来自于变性链球菌的脱氧胞嘧啶核苷酸脱氨酶的表达，纯化，结晶以及初步晶体学研究

脱氧胞嘧啶核苷酸脱氨酶属于脱氧胞苷酸脱氨家族.对来自于变性链球菌UA159的脱氧胞嘧啶核苷酸脱氨酶进行了克隆,在大肠杆菌中进行了表达,最后纯化.快速液相分子排阻色谱分析表明这种酶在溶液中形成六聚体.利用悬滴气相扩散技术获得了这个蛋白的晶体.在北京同步辐射的3W1A线站,收集了衍射分辨率到达3.1!的数据.这个晶体属于P213空间群,其晶胞参数为a=b=c=113.2",!="=#=90°.计算可得马修斯系数为3.6#3·Da-1,据此可估计在一个不对称单位中含有两个单亚基.据目前所知,这是第一个关于野生型的脱氧胞嘧啶核苷酸脱氨酶的结晶学报道.     

鸟类血红蛋白的四级结构和残基选择性特征

对目前已知结构的三个鸟类血红蛋白与哺乳类和硬骨鱼类血红蛋白的晶体结构数据进行了比较,发现鸟类、硬骨鱼类和哺乳类血红蛋白具有不同的四级结构特征,鸟类和硬骨鱼类血红蛋白的各亚基间的距离比哺乳类血红蛋白大,其中,α１－β１亚基间的距离为：硬骨鱼类Ｈｂ＞鸟类Ｈｂ＞哺乳类Ｈｂ;α１－β２、α１－α２和β１－β２亚基间的距离以及两个αβ二聚体的距离为：鸟类Ｈｂ＞硬骨鱼类Ｈｂ＞哺乳类Ｈｂ。进一步由一级结构的比较     

口腔致病菌变形链球菌Smu.776蛋白的制备、结晶及初级晶体学分析

变形链球菌smu.776基因编码一段含有385个氨基酸的蛋白质,其功能可能为依赖于腺苷甲硫氨酸的甲基转移酶.smu.776的DNA片段被克隆到表达载体pET28a后,在大肠杆菌BL21(DE3)菌株中过量表达得到很好的产量.产物Smu.776蛋白通过Ni2 亲和柱和分子筛柱层析两步得到纯化.采用悬滴气象扩散法得到了Smu.776蛋白的晶体.X射线衍射分辨率达到2.0!,晶体属单斜空间群C2,晶格参数为a=168.47",b=50.66#,c=53.96$,β=104.22°.每个最小不对称单元内含有一个蛋白质分子,溶剂含量为51.3%.     

龋齿致病菌变性链球菌蛋白Smu_195c的制备、结晶及初级晶体学分析

变性链球菌(Streptococcus mutans)是最主要的龋齿致病菌.其中Smu_195c为一个约10ku(86个氨基酸)的蛋白质,序列比对结果显示,它没有包含保守的结构域,功能也是未知的.为揭示其功能,在大肠杆菌BL21(DE3)中表达了N端结合了6个His的编码Smu_195c的DNA片段.通过悬滴法得到了两种不同晶系的晶体.第一种属于空间群P6122或P6522,晶格参数为a=b=62.93!,c=90.63",γ=120°;第二种属于空间群P41212或P43212,晶格参数为a=b=57.97#,c=103.51$.N端带有His的蛋白质长出的晶体属于第一种,而切掉N端的6个His后的蛋白质长出的晶体两种都有.     

龋齿致病菌变形链球菌蛋白 Smu.260 的 制备、结晶及初级晶体学分析

变形链球菌 (Streptococcus mutans) 是最主要的龋齿致病菌,其基因 Smu.260 编码一个约 23 ku (200 个氨基酸 ) 的蛋白质. Smu.260的 DNA 片段被克隆到表达载体 pET28a 后在大肠杆菌 BL21(DE3) 菌株中表达得到很好的产量. 产物 Smu.260 蛋白通过 Ni²⁺亲和柱和分子筛两步法纯化,并发现纯化后的蛋白以两种形式存在,二聚体 (约46 ku) 和四聚体,前者呈亮黄色,后者无色. 采用悬滴气象扩散法得到了二聚体形式的晶体. 晶体的 X 射线衍射分辨率达到 2.3埃,晶体属正交空间群 P2₁2₁2₁,晶格参数为a=89.88埃, b=90.91埃, c=105.17埃. 晶胞不对称单元内估计含有一个二聚体,溶剂含量为 53％ .     

北京鸭(Anas platyrhynchos)氧合血红蛋白的晶体生长和X射线晶体学的初步研究

北京鸭氧合血红蛋白晶体在以聚乙二醇６０００为沉淀剂,在ｐＨ７．１,血红蛋白浓度为２５ｍｇ／ｍｌ条件下采用一批结晶法培养得到,并且适合于Ｘ射线衍射分析。经Ｘ射线平面探测仪收集衍射强度数据和处理,确定晶体属四方晶系,空间群为Ｐ４２２１２,晶胞参数为ａ＝ｂ＝８．１１３ｎｍ,ｃ＝１０．７０７ｎｍ,α＝β＝γ＝９０°,每个不对称单位中包含半个四聚体分子。进一步得到北京鸭氧合血红蛋白高分辨率晶体结构,通过与其高海拔同类－斑头雁分析比较深入研究斑头雁血红蛋白分子的高氧亲和性机制。     

北京鸭(Anas platyrhynchos)氧合血红蛋白的晶体生长和X射线晶体学的初步研究

北京鸭氧合血红蛋白晶体在以聚乙二醇６０００为沉淀剂,在ｐＨ７．１,血红蛋白浓度为２５ｍｇ／ｍｌ条件下采用一批结晶法培养得到,并且适合于Ｘ射线衍射分析。经Ｘ射线平面探测仪收集衍射强度数据和处理,确定晶体属四方晶系,空间群为Ｐ４２２１２,晶胞参数为ａ＝ｂ＝８．１１３ｎｍ,ｃ＝１０．７０７ｎｍ,α＝β＝γ＝９０°,每个不对称单位中包含半个四聚体分子。进一步得到北京鸭氧合血红蛋白高分辨率晶体结构,通过与其高海拔同类－斑头雁分析比较深入研究斑头雁血红蛋白分子的高氧亲和性机制。