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烟草(Nicotiana tabacum)是基因功能分析的模式植物以及重要的经济作物之一, 适宜的生存环境对烟草的生长和繁殖至关重要。COL (CONSTANS-like)基因家族编码蛋白不仅调控植物开花, 而且在植物生物/非生物胁迫响应中发挥重要作用。该研究通过鉴定烟草COL基因家族成员, 分析其基因结构、进化关系、转录调控元件和表达模式, 探究其编码蛋白的生物学功能, 尤其是在烟草响应低温胁迫中的可能作用。结果显示, 在烟草中共鉴定出15个COL基因, 其编码的蛋白理化性质相近; 进化分析结果表明其包括3类, 每个类别的成员之间具有相似的外显子/内含子结构以及motif数量和类型; 烟草COL基因启动子区域含有大量与光、低温、干旱以及植物激素等响应相关的顺式作用元件; 基于二代高通量测序分析结果表明, 低温显著影响烟草COL基因的表达, 但对不同基因的影响存在差异, 不同COL基因的亲本(林烟草(N. sylvestris) (母本)和绒毛状烟草(N. tomentosiformis) (父本))具有表达偏好性, 且这种偏好性大部分会从6-7叶期保持到现蕾期。 相似文献
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为深入探讨水稻对逆境的反应机理并寻找新的植物耐逆基因,采用Affymetrix水稻表达芯片(含51279个转录本)分析了培矮64S全基因组在不同逆境(高温、干旱、低温)胁迫下、不同生育时期叶片和穗中的表达谱,从中筛选出一个受多种逆境诱导表达的基因OsMsr3(Oryza sativa L.multiple stresses responsive gene3,GenBank登陆号为 FJ383169).定量实时PCR分析结果进一步证实了此基因在逆境条件下的诱导表达模式.用 RT-PCR方法扩增获得了包含其完整开放阅读框的cDNA克隆,序列分析表明,其ORF大小为480 bp,编码一个具有160个氨基酸残基的低分子量热激蛋白,推测分子量约为18.0 kD;pI约为6.8.对其编码的蛋白质进行分析,发现其羧基端存在一个HSP20的蛋白保守结构域,与其他植物中的低分子量热激蛋白的相似性介于33.7%~97.5%.对其可能的启动子序列分析,发现6类与逆境反应有关的顺式作用元件.推测该基因在逆境反应中起着重要的作用,进一步的研究正在进行中. 相似文献
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同源四倍体拟南芥的耐锌性及其机理 总被引:1,自引:0,他引:1
锌(Zn)是植物生长发育所必需的微量元素,但其过量积累也会对植物产生毒害作用。通过对同源四倍体拟南芥进行高浓度锌处理,发现四倍体拟南芥对锌具有高耐受性和低积累性的特点。在高浓度锌胁迫条件下,同源四倍体的根长和生物量较野生型对照均有明显增加,并且谷胱甘肽(GSH)的含量也明显升高。定量实时PCR(q RT-PCR)分析表明,一些锌胁迫响应基因的表达水平发生了显著改变。以上结果表明,锌胁迫响应基因表达水平的改变以及GSH含量的升高可能在四倍体拟南芥的耐锌过程中发挥重要作用。 相似文献
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