滇黔旅游文化带上的明珠--贵州关岭化石群国家地质公园

关岭布依族苗族自治县,地处贵州西南部。总面积1468平方公里。地势西北高,东南低,最高海拔1850米,最低海拔370米,主要属于中亚热带季风湿润气候,地形地貌具有高低起伏大,类型复杂多样的特征。喀斯特地貌发育完整,占全县总面积的80％以上,石芽、漏斗、洼地、谷地、盲谷、峰林、峡谷等到处可见。县境内居住布依、苗、汉、黎、彝、仡佬等23个民族,布依族和苗族是主体民族,全县人口30余万。     

微生物基因组注释系统MGAP

利用生物信息学方法和工具开发了微生物基因组注释系统（Microbial genome annotation package, MGAP）,并用于蓝细菌PCC7002的基因组注释。该系统由基因组注释系统和基于Web的用户接口程序两部分组成。基因组注释系统整合多个基因识别、功能预测和序列分析软件;以及蛋白质序列数据库、蛋白质资源信息系统和直系同源蛋白质家族数据库等。用户接口程序包括基因组环状图展示、基因和开放读码框在染色体上的分布图,以及注释信息检索工具。该系统基于PC微机和Linux操作系统,用MySQL作数据库管理系统、用Apache作Web服务器程序,用Perl脚本语言编写应用程序接口,上述软件均可免费获得。     

SARS冠状病毒全基因组序列初步分析

对已经完成全序列测定的12个SARS病毒基因组进行了多序列比对,发现序列主体部分29708 b具有99．82％的相同碱基,除2个序列各有5个和6个碱基的缺失外,其余部分共有42个位点核苷酸碱基的差异,其中28个位点的碱基差异可引起氨基酸残基改变。利用蛋白质二级结构和跨膜螺旋预测以及蛋白质定位等生物信息学工具,分析了这些产生氨基酸改变部位的蛋白质构像,推测了可能产生的结构和功能改变,为进一步生物学实验提供参考。所有分析结果同时在北京大学生物信息中心抗SARS网站(antisars.cbi.pku．edu．cn)上发布。