猪蛔虫全基因组微卫星分布规律

为了探究猪蛔虫全基因组微卫星分布规律,本研究以已公布的猪蛔虫全基因组为基础,通过生物信息学方法,应用MSDB(microsatellite search and building database)从中搜索微卫星序列,并进行统计分析。针对微卫星序列设计40对引物,并通过e-PCR进行验证。得到结论,猪蛔虫基因组中存在682个微卫星位点,总长度为23 572 bp,占全基因组的8.67%。重复类型以短重复类型为主(单碱基重复至三碱基重复)。在这些重复单元中(A)n最为丰富,其次是(C)n,(AT)n,(AAT)n,(AG)n,占全部SSRs的86.67%。其中高频率的SSR类型(≥10),依次是A/T、G/C、AT/AT、AAT/ATT、AG/CT、AC/GT、TAA/TTA、ATTT/AAAT、TAAA/TTTA、TATCTA,占全基因组SSRs总数的75.1%。猪蛔虫基因组长度以10~20 bp为主,有484个(71%)。研究还发现SSR中AT含量明显高于GC含量,占SSRs总数的83.6%。此研究表明在猪蛔虫全基因组上系统的进行微卫星研究工作,有助于分子标记的进一步开发,同时也为猪蛔虫分子鉴定、遗传变异、功能基因等的发展提供了科学素材。     

四川铁布梅花鹿自然保护区梅花鹿夏季栖息地选择

四川梅花鹿Cervus nippon sichuanicus为国家Ⅰ级重点保护动物,四川铁布梅花鹿自然保护区分布有我国现存最大的梅花鹿野生种群。2011年6-9月,采用样方法对保护区梅花鹿夏季栖息地选择进行了调查,共布设109个样方(利用样方61个,对照样方48个),测量并比较了海拔、坡度等20个生境因子。结果显示,梅花鹿偏好利用的植被类型为灌丛、草甸、针叶林,同时选择隐蔽度较高的生境;此外,距水源距离、灌木高度、灌木盖度、灌木密度、草本高度和草本盖度6个连续变量在利用样方和对照样方之间差异有统计学意义(F<0.05或U<0.05)。回归模型分析结果表明,梅花鹿夏季偏好选择草本盖度大、靠近水源和林缘的生境,回避远离水源和林缘的生境。     

非小细胞肺癌组织中miR-19b与miR-20a的表达及临床意义

目的:检测mi R-19b与mi R-20a在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的表达,探讨两者与肺癌临床病理的关系。方法:选择我院NSCLC肺癌患者50例,使用Real-time RT-PCR法对其癌组织及癌旁正常组织中mi R-19b和mi R-20a的含量进行检测,并利用2(-△△CT)法处理结果,分析与临床病理资料的关系。结果:相对于内参U6,mi R-19b基因在NSCLC组织中的表达量明显低于癌旁正常组织,而mi R-20a基因在NSCLC组织中的表达量明显高于癌旁正常组织,差异具有统计学意义(P0.05);在NSCLC组织标本中,mi R-19b基因表达量在临床分期I-II的标本中明显高于临床分期III,而mi R-20a基因表达量在临床分期I-II的标本中明显低于临床分期III,差异均就有统计学意义(P0.05);mi R-19b基因表达量在肿瘤病理低分化组织中明显低于肿瘤病理高分化组织,而mi R-20a基因表达量在肿瘤病理低分化组织中明显高于肿瘤病理高分化组织,差异均具有统计学意义(均P0.05)。结论:mi R-19b低表达和mi R-20a高表达与NSCLC的临床分期、病理分级具有密切关系,早期检测有助于NSCLC诊断和治疗。