基于RAD高通量测序的蓝花楹群体遗传分析

为了解蓝花楹(Jacaranda mimosifolia)种质资源的遗传多样性和群体遗传结构,对168份种质材料进行RAD-seq测序,构建了系统进化树并进行主成分、群体结构和遗传多样性分析。结果表明,比对参考基因组平均比对率为81.02%,平均测序深度23.18×,最终获得45 552个高质量的SNPs。群体遗传结构分析表明,供试蓝花楹可划分为2个大的类群,来自川、渝地区的种质材料基本归为一类;其余地区归为另一类。19个地区的蓝花楹在SNP水平上的遗传多样性较高,云南昆明(YNKM)居群的核苷酸多样性(π)期望杂合度(He)最大,表现出最高的遗传多样性。因此,来自川、渝地区的蓝花楹具有相对较近的亲缘关系,推断来自同一祖先,而其余地区的种质可能是随机引种栽培。     

锐药竹的种子性状及分子遗传变异

锐药竹( Oxytenanthera abyssinica)是非洲竹区最重要的竹种,对当地民众生活、生产和环保具有重要作用,也是保护当地环境的重要组成成分。然而,对这样重要的竹种,非洲内、外均少见其遗传研究报道。该研究对采自埃塞俄比亚的同一居群锐药竹少见的开花结实种子,采用“林木种子检验规程”国家标准,测定种子的主要性状,并对其遗传品质进行了分析。结果表明：锐药竹的种子长度为18.2 mm,宽度为3.3 mm,千粒重为117.5 g,室内发芽率为66.5％。性状变异与其他竹类相近,变异不大。将这批种子育苗15000多株,随机选择39株,典型选择25个叶片大的植株,共64个单株,采集叶样,运用扩增片段长度多态性( AFLP )分子标记技术进行遗传多样性检测。筛选E-ACA/M-CAA等8对引物对样品经行扩增,电泳分离,利用GeneScan 3.1软件共统计到1728条谱带,计算出其多态位点百分率90.28％,Nei’ s基因多样性指数0.2463,Shannon多样性指数0.3623,为遗传多样性大的类型;采用单匹配相似系数法对样品谱带进行UPGMA聚类,取SM＝0.76,可将分析样品聚为3类,结合表型进一步进行种质挖掘研究。该研究结果为其生物多样性保育及选育优良品种提供了科学依据。     

观叶福禄桐遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记对9个观叶福禄桐品种进行遗传多样性和亲缘关系分析,从100条引物中筛选出9条稳定、多态性高的引物用于PCR扩增,共获得70条带,其中多态性条带61条,多态百分率为87.14%。聚类结果显示,品种间相似性系数为0.346 9-0.816 3,聚类结果与品种间的地理来源紧密相关,从外观形态上比较,亲缘性较近的叶形和株型相似性较高;观叶福禄桐各品种间基因型差异较小,亲缘关系较近,遗传基础相对较窄。     

锐药竹种子苗光合生理生态特性分析

为了解引自埃塞俄比亚的锐药竹(Oxytenanthera abyssinica)幼苗的生长情况,对2年生竹株的光合生理生态特性进行了研究。结果表明,锐药竹的Chl a/b接近2.3∶1,Chl b含量偏高,说明具有一定的耐阴性。当光照强度为800~1600μmol m~(-2)s~(-1)时,未出现光抑制现象,表明其对光照具有较强的适应性。锐药竹的表型性状与生理生态性状间存在较好的相关性。根据主成分分析,确认Chl b、ФPSⅡ、Chl a、Fo为其主成分因子,累计方差贡献率达86.89%。根据种质聚类分析,可划分为4个类型。因此,锐药竹实生苗单株在表型、生理生态性状上存在较大差异,具有遗传保育的形态、生理基础。