胶原样分子与肿瘤关系研究进展

细胞外基质不仅维持着体内细胞微环境的稳定,还在细胞的正常生长、增殖以及细胞之间的信号传导中起着重要作用。肿瘤发生时,基质中的分子组分发生了改变,这些改变朝着有利于肿瘤细胞生长侵袭的方向发展。在这个过程中,细胞外基质的主要成分在合成和分解上发生巨大变化,胶原分子便是其中之一,胶原分子作为细胞外基质中的主要成分,对细胞的黏附、运动、迁移等活动起着重要作用。随着研究的深入,发现越来越多的胶原分子参与了肿瘤的发生发展。基质中还存在着一些分子,它们在结构上和胶原蛋白一样含有三螺旋胶原结构域,在肿瘤的发生发展过程中同样发挥着重要作用。本文就包括胶原分子在内的含有胶原结构的分子在肿瘤中的作用做一综述。     

药物基因组学对癌症化疗的启示

药物基因组学的研究任务是阐明个体差异的遗传基础,并利用这些遗传信息来预测药物的疗效、毒性和安全性。绝大多数的癌症化疗药物在治疗效果及正常组织毒性上的个体差异一直广为关注。不仅诸多临床因素(如年龄、性别、饮食、药物相互作用等)与药物反应和治疗效果有关,而且药物分布(转运和代谢)和药物靶标的遗传变异同样可导致癌症治疗上的差异。本篇综述主要讨论当前和将来药物基因组学在临床癌症治疗和抗癌药物研制方面的应用。     

Computational analysis and prediction for exons of PAC579 genomic sequence

To isolate the novel genes related to human hepatocellular carcinoma (HCC), we se-quenced P1-derived artificial chromosome PAC579 (D17S926 locus) mapped in the minimum LOH (loss of heterozygosity) deletion region of chromosome 17p13.3 in HCC. Four novel genes mapped in this genomic sequence area were isolated and cloned by wet-lab experiments, and the exons of these genes were located. 0-60 kb of this genomic sequence including the genes of interest was scanned with five different computational exon prediction programs as well as four splice site recognition programs. After analyzing and comparing the computationally predicted results with the wet-lab experiment results, some potential exons were predicted in the genomic sequence by using these programs.     

Computational analysis and prediction for exons of PAC579 genomic sequence

To isolate the novel genes related to human hepatocellular carcinoma (HCC), we sequenced P1-derived artificial chromosome PAC579 (D17S926 locus) mapped in the minimum LOH (loss of heterozygosity) deletion region of chromosome 17p13.3 in HCC. Four novel genes mapped in this genomic sequence area were isolated and cloned by wet-lab experiments, and the exons of these genes were located. 0–60 kb of this genomic sequence including the genes of interest was scanned with five different computational exon prediction programs as well as four splice site recognition programs. After analyzing and comparing the computationally predicted results with the wet-lab experiment results, some potential exons were predicted in the genomic sequence by using these programs.     

噬菌体DNA的快速抽提

介绍一种噬菌体DNA的快速抽提方法.用聚乙二醇沉淀噬菌体颗粒,然后经DEAE纤维素纯化处理和酚抽提.与传统的噬菌体DNA纯化方法相比,改进后的方法方便、快速、经济,可获得高纯度的噬菌体DNA.     

V-ATPase:结构、功能及其在肿瘤细胞中的作用

真核细胞膜及管泡细胞器膜上广泛分布一种与H^ 主动转运有关的蛋白——V-ATPase。V-ATPase的结构由跨膜的V0和细胞质内的V1两个亚单位组成,前者为H^ 提供通道,后者能分解ATP,为逆浓度梯度转运H^ 提供能量。V0和V1只有在聚合时,V-ATPase全酶才有功能。肿瘤细胞中V-ATPase的过度表达或过度活跃,遏制了由酵解增强乳酸聚集导致的细胞内酸化趋势,使细胞避免了凋亡的命运。而H^ 排至细胞外,改变蛋白水解酶的活性,使细胞外基质分解增强,细胞更有侵袭力。肿瘤细胞的V-ATPase可望成为抑制细胞增生、扩散的有效靶点。     

海洋真菌Thraustochytrium sp.FJN-10 Δ~4脱饱和酶基因的cDNA克隆及结构分析

海洋真菌Thraustochytriumsp.FJN-10是二十二碳六烯酸(Docosahexaenoic acid,DHA,C22:6n-3)的高产菌株。为阐明其DHA生物合成机制及采用基因工程技术提高DHA生物合成能力,通过RT-PCR扩增了DHA生物合成相关脱饱和酶基因的保守区,采用cDNA末端扩增技术(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)获取全长基因,结果分析表明其克隆基因为Δ4脂肪酸脱饱和酶基因,开放阅读框由1560个核苷酸组成,共编码519个氨基酸,这是Thraus-tochytriumsp.FJN-10Δ4脂肪酸脱饱和酶基因研究的首次报道。     

V-ATPases的功能及其抑制剂研究进展

V-ATPases作为一类酶,在真核细胞中广泛存在。V-ATPases是一个由多个亚基组成的复合物,主要有两个结构域,分别是位于外周的V1结构域和跨膜的V0结构域。V1结构域可以通过水解ATP供能;而V0结构域是质子的通道。它们发挥作用主要是通过水解ATP供能,泵运H＋进入囊泡腔中或泵H＋出细胞外。V-ATPases定位于细胞器膜及某些特殊细胞的细胞质膜,参与骨吸收、肿瘤的侵袭及耐药等生理及病理过程,因而V-ATPases是治疗骨质疏松、糖尿病及肿瘤等人类疾病的候选分子靶标。目前有许多研究致力于发现新的潜在的特异的V-ATPase抑制剂。     

PAC579基因组序列外显子计算机分析与预测

为了寻找肝癌相关基因,选择位于人原发性肝细胞肝癌染色体17p13.3杂合性缺失最小共同缺失区内含有D17S926位点的PAC579克隆进行了基因组测序,通过实验分离和克隆了位于PAC579上的4个全长新基因,并将它们在该基因组上进行了外显子定位.使用5种计算机预测外显子的方法和4种剪接位点识别的方法对PAC579前60 kb序列(含上述4个基因)进行扫描,将得到的外显子预测结果和剪切位点结果与实验结果进行了对照与评析,又对未获得基因的区域加以预测.