生物信息学软件研究的可视化分析

以Web of Science数据库为数据来源,利用Cite Space和UCINET软件对发表在Nucleic Acids Research期刊上有关生物信息学软件研究的文献做了可视化分析,揭示了该领域的研究力量、作者团队与高被引作者、知识基础、期刊分布、研究热点与前沿,为生物信息学软件的研究和发展提供必要的参考依据。     

生物信息学数据库研究文献引文与热点分析

以Web of Science为数据源,简要概括生物信息学数据库研究的发展趋势。利用Cite Space可视化工具展现生物信息学数据库研究的知识基础和研究热点图谱,为开展生物信息学数据库领域相关的理论研究和实践活动提供借鉴,以便推动生物信息学数据库研究的发展。研究表明：1990年Altschul SF发表的＂局部比对搜索工具——BLAST＂是生物信息学数据库研究的重要知识来源文献;热点主题集中在序列库、基因组数据库、分类数据库、蛋白质数据库、数据库更新、集成系统等。     

基因组数据的处理

随着人类基因组计划、小鼠基因组计划、各种微生物基因组计划、水稻基因组计划以及各种动植物基因组计划的顺利实施 ,基因数据不断增加。 1995年第一条全基因组数据 (Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ ,流感嗜血杆菌全基因组序列 )公布。以ＧｅｎＢａｎｋ收录的基因组数据为例 ,1996年 ,ＧｅｎＢａｎｋ仅收录了 2条全基因组数据 ,1997年就增加到 6条全基因组数据 ,到目前为止 ,ＧｅｎＢａｎｋ已收录了包括大肠杆菌在内的 10条全基因组数据。此外 ,至少有 32条微生物全基因组即将测序完毕 ,不久将收录ＧｅｎＢａｎｋ中[1] 。基因…     

生物信息学数据库调查分析及其利用研究

从生物信息学数据库利用的角度调查分析生物信息学数据库的现状,为我国科研人员利用网上生物信息学数据库以及生物信息中心的开发提供科学依据和参考价值。研究采用网上调查的方法,对法国生物信息中心Infobiogen建立维护的生物信息学数据库目录DBcat中收录的511个数据库进行调查统计,分析其类型分布、国家分布、更新频率和获取方式;在此基础上。进一步利用欧洲分子生物学信息网(EMBnet)中30个成员国节点对生物信息学数据库利用现状进行统计分析。     

通过电子邮件开展核酸和蛋白质序列分析

近年来,许多核酸和蛋白质序列数据库如ＧｅｎＢａｎｋ、ＥＭＢＬ、ＤＤＢＪ、ＳＷＩＳＳＰＲＯＴ、ＰＤＢ等均建立了与Ｉｎｔｅｒｎｅｔ的连接,并开通了电子邮件服务器,向用户免费提供序列分析服务。只要用户按规定的格式向电子邮件服务器发送序列分析请求,电子邮件服...     

生物信息学课程“开放式、研究性”教学模式的探讨

生物信息学是20世纪分子生物学和计算机科学交叉结合产生的新学科,是目前生命科学最具活力的前沿领域之一。根据生物信息学的学科特点及对国外医学生物信息学教育特点的分析,结合现代教育技术,就构建一种复合的开放式（问题探究型、小组协作探究型）、研究性（“招标式小组”、“因才施教”的专题研究型）生物信息学课程教学模式进行探讨,为我国生物信息学课程改革和与国际接轨提供指导。     

如何查找Internet网上的基因突变信息资源

Ｉｎｔｅｒｎｅｔ网上蕴藏着极其丰富的基因突变信息资源 ,为了更有效地获取和利用这些信息资源为我国的人类基因组计划和突变研究服务。本文结合自己的实践,介绍Ｉｎｔｅｒｎｅｔ上基因突变信息资源及其查找方法 ,希望能对从事人类基因计划和突变研究以及基因突变信息处理等方面的科研人员有所帮助和启迪。１基因突变数据库随着人类基因组计划和突变研究的深入开展 ,产生了大量的基因突变以及多态性数据 ,借助传统的科学期刊系统发表这些数据已属不可能 ,必须建立相应的突变数据库来加速这些信息资源的处理和利用。为此建立了大量的基因突…     

如何向基因库(GenBank)发送核酸序列数据

基因库（ＧｅｎＢａｎｋ）是美国国家生物技术信息中心（ＮａｔｉｏｎａｌＣｅｎｔｅｒｆｏｒＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙＩｎｆｏｒｍａｔｉｏｎＮＣＢＩ）开发的一个核酸序列数据库,其网址为：ｈｔｐ：／／ｗｗｗｎｃｂｉｎｌｍｎｉｈｇｏｖ／。它是公开获取的...     

降纤酶治疗肾小球病高粘血症34例

肾小球病患者的血液高粘状态是一个十分突出的问题.自2000年开始,我们采用广西医科大学生物制品研制中心生产的番桃花牌降纤酶(Defibrase)治疗34例肾小球病高粘血症,疗效满意,现报告如下.