极小种群野生植物独龙江空竹遗传多样性研究

目的：了解云南省极小种群野生植物独龙江空竹(Cephalostachyum mannii)种质资源的遗传结构和遗传多样性。方法：对野外采集到的30个独龙江空竹个体进行RAD测序，通过质控获取高质量单核苷酸多态性位点(SNPs)，利用生物信息学软件进行遗传结构和遗传多样性分析。结果：(1)筛选过滤共得到66 339个高质量SNP位点，SNP转换与颠换的比值(Ts/Tv)为1.75，转换大于颠换；(2)系统发育树分析将独龙江空竹划分为四个支系，主成分分析和主成分判别分析显示其没有明显的分组，群体结构分析显示其最优分群数为1;(3)通过对独龙江空竹四个支系进行遗传多样性分析发现，第Ⅰ支系遗传多样性相对较高，但物种水平上独龙江空竹遗传多样性水平较低(PPL=16.24%,Ho=0.217,He=0.252，π=0.257,F_is=0.157)。结论：分布于云南省的独龙江空竹具有较低的遗传多样性，没有明显的遗传结构，应加强对独龙江空竹天然种群的保护。