Activity identification of chimeric anti-caspase-3 mRNA hammerhead ribozyme in vitro and in vivo

To study the expression activity of various vectors containing anti-caspase-3 ribozyme cassettesin vivo, and to further study the role of caspas-3 in the apoptotic pathway, we constructed anti-caspase-3 hammerhead ribozyme embedded into the human snRNA U6, and detected the activity of the ribozymein vitro andin vivo. Meanwhile we compared it with the self-cleaving hammerhead ribozymes that we previously studied, and with the general ribozyme, cloned into RNA polymerase II expression systems. The results showed that the three ribozymes, p1.5RZ107, pRZ107 and pU6RZ107 had the correct structure, and that they could cleave caspase-3 mRNA exactly to produce two fragments: 143nt/553nt. p1.5RZ107 has the highest cleavage efficiencyin vitro, almost 80%. However, the U6 chimeric ribozyme, pU6RZ107, has the highest cleavage activityin vivo, almost to 65%, though it has lower cleavage activityin vitro. The cleavage results demonstrated that the pU6RZ107, the U6 chimeric ribozyme, could more efficiently express and downregulate the level of caspase-3in vivo, and the ribozyme could provide an alternative approach to the research into the mechanism of apoptosis and human gene therapy also.     

特异亲和活性蓝染料的小分子RNA的SELEX筛选

化学合成含有２０ 个核苷酸随机序列, 长度为７３ 个核苷酸的单链 Ｄ Ｎ Ａ 随机库; Ｐ Ｃ Ｒ 扩增和双链化后, Ｔ７ Ｒ Ｎ Ａ 聚合酶体外转录得到单链 Ｒ Ｎ Ａ 随机库。以活性蓝染料凝胶柱为筛选介质, 体外进化方法筛选特异亲和活性蓝染料的 Ｒ Ｎ Ａ 分子。经８ 轮循环筛选, Ｒ Ｎ Ａ 群体亲和染料的比例从小于０ ．０３ ％ 上升至２２ ．４ ％ 。克隆筛选出 Ｒ Ｎ Ａ 序列后, 测定了３０ 个克隆的序列, 得到三类 Ｒ Ｎ Ａ 分子。经二级结构分析和活性蓝染料特异亲和能力测试,发现 Ｒ Ｎ Ａ 特异亲和活性蓝染料的主要结构因素是 Ｒ Ｎ Ａ 形成的双链结构     

枯草杆菌TrpRS的固定化及亲和RNA筛选

为研究 t RNATrp与色氨酰 - t RNA合成酶 ( Trp RS)的相互识别及其结构与功能的关系 ,纯化了枯草杆菌 Trp RS,并用溴化氰活化的 Sepharose4B将 Trp RS固定化 ,固定化 Trp RS的蛋白回收率为 95.5% ,活力回收率为 31 .3% .研究了固定化 Trp RS的酶学性质 ,其热稳定性和贮存稳定性方面均比液相 Trp RS有了较大的提高 ,最适温度、最适 p H均有一定程度的增大 ,工作稳定性良好 .以固定化 Trp RS为亲和层析介质 ,对含有 2 0个核苷酸随机序列 ,长度为 56个核苷酸的单链RNA随机库进行了三轮筛选 .实验结果表明 ,固定化 Trp RS可以作为 SELEX亲和层析介质 ,进行模拟 t RNATrp分子的 RNA随机库的 SELEX筛选 .     

大肠杆菌中的小分子RNA

迄今为止,已知由大肠杆菌基因组编码的小分子ＲＮＡ（ｓＲＮＡ）除了５ＳｒＲＮＡ和ｔＲ－ＮＡ外,共有１０种,其中大多数是调控ＲＮＡ,可调控细菌的某些代谢过程。１．ｓＲＮＡ的发现用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析３２Ｐ标记的大肠杆菌总ＲＮＡ,发现除５ＳｒＲＮＡ和ｔＲ...     

丹红注射液对肝硬化的肝功能、肝纤维化指标、血流变的影响

目的:观察丹红注射液对肝硬化病人在保护肝细胞、肝纤维化及血流变的影响。方法:治疗组40例,在对照组基础上予丹红注射液40ml加入250ml葡萄糖注射液中稀释后缓慢滴注,每天一次;对照组38例,以甘利欣、Vitc、肌苷静脉滴注,每天一次,同时口服水飞蓟素,两组疗程均为4周。结果:治疗组与对照组比较,总有效率有显著差异(P0.05);胆红素和转氨酶复常方面,治疗组亦优于对照级,有显著差异(P0.05);两组治疗前后肝纤维化指标检测结果,治疗组与对照组治疗后比较有显著差异(P0.05);两组治疗前后血流变检测结果,治疗组与对照组治疗后比较部分项目有显著差异(P0.05、P0.01)。结论:丹红注射液对肝功能、肝纤维化及部分血流变项目有改善。     

3种水稻线粒体tRNA~(Trp)突变体的克隆和活力鉴定

 设计并完成了 3种水稻线粒体tRNATrp的突变 ,体外转录并用枯草杆菌和人色氨酰tRNA合成酶 (TrpRS)对tRNATrp及其突变体进行了活力测定 .3种突变体的氨酰化活力比野生型水稻线粒体tRNATrp分别上升了 1 8、1 5和 5倍 .说明A1 U72和G5 C68对于提高线粒体tRNATrp被细胞质TrpRS氨酰化能力的作用并不大 ,细胞质tRNATrp与细胞质TrpRS的识别方式并不适用于线粒体tRNATrp与细胞质TrpRS的相互识别 .研究结果对于了解线粒体tRNATrp和细胞质TrpRS的相互识别及药物设计有重要意义     

Activity identification of chimeric anti-caspase-3 mRNA hammerhead ribozyme in vitro and in vivo

To study the expression activity of various vectors containing anti-caspase-3 ribozyme cassettes in vivo, and to further study the role of caspas-3 in the apoptotic pathway, we constructed anti-caspase-3 hammerhead ribozyme embedded into the human snRNA U6, and detected the activity of the ribozyme in vitro and in vivo. Meanwhile we compared it with the self-cleaving hammerhead ribozymes that we previously studied, and with the general ribozyme, cloned into RNA polymerase II expression systems. The results showed that the three ribozymes, p1.5RZ107, pRZ107 and pU6RZ107 had the correct structure, and that they could cleave cas-pase-3 mRNA exactly to produce two fragments: 143nt/553nt. p1.5RZ107 has the highest cleavage efficiency in vitro, almost 80%. However, the U6 chimeric ribozyme, pU6RZ107, has the highest cleavage activity in vivo, almost to 65%, though it has lower cleavage activity in vitro. The cleavage results demonstrated that the pU6RZ107, the U6 chimeric ribozyme, could more efficiently expre     

固定化枯草杆菌色氨酰tRNA合成酶(英文)

为研究ｔＲＮＡＴｒｐ 与色氨酰ｔＲＮＡ合成酶（ＴｒｐＲＳ） 的相互识别及其结构、功能关系, 纯化了枯草杆菌ＴｒｐＲＳ并用溴化氰活化的Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ ４Ｂ 将ＴｒｐＲＳ固定化, 固定化ＴｒｐＲＳ的蛋白质回收率为９５ ．５ ％ , 活力回收率为３１．３％ 。研究了固定化ＴｒｐＲＳ的酶学性质, 其热稳定性和贮存稳定性方面均比液相ＴｒｐＲＳ有了较大的提高, 最适温度、最适ｐＨ 均有一定程度的增大, 工作稳定性良好。以固定化ＴｒｐＲＳ为亲和层析介质, 对含有２０ 个核苷酸随机序列、长度为５６ 个核苷酸的单链ＲＮＡ 随机库进行了３ 轮筛选,ＲＮＡ 群体亲和固定化ＴｒｐＲＳ的比例从４ ．３ ％ 上升至１４ ．７ ％ 。筛选得到了与ｔＲＮＡＴｒｐ 氨基酸接受茎类似的ＲＮＡ二级结构。实验结果表明固定化ＴｒｐＲＳ可以作为ＳＥＬＥＸ 亲和层析介质, 进行模拟ｔＲＮＡＴｒｐ 分子的ＲＮＡ 随机库的ＳＥＬＥＸ 筛选。     

U6嵌合型抗caspase-3核酶的体外及体内活性鉴定

为探讨caspase-3基因在细胞凋亡中的作用,及不同表达核酶的载体在体内的表达效果,本研究对比了3种表达核酶的真核质粒,包括RNA聚合酶Ⅱ启动的p1.5RZ107(自我剪切)和pRZ107及RNA聚合酶Ⅲ启动的嵌合于U6中的pU6RZ107在体外和在肝细胞BRL-3A内的活性,以期获得细胞内切割活性较高的的核酶载体方面的信息.结果显示,具有自我剪切功能的质粒p1.5RZ107在体外切割靶RNA的效率最高,几达80%;而体内caspase-3在RNA,蛋白水平及蛋白功能活性上均显著下降,证明核酶在体内均可有效地表达并切割底物,以pU6RZ107切割效率最高,约达65%,pRZ107次之,p1.5RZ107最低.结果表明,U6嵌合型核酶pU6RZ107体内可有效地表达核酶及下调靶RNA水平,这不仅为探讨caspase-3在凋亡途径中的作用,也可为今后的基因治疗提供研究基础.     

RNA与X染色体失活的后成调节

生物体内,由于性别的差异,两性细胞中的Ｘ染色体数目不同。为了平衡具有不同Ｘ染色体数目的细胞中Ｘ连锁基因的表达量,生物体在进化过程中引入了剂量补偿机制（ｄｏｓａｇｅｃｏｍｐｅｎｓａｔｉｏｎ）。在线虫中,两性体的染色体浓缩和分离与一组蛋白复合体有关,这组...