三组受试者血清CA125、CA724、CEA、CA199水平整体比较差异有统计学意义(P0.05),胃癌组、良性病变组、对照组的血清CA125、CA724、CEA、CA199水平呈逐渐降低趋势,两两对比差异有统计学意义(P0.05)。不同性别的胃癌患者CA125、CA724、CEA、CA199水平比较差异无统计学意义(P0.05),年龄60岁、TNM分期为Ⅲ-Ⅳ期、肿瘤大小≥5 cm2的胃癌患者CA125、CA724、CEA、CA199水平均高于年龄≤60岁、TNM分期为Ⅰ-Ⅱ期、肿瘤大小5 cm2的胃癌患者,差异有统计学意义(P0.05)。联合检测的胃癌阳性率高于CA125、CA724、CEA、CA199单独检测,且CA724单独检测高于CA125、CEA、CA199单独检测,差异有统计学意义(P0.05)。结论:胃癌患者血清CA125、CA724、CEA、CA199水平较高,与患者的年龄、TNM分期、肿瘤大小等因素有关,且联合检测的胃癌检出率较高,可为胃癌的早期诊断提供指导作用。