生物学工具包概述

对于用户而言,生物学工具包指什么？生物学工具包就是整合到一起的软件包,可以在处理器上运行生物学信息。常见的生物学工具包有BioJava、BioPerl、BioPython和BioRuby。这些工具相应的计算机语言——Java、Perl、Python和Ruby——是无法理解科学研究信息的。然而,其组合而成的工具包却能够理解那些信息背后所代表的化学、生物或其它学科的含义。这些计算机语言不同于人类语言,它们只是生硬地揭示标准和变化。而工具包则可以通过代码揭开计算机语言所蕴含的深层含义,找到通往答案的途径。     

四种不同化疗方案在侵蚀性葡萄胎患者中的疗效比较及药物经济学评价

目的:观察4种不同的化疗方案对侵蚀性葡萄胎的疗效并进行物经济学比较。方法:回顾性分析2014年01月至2017年01月我院收治的侵蚀性葡萄胎患者76例,分为甲氨蝶呤(MTX)组、EMA-CO组、新福菌素组(ACT)、5-氟尿嘧啶(5-Fu)+新福菌素组,观察4组患者治疗后的疗效、安全性,并采用成本-效果分析方法进行药物经济学分析。结果:4组患者在年龄、治疗花费、疗效间没有差异。MTX组药费最低(5876.5±644.9元,P0.01),成本-效果比最低(286.74元),但MTX组的化疗的副反应(骨髓抑制)发生率最高;其他三组同MTX组相比,其增量成本-效果比均2000元。联合化疗方案中,EMA-CO较5-Fu+ACT组药费较低(36027.2±1792.2元vs 60215.2±3632.8元,P0.01),增量成本效果优势明显(2542.69元vs 7963.19元)。结论:对于侵蚀性葡萄胎患者,针对患者的不同情况采用联合化疗或单药化疗,其疗效均无显著性差异。MTX组治疗花费最为经济,其他组增量成本-效果较高,考虑到副反应发生率、住院天数等其他因素,其他三组仍有选择优势。     

鹿茸富脯氨酸多肽-APRP基因融合表达载体的构建及表达

目的:构建鹿茸富脯氨酸多肽(APRP)基因融合表达载体,并诱导表达融合蛋白GST-APRP。方法:以鹿茸顶端组织总c DNA为模板,PCR方法扩增目的片段,连接p MDTM18-T载体,转化E.coli DH5α进行TA克隆。酶切与测序鉴定合格后,将目的片段与p GEX-6P-1质粒连接,完成p GEX-6P-1-APRP融合表达载体的构建。利用原核表达系统进行初步诱导表达。SDS-PAGE蛋白电泳检测蛋白表达情况。结果:PCR成功扩增出目的基因片段,目的基因片段大小为216 bp。提取表达载体质粒经酶切及测序分析证实p GEX-6P-1-APRR融合表达载体构建成功。利用终浓度为0.5 m MIPTG诱导,融合蛋白成功表达,分子量为35 k Da。结论:目前利用基因工程技术获得特定的鹿茸多肽的报道很少。本研究结果表明,利用原核表达系统可在体外对鹿茸富脯氨酸多肽基因(APRP)进行融合表达,并且融合蛋白GST-APRP以可溶形式表达,有利于进一步研究APRP。这也为研究其他鹿茸多肽单体成分提供重要参考。     

迈向生物医学信息时代

一月份,我在美国国家癌症研究所（NCI）聆听来自剑桥大学的BrucePonder的讲座。讲座中一个有趣的问题引起了我的注意。Ponder阐述了FGFR2基因突变与乳癌之间的关联关系。癌症研究领域的传奇人物Judah Folkman向Ponder提出了这样一个问题：     

筋骨草提取物抗运动疲劳的作用

目的：探讨筋骨草的抗运动性疲劳作用。方法：将120只雄性昆明种小鼠随机平均分成安静组、运动组、阳性对照组和筋骨草低、中、高剂量组（n=10）。其中低、中、高剂量组小鼠分别按100 mg/kg、200 mg/kg、400 mg/kg体重连续灌胃筋骨草提取物30 d,阳性对照组小鼠按200 mg/kg体重灌胃西洋参胶囊颗粒,安静组和运动组小鼠以等体积生理盐水灌胃。动物试验结束后,分析各组小鼠运动力竭时间、血清生理生化指标（包括血乳酸、血尿素氮、血糖、总胆固醇、甘油三酯含量）、肝糖原与肌糖原含量,以及股四头肌、肝脏和心脏组织的抗氧化指标（包括谷胱甘肽过氧化物酶、超氧化物歧化酶、过氧化氢酶和丙二醛）。结果：中、高剂量组小鼠的运动力竭时间、红细胞数量、血红蛋白含量、血糖浓度、肝糖原与肌糖原含量,以及器官组织中谷胱甘肽过氧化物酶、超氧化物歧化酶和过氧化氢酶活力均明显高于运动对照组,而血清乳酸含量、血清尿素氮、血清甘油三酯与总胆固醇含量,以及器官组织中丙二醛含量明显低于运动对照组,中剂量的筋骨草提取物的作用效果优于同剂量的西洋参胶囊颗粒。结论：筋骨草通过提高机体的抗氧化功能而达到抗运动性疲劳作用。     

防止流产的研究

新近发现的一个导致流产的原因给预防流产带来了希望,这就是使用市场上已有的一种针对其他适应症的药物。但是何时才能实现临床试验呢？     

复方谷氨酰胺联合双歧杆菌三联活菌胶囊对腹泻型肠易激综合征患者肠黏膜屏障功能、胃肠激素和血清5-HT、SPY水平的影响

目的:探究复方谷氨酰胺联合双歧杆菌三联活菌胶囊对腹泻型肠易激综合征(IBS-D)患者肠黏膜屏障功能、胃肠激素和血清5-羟色胺(5-HT)、神经肽Y(SPY)水平的影响。方法:选取2019年3月-2021年3月我院收治的IBS-D患者104例,根据随机数字表法将其分为A组、B组各52例。A组给予复方谷氨酰胺治疗,B组给予复方谷氨酰胺联合双歧杆菌三联活菌胶囊治疗,两组均治疗4周。检测并比较两组胃肠激素和血清5-HT、SPY水平,肠黏膜屏障功能指标及治疗疗效。记录治疗期间不良反应发生情况。结果:B组治疗后总有效率较A组高(P<0.05)。治疗后两组5-HT水平下降,SPY水平上升,且与A组相比,B组治疗后5-HT水平较低,SPY水平较高(P<0.05);治疗后两组内毒素、D-乳酸、二胺氧化酶(DAO)水平均下降,且与A组相比,B组治疗后内毒素、D-乳酸、DAO水平较低(P<0.05);治疗后B组血管活性肠肽(VIP)、生长抑素(SS)水平低于A组(P<0.05)。治疗期间两组均未发生不良反应。结论:IBS-D患者经复方谷氨酰胺联合双歧杆菌三联活菌胶囊治疗疗效显著,可改善患者肠黏膜屏障功能、胃肠激素和血清5-HT、SPY水平,且无明显不良反应,安全性较高,值得临床联合使用。     

通力合作，治愈重症疾病

十年前，一位成功的互联网企业家Jay“Marty”Tenenbaum被诊断患有转移性恶性黑色素瘤，只剩一年的生命。为了拯救自己的生命，他研究了各种实验性药物治疗方法，并接种了一次失败的癌症疫苗。在他所创立的CollabRx公司上下，Tenenbaum致力于利用业界未曾开发的卓越的专业技术和资源，针对不同个体展开研究，确保患者的健康。