基于乒乓算法的复杂疾病标志物识别

目的:生物标志物是标识系统、器官、组织等改变或可能发生改变的生化指标,具有非常广泛的临床应用。本文希望从高通量数据出发,提出一种新的研究复杂疾病标志物的方法。方法:以"组学"数据为研究对象,利用乒乓算法构建lnc RNA-mRNA交互网络,通过随机游走算法计算选出复杂疾病的生物标志物,并将其与t检验结果比较。结果:将本文方法运用于食管癌标志物的识别,得出与食管癌发生和发展过程相关的14个lnc RNA(CCAT1、MEG3、Snhg1、MALAT1、HOTAIR、UCA1、PVT1、CASC9、LOC100130476、TUG1、BC200、POU6F2-AS2、TP73-AS1和ZEB1-AS1)和12个mRNA(SPARC、CMTM7、Sph K1、NANOG、LOXL2、HMGCS2、FZD7、PTOV1、CADM1、CTHRC1、MGMT和RECK)。对比显示,识别出t检验未识别出的4个lnc RNA(BC200、POU6F2-AS2、TP73-AS1和ZEB1-AS1)和3个mRNA(CADM1、Sph K1和RECK)。结论:该方法能够更有效的预测复杂疾病相关的标志物。     

水稻矮脆突变体dwf1的特性与基因定位

矮脆突变体dwf1(dwarf and fragile 1)来源于EMS诱变处理的籼型恢复系缙恢10号,主要表现为根、茎、叶、叶鞘、子粒等器官特别脆,同时植株变矮、叶片披垂。株高、穗长、结实率、节间长以及千粒重有不同程度降低,细胞壁中纤维素和木质素含量下降、半纤维素含量增加,机械强度下降。茎秆表面锯齿状突起尖锐,薄壁细胞较野生型小、细胞大小不一致、排列紊乱,细胞形状不规则、长度稍有变短。该突变性状受一对隐性核基因控制,位于第9染色体上标记Ind6与Ind4之间,dwf1相对于野生型在LOC_Os09g25490第7外显子上有一个碱基的错义突变,导致氨基酸由半胱氨酸突变为精氨酸,该突变发生在基因的高度保守区域内。dwf1对深入研究水稻变矮变脆机制具有重要意义。     

不产氧光合细菌色素蛋白复合体研究进展

摘要: 色素蛋白复合体是光合生物进行光合作用维持生命活动最重要结构基础。目前不产氧光合细菌色素蛋白复合体仍是最具前沿研究领域。本文概述了不产氧光合细菌各种属色素蛋白复合体研究现状,着重对光反应中心色素蛋白复合体（reaction center,RC）和捕光色素蛋白复合体（light-harvesting complex,LH）,尤其是新型捕光色素蛋白复合体LH3和LH4的组成、精细结构、蛋白同源性和功能进行了述评,并就研究中存在的问题和发展趋势进行了讨论。     

超极化激活的环核苷酸门控性阳离子通道（HCN）与疾病的相关性

超极化激活的环核苷酸门控的阳离子通道(hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gate cation channel,HCN)是一种特殊的阳离子通道,存在于神经细胞、小肠间质细胞、窦房结细胞或心脏细胞等具有自律性的细胞膜上,是产生过度激活正离子电流的结构基础,被认为是起搏细胞的重要特征。HCN离子蛋白通道不但与细胞凋亡以及电流传导有着密切关系,而且还与多种生命活动过程密切相关,近年来,已涉及到疼痛、癫痫、心律失常、消化道系统等许多疾病,特别是有关神经系统方面的疾病,下面将超极化激活的环核苷酸门控性阳离子通道(HCN)与疾病的关系综述如下。