hsa-miR-126的靶基因预测及其生物信息学分析

目的:采用生物信息学的方法预测hsa-miR-126的靶基因及相关功能,为后续研究提供理论基础。方法:采用PubMed搜索hsa-miR-126相关文章,总结目前研究进展,使用mi RBase获得hsa-miR-126的基本信息,并用NCBI BLAST分析其序列保守性,以Targetscan、mi Randa及PicTar预测结果的两两交集为预测靶基因,并结合mi RTarBase上已证实的靶基因作为基因集合做GO分析和Pathway分析。结果:搜索PubMed获得相关文献24篇,多数研究集中于hsa-miR-126与肿瘤的关系,hsa-miR-126在多种物种间具有高度保守性,其5个预测靶基因和46个已证实靶基因于白细胞迁移、对糖皮质激素反应、促进内皮细胞增殖、蛋白信号转导等有功能富集(P0.01),于多种肿瘤如肾细胞癌、前列腺癌、非小细胞肺癌、胰腺癌有信号通路富集(P0.01)。结论:hsa-miR-126可能参与多种肿瘤的发生发展过程。     

基于InVEST模型的生态系统服务功能应用研究进展

生态系统服务功能的模拟、评估、预测及其权衡关系的研究成为生态系统服务研究领域的热点.InVEST模型包含近20项生态服务模块,不仅涵盖了生态系统服务的众多方面,能满足不同功能的评价、模拟和预测需求;而且具有很强的空间化、动态化、可视化等特点.系统分析了该模型中应用最为广泛的生境质量、水土保持、产水模型和生态系统服务综合...     

黄土高原围封与自然放牧草地碳交换特征

用静态箱法于2012年3月~2013年2月对黄土高原自然放牧及其围封6年的草地土壤呼吸和净生态系统CO2交换速率进行为期1年的实地观测。结果表明:(1)围封和自然放牧草地全年的碳交换总量均表现为碳汇,即CO2净吸收;围封草地全年净生态系统碳交换量为(-58.0±14.5)g·m-2,其中生长季和非生长季交换量分别为(-70.3±11.4)g·m-2和(12.4±3.1)g·m-2;自然放牧草地生态系统全年碳交换量为(-48.7±14.0)g·m-2,其中生长季和非生长季交换量分别为(-56.9±10.6)g·m-2和(8.1±3.3)g·m-2。(2)草地净生态系统CO2交换速率生长季主要受土壤含水量的控制,而在非生长季则主要受土壤温度的控制;草地土壤呼吸速率主要受土壤温度和土壤含水量共同影响,其中在生长季受土壤含水量的影响作用更大,而在非生长季则受土壤温度的影响作用更大。(3)土壤有机质含量的差异是造成围封草地土壤呼吸速率大于自然放牧草地的主要原因。(4)研究区草地存在土壤呼吸负通量现象,样地灰钙土偏高的碱性条件(pH8.2)促进了土壤次生碳酸盐的淀积可能是造成这一现象的主要原因。