芘高效降解菌的分离鉴定及其降解特性的研究

以芘为惟一碳源.采用寓集培养方法,从沈抚灌区石油污染土壤中分离得到一株芘降解菌B05.根据形态学观察、生理牛化鉴定和16S rDNA序列分析结果.将菌株B05鉴定为Aminobacter ciceronei.在芘初始浓度为1mg/L的液体无机盐培养基中,培养10d,菌株B05对芘的降解率为51%;在芘初始浓度为1mg/kg的土壤培养基条件下,培养30d,菌株B05对芘的降解率可达51%;在芘初始浓度为50mg/L的乙醇液体培养基条件下,培养5d,菌株B05对芘的降解率可达25.9%.对菌株培养条件进行优化,经SlideWrite统计软件拟合,菌株B05在牛肉膏蛋白胨液体培养基上的最适生长pH值为7.3,最适生长温度为32.5℃,最适装液量为25.4mL(150mL三角瓶).     

三氯乙烯降解菌FT17的分离、鉴定及其降解特性研究

采用水-硅油双相系统, 从辽河流域浑河沈阳段底泥中筛选得到一株三氯乙烯降解菌FT17。综合形态特征、生理生化特征、16S rRNA Blast分析和系统发育分析结果, 将该菌株鉴定为Sporosarcina ginsengisoli。菌株FT17最适生长温度为34°C, 最适生长pH为7.8。苯酚作为共代谢基质可以促进该菌株对三氯乙烯的降解。该菌株的三氯乙烯降解酶在胞内和胞外均存在。采用两种质粒提取方法对该菌株进行质粒检测, 结果均没有发现质粒条带, 推测该菌株的三氯乙烯降解基因位于染色体上。     

茎瘤固氮根瘤菌Azorhizobium caulinodans ORS571基因组分泌蛋白的生物信息学分析

为了获取茎瘤固氮根瘤菌(Azorhizobium caulinodans ORS571)的分泌蛋白,以便更深入地了解该菌的共生固氮作用,本研究采用SignalP、TMHMM、PSORTb、TargetP、LipoP、TatP和SecretomeP软件对该菌全部4717个蛋白序列进行分析预测。结果共识别了653个分泌蛋白,其中具有分泌型信号肽的蛋白54个,具有RR-motif型信号肽的蛋白1个,具有脂蛋白信号肽的蛋白2个和非经典分泌蛋白596个。该菌含信号肽分泌蛋白仅占全部蛋白的1.2%,低于其它固氮菌。在分泌蛋白中识别了核酸内切酶和核糖核酸酶等6个核酸酶。它们可能参与宿主植物遗传物质的降解,干扰宿主遗传代谢,进一步在宿主植物侵染过程中起到重要作用。此外还识别了超氧化物歧化酶、过氧化氢酶和谷胱甘肽S-转移酶等4个抗氧化酶。它们可能参与活性氧的清除以保护固氮酶,是该菌固氮过程的重要参与者。     

底泥中芘高效降解菌株的富集分离及特性研究

从辽河流域浑河沈阳段采集底泥样品,利用吸附性载体,以芘为唯一碳源,筛选到一株芘高效降解菌F8,根据形态。生理生化特性及测序结果鉴定该菌为产碱杆菌(Alcaligenes sp.)。对菌株F8降解率进行测定,结果表明,菌株F8在32℃振荡培养条件下,7d后对50 mg·L~(-1)的芘降解率为62.75%,芘的降解与细菌浓度的增长呈正相关关系?通过对其培养条件优化,确定其生长的最适温度和pH分别为36℃和6.5。对菌株F8在重金属离子胁迫下的生长研究发现,Cd~(2+)对菌株F8有毒性;Zn~(2+)对菌株有一定的抑制作用;Cu~(2+)对菌株生长影响很小。研究了植物-微生物联合修复作用,结果显示水稻促进了菌株F8对芘的降解,使降解率增加了11.85%。     

石油污染盐碱土壤翅碱蓬根围的细菌多样性及耐盐石油烃降解菌筛选

为了更好地了解石油污染盐碱土壤翅碱蓬根围的细菌多样性,采用16S rRNA基因克隆文库方法对其进行分析,在此基础上采用富集培养方法从该生境中分离筛选耐盐石油烃降解菌.16S rRNA基因克隆文库分析结果表明,海杆菌属(Marinobacter)、食烷菌属(Alcanivorax)和假单胞菌属(Pseudomonas)是该生境中的优势菌.他们可能在石油污染盐碱土壤翅碱蓬植物修复过程中起重要作用.进一步采用富集培养方法,从该生境中分离得到8株耐盐石油烃降解菌,可以耐受6％-10％浓度的NaCl,石油烃降解率在32.3％-57.0％之间.经16S rRNA基因序列分析,8株菌隶属于戈登氏菌属(Gordonia)、无色杆菌属(Achromobacter)、迪茨菌属(Dietzia)、芽胞杆菌属(Bacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas).他们可能参与石油污染盐碱土壤翅碱蓬植物修复过程中的石油烃降解.     

60Co-γ射线辐照毛竹种子的过氧化物同工酶和RAPD分子检测的研究

利用6种不同剂量的60Co-γ射线辐照毛竹种子,对辐照后的毛竹种子进行了过氧化物酶（POD）同工酶检测和RAPD分子检测.结果表明,过氧化物酶的活性在30 Gy和120 Gy时明显增强,其原因是毛竹在60Co-γ射线辐照胁迫下的保护效应和伤害效应.RAPD分析表明毛竹不同辐照剂量之间的DNA存在明显差异,高剂量γ 射线辐照对DNA分子的影响较大,能引起碱基序列的改变;对碱基序列差异片段测序并比对,发现部分片段与已知序列有高达83 %的同源性,部分差异片段与GeneBank中的已知序列没有较高的同源性,应该属辐照引起的DNA序列变异.同工酶和RAPD分子检测为毛竹的诱变育种参数的制定提供了理论依据.