基于SOM聚类方法在临床检验知识发现中的应用

目的:探讨基于自组织特征映射网络的知识发现方法在建立应用临床检验项目的门诊患者聚类模型中的适用性,为临床检验决策支持系统的建立提供参考.方法:以2009-2011年西安市两所最大的综合医院的内科门诊患者就诊资料为训练样本,运用MatlabR2009b软件包中的SOM Tool Box工具箱建立应用临床检验项目的门诊患者的自组织映射网络聚类模型.用Excel软件绘制柱状图描述各组门诊患者的疾病特征.结果:自组织特征映射网络训练学习后,得出聚类结果,输出结果与临床检验决策真实值具有一定一致性,训练结果表明患者的聚类结果有一定的临床意义.患者性别、年龄、3年累计临床检验项目数、疾病特征对聚类模型的贡献较大.结论:自组织映射方法对应用临床检验项目的门诊患者聚类效果较好,具有较高的应用和推广价值,可为临床检验决策支持系统的研究提供方法学依据.     

中国汉族女性TLR7基因主要编码区的全长扩增及多态性分析

目的:扩增TLR7主要编码区外显子3(exon 3)的全长基因片段并进行基因多态性分析,筛选健康人群中TLR7基因的主要SNP位点.方法:采用酚-氯仿抽提方法从28例健康女性血样中提取基因组DNA,采用长片段扩增方法分别扩增TLR7 exon 3区的3个片段,测序、拼接后进行多态性分析.结果:采用LA-Taq酶体系成功扩增TLR7 exon 3区基因片段;经与Genbank数据库中TLR7参考序列比较,我国女性TLR7基因序列高度保守,仅出现了4个点突变,并发现1个SNP位点RS3853839,表现为GG、CG和CC三种基因型.结论:建立了TLR7编码区基因扩增方法,筛选到1个TLR7SNP位点RS3853839,可为分析TLR7多态性与多种病毒感染性疾病的关系提供参考.     

Mcl1对晚期非小细胞肺癌患者预后意义

目的:检测细胞凋亡通路蛋白Mcl1和Fbw7对晚期非小细胞肺癌患者预后的预测作用.方法:收集2008年3月至2011年6月在第四军医大学第一附属医院西京医院确诊晚期非小细胞肺癌且最初两个化疗周期采用“多西他赛+顺铂”方案的患者,通过电话和信件进行随访.用免疫组化方法检测患者肿瘤蜡块组织中蛋白Mcl1和Fbw7表达,用H评分系统将蛋白表达分为高表达组和低表达组.统计采用Kaplan-Meier法进行单因素生存分析并进行Log-Rank检验,通过比例风险模型(Cox模型)逐步后退法进行多因素分析,以P＜0.05为有显著差异.结果:共收集病例144例,其中腺癌69例,鳞癌64例,其它11例.Ⅲ期患者45例(31.25％)Ⅳ期患者99例(68.75％).64例(44.44％)患者Mcl1高表达,80例(55.56％)患者Mcl1低表达.单因素结果提示TNM分期是提示预后的显著因素(P=0.033),Ⅲ期患者1年生存率为74.20％(中位生存时间为666天),Ⅳ期患者1年生存率为55.60％(中位生存时间为415天).Mcl1的表达与晚期非小细胞肺癌预后相关联(P=0.042),其中Mcl1高表达组1年生存率为69.9％(中位生存时间为612天),Mcl1低表达组1年生存率为55.30％(中位生存时间为406天).多因素分析结果显示Mcl1 (OR=1.809,95％CI (1.123-2.912),P=0.015)和TNM分期(OR=0.573,95％CI (0.336-0.978),P=0.041)有独立的预后意义.结论:Mcl1蛋白表达和TNM分期是晚期非小细胞肺癌的独立预后因素,Mcl1高表达组较低表达组有更好的预后,III期患者比Ⅳ期患者有更好的预后.     

基于BP神经网络和RBF神经网络预测老年痴呆症疾病进展的对比研究

目的:比较反向传播算法(BP)神经网络和径向基函数(RBF)神经网络预测老年痴呆症疾病进展的效果。方法:以老年痴呆症随访数据为研究对象,以性别、年龄、受教育程度、有无高血压、有无高胆固醇、有无心脏病、有无中风史、有无家族史8个指标作为输入变量,以五年随访的MMSE差值为输出变量,构建基于BP神经网络和RBF神经网络的老年痴呆症疾病进展预测模型。结果:与BP神经网络模型相比,RBF神经网络预测的结果更好,能够有效地预测老年痴呆症疾病进展。结论:神经网络模型将老年痴呆症疾病进展预测问题转化为随访数据中相关测量指标与MMSE差值的非线性问题,为复杂的老年痴呆症疾病进展预测提供了新思路。