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新疆石竹属野生种核糖体DNA的ITS序列与亲缘关系 总被引:16,自引:1,他引:15
新疆是我国石竹属植物分布和分化中心,种质资源丰富。通过采用PCR直接测序法,对新疆石竹属(Dianthus)植物野生种共8个种及外类群(Lychnis coronata Thunb)rDNA的ITS区(包括ITS-1,5.8S,rDNA和ITS-2)进行序列测定。研究结果说明,新疆石生属植物的ITS序列总长度为617-621bp,长度变异较小,仅相差4bp,种间序列同源性很高,达97.6%-99.8%,外类群的序列同源性为80%左右。ITS区序列在石竹属内是相当保守的,石竹属物种间序列变异位点基本上是转移多于颠换,且转移率较高,转换/颠换率为1.0-3.0。系统地位和亲缘关系分析表明分布于中国的石竹属植物3个组即齿瓣组(sect.Barbulatum Williams)和石竹组(sect.Dianthus),遂瓣组(sect.Fimbriatum Williams)的亲缘关系较远,而sect.Dianthus与sect.Fimbriatum Williams的亲缘关系较近。ITS系统发育树揭示了石竹组起源早于遂瓣组和齿瓣组,其结果与传统形态学论述存在很大差异。 相似文献
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广义青篱竹属(Arundinaria)核糖体DNA ITS序列及亲缘关系研究 总被引:8,自引:0,他引:8
利用PCR扩增产物直接测序的方法分析广义青篱竹属(Arundinaria)中有关争议类群的代表种或模式种(毛竹为外类群)等18种竹种的核糖体DNA内转录间隔区(Internal Transcribed Spacers,ITS)序列。通过最简约性分析产生的ITS系统发育树表明,供试竹种形成一个自然的单系类群,这说明广义青篱竹属中这些不同的类群归属青篱竹属是合理的。17种竹种可聚为2大分支:其中斑苦竹(A,oleosa)、仙居苦竹(A.hsienchuensis)、茶秆竹(A.amabilis)、长叶苦竹(A.chino)、苦竹(A.amara)、宜兴苦竹(A.yixingensis)、菲白竹(A.fortunei)、翠竹(A.pygmaea)为一个分支;而大明竹(A.graminea)、巴山木竹(A.fargesii)、冷箭竹(A.faberi)、凤竹(A.hupehense)、鼓节矢竹(Pseudosasa japonica cv.Tsutsumiana)、矢竹(Pseudosasa japonica)、短穗竹(Brachystachyum densiflorum)、肿节竹(A.oedogonata)、少穗竹(A.sulcata)组合在另一分支。ITS系统发育树还表明,大明竹与巴山木竹、鼓节矢竹与矢竹、少穗竹与短穗竹和肿节竹关系极为密切,均得到较高的Bootstrap(分别为99%、100%和87%)的支持;茶秆竹与仙居苦竹关系非常密切,茶秆竹可归隶到青篱竹属中;翠竹和菲白竹关系密切,且与苦竹类竹种分为两个分支。 相似文献
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新疆杨高效遗传转化系统的建立 总被引:9,自引:0,他引:9
选择新疆杨(Populus alba L.var.pyramidalis Bge.)为遗传转化受体材料,为建立根癌农杆菌介导新疆杨高效遗传转化系统,从预培养时间、侵染时间、共培养时间、添加乙酰丁香酮(AS)的时机、共培养培养基中添加乙酰丁香酮浓度、侵染菌液的制备方法、外植体继代方式等7个方面优化筛选。结果显示较合适的转化系统为:预培养8h,农杆菌菌液(OD600=0.4)侵染15min,共培养5d,侵染菌液的最优制备方法是液体培养活化农杆菌2次加离心收集菌体重悬,共培养培养基中添加乙酰丁香酮80μmol/L。新疆杨叶盘转化频率可达38.10%。 相似文献
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美洲黑杨抗黑斑病基因的RAPD标记筛选和连锁分析 总被引:7,自引:0,他引:7
以美洲黑杨(Populus deltoides Bartr.cv.“Lux”(I-69/55))为母本,欧美杨(P.euramericana cv.I-45)为父本得到的F1为材料,其中I-69对黑斑病表现为高度抗病,I-45为高度感病。利用分离群体混合分析(bulked segregrants analysis,BSA)技术建立两个DNA池(感病池和抗病池),筛选出了与抗黑斑病性状基因相连锁的RAPD标记:OPAI17―1550、OPAI13―900。利用选择性基因型分析法进行标记―抗黑斑病基因连锁分析,两标记与抗黑斑病基因遗传距离分别为29.9cM和37.4cM。
Identification of Markers Linked to Resistance Locus of Marssonina Leaf Spot in Poplars by Bulked Segregant Analysis(BSA)
ZHANG Bo1,HUANG Min-ren1,ZHUGE Qiang1,HAN Zheng-min1,YIN Tong-ming1,PAN Hui-xin1,ZHU Li-huang2,WU Rong-ling3,WANG ming-xiu1
1.The Key Laboratory of Forest Tree Genetic Engineering,Nanjing Forestry University,Nanjing,210037,China;
2.The Institute of Genetics and Developmental Biology,Chinese Academy of Science,Beijing 100101,China;
3.Department of Statistics,University of Florida,Gainesville,Florida 32611,USA
Abstract:DNA markers linked to resistance locus of Marssonina leaf spot in poplars were found by bulked segregant analysis(BSA).The bulks consisted of individual with a extreme phenotype taken from a population of 91 F1 clones,which is a progeny of Populus deltoides Bartr.cv.“Lux”(I-69/55)(Resistance) and P.euramericana cv.I-45(Susceptible).Out of 114 RAPD primers,four markers showed polymorphisms between the resistance-bulk and the susceptible-bulk.By using selective genotype linkage analysis,OPAI17-1550 and OPAI13-900 were found linked to the resistance locus.The genetic distances between the two markers and the resistance locus were 29.9cM and 37.4cM,respectively.
Key words:BSA; RAPD; selective genotype analysis; Marssonina leaf spot 相似文献
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转基因杨树对杨小舟蛾体内三种保护酶活力的影响 总被引:7,自引:0,他引:7
用转Bt单基因(FB56)和转Bt+CpTI双价基因(D18)杨树叶片饲喂杨小舟蛾Micromelalopha troglodyta (Graeser),采用酶活力测定方法研究了转基因杨树对幼虫中肠和血淋巴三种保护酶(SOD、CAT 和POD)活力的影响。结果表明,幼虫中肠SOD活力显著升高,而CAT和POD活力受到了显著抑制。用FB56处理24 h,杨小舟蛾幼虫中肠SOD活力增加了41.7%,与对照有显著差异;而用D18处理,SOD活力增加了25.3%,与对照差异不显著。用FB56处理24 h,中肠CAT活力受到显著抑制,36 h后抑制能力不强;而用D18处理,CAT活力全程受到显著抑制。用FB56和D18处理36 h,中肠POD活力均受到显著抑制,分别比对照下降70.1%和898%。转基因杨树通过扰乱幼虫中肠SOD、CAT和POD三种保护酶的动态平衡,使虫体内自由基清除遇到了障碍,从而对其产生了毒害作用。转双价基因杨树对幼虫中肠保护酶的毒害作用大于转单基因杨树。用2种转基因杨树叶片饲喂杨小舟蛾幼虫后其血淋巴SOD和POD活力均没有受到显著影响,但CAT活力均显著高于对照,转基因杨树对血淋巴保护酶系统的影响小于对中肠保护酶系统的影响。 相似文献
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转天麻抗真菌蛋白GAFP基因烟草的获得及离体抑菌活性检测 总被引:7,自引:0,他引:7
通过根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)介导,采用叶盘法将天麻(GastrodiaelataBl.)抗真菌蛋白基因GAFP转入烟草(NicotianatabacumL.),PCR和Southern blotting分析证明已将GAFP基因整合进烟草植株。体外抑菌实验表明GAFP转基因的烟草植株对真菌瑞氏木霉(Trichodermareesei)表现出一定的抑菌活性。 相似文献
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用ITS序列研究杨属各组之间的系统发育关系 总被引:20,自引:0,他引:20
杨树是重要的工业用材树种。我国杨树遗传资源丰富 ,分布范围广泛 ,不少种为我国特有。开展杨属系统发育和分子进化研究 ,对丰富的杨树遗传资源保存和利用有着重大意义。杨属 (Populus)全世界约 10 0余种 ,属下通常分 5个组[1] 。胡志昂等[2 ] 对杨属不同组间的过氧化物酶同工酶进行了研究 ;李宽钰等[3] 利用RAPD标记技术对白杨组、青杨组、黑杨组 2 0个种作了遗传分析。但是在杨属系统分类上还存在着许多混乱 ,同物异名、同名异物现象相当普遍。本文以杨属 5个派主要代表种为材料 ,用PCR产物直接测序法测定杨树ITS序列 ,… 相似文献