Application of radiation hybrid in gene mapping

Ｒａｄｉａｔｉｏｎｈｙｂｒｉｄ(ＲＨ)ｍａｐｐｉｎｇｉｓａｓｏｍａｔｉｃｃｅｌｌｇｅｎｅｔｉｃｍａｐｐｉｎｇｔｅｃｈｎｉｑｕｅｗｉｔｈａｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎｏｆａｂｏｕｔ500ｋｂ.Ｉｔｈａｓｂｅｃｏｍｅａｇｅｎｅｒａｌｗａｙｔｏｃｏｎｓｔｒｕｃｔｈｉｇｈｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ,ｃｏｎｔｉｇｕｏｕｓｐｈｙｓｉｃａｌｍａｐｏｆｈｕｍａｎｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ[1].ＢａｓｅｄｏｎｅａｒｌｉｅｒｓｔｕｄｉｅｓｏｆＧｏｓｓａｎｄＨａｒｒｉｓ[2]ａｎｄｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｌａｔｅｒｂｙＣｏｘａｎｄｃｏｗｏｒｋｅｒ…     

人类基因组和白血病的分化、凋亡诱导

人类基因组和白血病的分化、凋亡诱导茅矛,况少青,陈国强,陈赛娟,陈竺（上海第二医科大学附属瑞金医院,上海血液学研究所,卫生部和上海市人类基因组研究重点实验室,上海２０００２５）一、人类基因组计划的提出及意义人类基因的现代定义为：合成有功能的人体蛋白质多肽链或ＲＮＡ所必需的全部。ＤＮＡ顺序。     

应用大规模测序技术和生物信息学研究造血干/祖细胞的基因表达及新基因 的识别和克隆

从新生儿脐血和成人骨髓中分选出造血干/祖细胞(HSC/HPC),构建成cDNA文库,对其进行大规模表达序列标签(EST)测序,通过生物信息学等手段分析基因表达谱,并进行新基因的全长cDNA克隆。在所测的10512条可分析E ST序列中,有9866条来自脐血CD34+|细胞,其中4697条(47.6%)为已知基因,2603条(26.4%)为已知EST,1415条(14.3%)代表未知EST。在已知基因中,8.2%基因与造血相关,22.7%涉及细胞代谢、结构和迁移,13.0%与细胞分裂和防御相关,26.2%与RNA、蛋白质的合成相关,10.6%和细胞信号传递有关。对一些已知和未知的EST,综合测序、生物信息学等方法,进行全长克隆,已获得23个新基因的全长cDNA。 Abstract:Hematopoietic stem/progenitor cells were isolated from umbilical cord blood and adult bone marrow,and subject to cDNA library construction.The gene expression pattern in CD34+ cells and the identification and cloning of novel genes were performed by sequencing ESTs and analyzing them with the tools of bioinformatics.Among the obtained 10 512 ESTs which could be further analyzed,9,866 were from umbilical cord blood where 4 697(67.6%)were known genes,2 603(26.4%)were known ESTs and 1415(14.3%)represented novel ESTs.Within the identified genes,8.2% was involved in hematopoiesis,22.7% was associated with cell metabolism,structure and mobility,13.0% was linked to cell division and defence,26.2% was related to RNA protein synthesis and 10.6% was related with cell signal transduction.In parallel,we developed an efficient working system combining sequencing,bioinformatics,etc.and obtained 23 full-length cDNAs from both known and novel ESTs identified in this work.     

一个受维甲酸诱导的基因克隆与鉴定

应用差示-PCR技术从APL细胞株中分离到一个受维甲酸诱导的新基因RIG-E.该基因编码一个含131个氨基酸的蛋白质,分子量为13.5ku,可能为膜表面蛋白,参与信号传导和细胞活化的调控.推断的氨基算顺序与鼠Ly-6有很高的同源性(30%～60%),是目前发现在人类基因组中与Ly-6家族最相近的成员.     

应用大规模测序技术和生物信息学研究造血干/祖细胞的基因表达及新基因的识别和克隆

从新生儿脐血和成人骨髓中分选出造血干／祖细胞（ＨＳＣ／ＨＰＣ）,构建成ｃＤＮＡ文库,对其进行大规模表达序列标签（ＥＳＴ）测序,通过生物信息学等手段分析基因表达谱,并进行新基因的全长ｃＤＮＡ克隆。在所测的１０５１２条可分析ＥＳＴ序列中,有９８６６条来自脐血ＣＤ３４＋细胞,其中４６９７条（４７６％）为已知基因,２６０３条（２６４％）为已知ＥＳＴ,１４１５条（１４３％）代表未知ＥＳＴ。在已知基因中,８２％基因与造血相关,２２７％涉及细胞代谢、结构和迁移,１３０％与细胞分裂和防御相关,２６２％与ＲＮＡ、蛋白质的合成相关,１０６％和细胞信号传递有关。对一些已知和未知的ＥＳＴ,综合测序、生物信息学等方法,进行全长克隆,已获得２３个新基因的全长ｃＤＮＡ。     

造血干/祖细胞大规模测序克隆的一个ABC转运体蛋白基因

ＡＢＣ转运体家族是已知的最大基因家族之一〔１〕,在进化上具高度的保守性,其成员含有ＡＴＰ结合小匣（ＡＴＰｂｉｎｄｉｎｇｃａｓｓｅｔｅ,ＡＢＣ）。最近,我们在对具造血功能的ＣＤ３４＋造血干／祖细胞（ＨＳＰＣ）的基因表达谱的研究中,通过大规模的ｃＤＮＡ测...     

基因组研究中全长cDNA克隆的策略

全长cDNA的克隆是目前人类基因组研究中的一个重要方面,与大规模基因组测序相比较,cDNA测序克隆用相对较少费用获得更多的功能基因信息,故也是符合我国国情的基因组研究的主要方向。如何更加高效地获得新的全长cDNA,本文结合作者自己工作中的经验,对从全长文库的建立到全长cDNA的测序及克隆方法作了较为详细的介绍。     

辐射杂种细胞系技术在基因定位中的应用

利用辐射杂种细胞系 (Radiationhybrid ,简称RH)技术定位 2 6个所克隆的与造血调控有关的新基因 ,其中 2 3个定位明确 ,3个无法定位 .研究证明辐射杂种细胞系技术具有快速、精确、简便、可重复性等优点 ,是基因定位研究中一强有力的技术 .