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染色体易位重组位点的识别对很多染色体遗传性疾病的诊断有着重要的意义。本文基于实际诊断中采集到的24类染色体数据和9号正常与异常染色体数据,构建了一套自动识别染色体易位重组位点的模型和方法。首先,对染色体图像进行预处理,得到了方向梯度直方图特征(HOG)和局部二值模式特征(LBP),构建了基于纹理特征的染色体24分类多通道网络模型,分类准确率达到了95.99%;再与ResNet18模型(分类准确率95.86%)进行模型融合,最终分类准确率达到97.08%。其次,将染色体密度谱作为正常和异常染色体的分类特征,采用投票的方法集成支持向量机、随机森林和XGBoost模型,构建了正常和异常染色体的集成分类器,正常和异常9号染色体的分类准确率达到了100%。最后,对于易位的异常染色体,我们提出了基于动态时间规划(DTW)的易位重组位点自动识别算法,在异常染色体的密度谱曲线上找到了重组位点,并映射至染色体G显带模式图,得到标准诊断结果,通过与临床专家的诊断结果进行比较说明了自动识别结果的有效性。本文设计的一套自动识别染色体易位重组位点的模型方法对临床辅助诊断有很大的帮助,有望完善成为一套软件系统应用于临床诊断,提升相关疾病的诊断效率和准确率。 相似文献
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水稻草状矮化病于70年代曾在南亚、东南亚大面积发生,给当地的水稻生产造成严重损失,在我国也有分布[1]。其病原是水稻草矮病毒(Ｒｉｃｅｇｒａｓｓｙｓｔｕｎｔｖｉｒｕｓ,ＲＧＳＶ),为纤细病毒属(Ｔｅｎｕｉｖｉｒｕｓ)的一个成员,病毒粒体丝状,由核衣壳蛋白和基因组ＲＮＡ组成[2]。基因组含六个ｓｓＲＮＡ片段,均为双义编码[3,4],其中ＲＮＡ5的毒义互补链编码核衣壳蛋白(ｎｕｃｌｅｏｃａｐｓｉｄｐｒｏｔｅｉｎ,ＮＣＰ)[3]。本文报道应用ＲＴＰＣＲ技术获得ＲＧＳＶ沙县分离株(ＲＧＳＶＳＸ)ＮＣＰ基因的ｃＤＮＡ克隆,并得到其在大肠杆… 相似文献
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