云南高黎贡山发现僜湍蛙和察隅湍蛙

2021年4和5月及7和8月在云南省高黎贡山开展两栖爬行动物调查过程中,采集到无尾目（Anura）蛙科（Ranidae）湍蛙属（Amolops）标本8号,通过形态学与分子系统学鉴定为僜湍蛙（Amolops deng）和察隅湍蛙（A. chayuensis）,为云南省两栖动物分布新纪录种。僜湍蛙雌性体长63.1 ~ 68.5 mm（n = 3）,雄性体长49.3 ~ 52.9 mm（n = 3）,头长大于头宽,鼓膜明显且纵径大于横径,掌突三个,颞褶不显,背侧褶直达胯部,后肢前伸贴体时胫跗关节超过吻端,形态特征与模式标本基本一致;察隅湍蛙雄性体长44.7 ~ 44.8 mm（n = 2）,具咽侧下外声囊,颞褶及背侧褶明显,前后肢均具褐色条纹,形态特征与模式标本基本一致。基于线粒体16S rRNA基因和COI基因片段进行系统发育分析表明,僜湍蛙和察隅湍蛙均和其模式产地西藏的序列聚成单系支。此外,基于16S rRNA计算本次采集的标本与模式产地西藏的序列间遗传距离均较小,僜湍蛙是0.8% ~ 1.2%,察隅湍蛙是0.2%。综上,确定云南高黎贡山采集到的两种湍蛙分别是僜湍蛙和察隅湍蛙。僜湍蛙此前记录仅分布于西藏察隅县和墨脱县,察隅湍蛙仅分布于西藏察隅县和八宿县,僜湍蛙在福贡县和贡山县及察隅湍蛙在贡山县的分布为首次记录;本研究进一步更新了察隅湍蛙分布的海拔海拔范围,较此前纪录低1 385 m高至2 884 m,这提示其有更广阔的生态位。     

一种检测储存喷气燃料中特征真菌的新方法——LAMP-LFD

利用环介导等温扩增(LAMP)与横向流动试纸快速检测技术(LFD)相结合,以Amorphotheca resinae的18S rRNA基因为靶序列,设计1套LAMP引物,建立了反应温度63℃、时间35 min。用喷气燃料中曾发现的4株真菌和A.resinae作为特异性试验菌株,LAMP-LFD法检测只有A.resinae呈阳性反应。A.resinae基因组DNA检测灵敏度为26 fg/μL;用已建立的LAMP-LFD方法对9个喷气燃料样品进行检测,其中有6个样品被检出存在A.resinae。结果表明该方法用于快速检测喷气燃料中的A.resinae耗时短、操作简便、特异性强、灵敏度高,有望用于为检测喷气燃料中特征真菌A.resinae的新方法。     

喷气燃料中污染微生物检测方法概况

微生物污染不仅降解喷气燃料,还严重威胁储存和飞行安全.喷气燃料中污染微生物的检测是有效治理微生物污染的前提.基于此,本文将喷气燃料中污染微生物检测方法分为传统法、分析生物学法以及分子生物学方法,并对三种方法优缺点进行了详细介绍.最后对喷气燃料中污染微生物检测方法进行了展望.     

ATP生物发光法检测喷气燃料中真菌的污染程度

目的:以ATP生物发光法为基础,建立一套可以快速检测喷气燃料中真菌污染程度的方法。方法:筛选喷气燃料中的枝孢霉菌、曲霉菌及青霉菌这3种主要污染真菌的ATP释放条件,比较3种ATP荧光素-萤光素酶体系的标准荧光曲线,考察ATP生物发光法与传统平板计数法计量主要污染真菌数量的相关性。结果:以表面活性剂苯扎氯铵(BAC)作为裂解液提取ATP效果最佳,最佳作用浓度与作用时间分别为0.15%和30 s,筛选得到的荧光素-萤光素酶反应体系有良好的荧光效率,其检测限可达10~(-15)mol ATP,用ATP生物发光法与传统平板计数法计量主要污染真菌的数量,两者相关系数均在0.96以上,具有良好的相关性。结论:ATP生物发光法可以用于检测喷气燃料中真菌污染程度,且能将检测时间缩短至10 min内,适用于现场快速检测,具有良好的应用前景。     

水稻CMS相关基因在稻属AA基因组中的分布及其单核苷酸多态性

水稻线粒体基因组嵌合基因orf79 和 orfH79分别被认为与BT-型和HL-型水稻CMS有关, 两者具有98%的同源性, 并且其DNA序列只存在4核苷酸的差异。对于这两个嵌合基因, 前者来源于栽培稻(Oryza. sativa L.), 而后者则来源于普通野生稻(O. rufipogon Griff.)。这意味着orf79/ orfH79可能在广泛分布于稻属AA基因组中。为了调查orf79/ orfH79在稻属物种中的分布和变异, 190份栽培稻品系[包括156份亚洲栽培稻(O. sativa var. landrace)和34份非洲栽培稻(O. glaberrima)]以及104份稻属AA基因组野生稻品系(包括O. rufipogon、O.nivara、O. glumaepatula、O. barthii、O. longistaminata和O. meridionalis 6个种), 被用于PCR扩增检测。31份具有控制粤泰A和笹锦A的特异片段的稻属AA基因组水稻品系被检测出。所有特异片段均被回收并测序, 基于DNA 序列的聚类结果显示31份水稻材料被分成了两组, 分别代表为BT-型和HL-型水稻不育细胞质组群。结果也进一步表明: HL-型水稻CMS胞质主要分布于一年生的O. nivara中; BT-型水稻CMS胞质可能来源于栽培稻变种或多年生野生稻O. rufipogon。     

极小种群野生植物独龙江空竹遗传多样性研究

目的：了解云南省极小种群野生植物独龙江空竹(Cephalostachyum mannii)种质资源的遗传结构和遗传多样性。方法：对野外采集到的30个独龙江空竹个体进行RAD测序，通过质控获取高质量单核苷酸多态性位点(SNPs)，利用生物信息学软件进行遗传结构和遗传多样性分析。结果：(1)筛选过滤共得到66 339个高质量SNP位点，SNP转换与颠换的比值(Ts/Tv)为1.75，转换大于颠换；(2)系统发育树分析将独龙江空竹划分为四个支系，主成分分析和主成分判别分析显示其没有明显的分组，群体结构分析显示其最优分群数为1;(3)通过对独龙江空竹四个支系进行遗传多样性分析发现，第Ⅰ支系遗传多样性相对较高，但物种水平上独龙江空竹遗传多样性水平较低(PPL=16.24%,Ho=0.217,He=0.252，π=0.257,F_is=0.157)。结论：分布于云南省的独龙江空竹具有较低的遗传多样性，没有明显的遗传结构，应加强对独龙江空竹天然种群的保护。