| 基于RAD高通量测序的蓝花楹群体遗传分析 |
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| 引用本文： | 刘学锋,李小梅,张国武,张沛健,刘果,黄敏,陈银霞.基于RAD高通量测序的蓝花楹群体遗传分析[J].热带亚热带植物学报,2022,30(5):613-622. |
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| 作者姓名： | 刘学锋 李小梅 张国武 张沛健 刘果 黄敏 陈银霞 |
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| 作者单位： | 中国林业科学研究院速生树木研究所,湛江科技学院,中国林业科学研究院速生树木研究所,中国林业科学研究院速生树木研究所,中国林业科学研究院速生树木研究所,中国林业科学研究院速生树木研究所,江西省林业科技推广和宣传教育中心 |
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| 基金项目： | 中央级公益科研院所专项资金项目（CAFYBB2019MB004）；广东省林业科技创新项目 (2018KJCX024)资助； |
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| 摘 要： | 为了解蓝花楹(Jacaranda mimosifolia)种质资源的遗传多样性和群体遗传结构，对168份种质材料进行RAD-seq测序，构建了系统进化树并进行主成分、群体结构和遗传多样性分析。结果表明，比对参考基因组平均比对率为81.02%，平均测序深度23.18×，最终获得45 552个高质量的SNPs。群体遗传结构分析表明，供试蓝花楹可划分为2个大的类群，来自川、渝地区的种质材料基本归为一类；其余地区归为另一类。19个地区的蓝花楹在SNP水平上的遗传多样性较高，云南昆明(YNKM)居群的核苷酸多样性(π)期望杂合度(He)最大，表现出最高的遗传多样性。因此，来自川、渝地区的蓝花楹具有相对较近的亲缘关系，推断来自同一祖先，而其余地区的种质可能是随机引种栽培。
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| 关 键 词： | 蓝花楹 RAD-seq 遗传多样性 群体遗传 |
| 收稿时间： | 2021/9/1 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/3/11 0:00:00 |
Population Genetic Analysis of Jacaranda mimosifolia by RAD Hight Throughput Sequencing Technique |
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| LIU Xuefeng,LI Xiaomei,ZHANG Guowu,ZHANG Peijian,LIU Guo,HUANG Min,CHEN Yinxia.Population Genetic Analysis of Jacaranda mimosifolia by RAD Hight Throughput Sequencing Technique[J].Journal of Tropical and Subtropical Botany,2022,30(5):613-622. |
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| Authors: | LIU Xuefeng LI Xiaomei ZHANG Guowu ZHANG Peijian LIU Guo HUANG Min CHEN Yinxia |
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| Institution: | Research Institute of Fast-growing Trees, Chinese Academy of Forestry,Zhanjiang University of Science and Technology,Research Institute of Fast-growing Trees, Chinese Academy of Forestry,Research Institute of Fast-growing Trees, Chinese Academy of Forestry,Research Institute of Fast-growing Trees, Chinese Academy of Forestry,Research Institute of Fast-growing Trees, Chinese Academy of Forestry,Jiangxi Forestry Sci-tech Promotion and Propaganda Education Center |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Jacaranda mimosifolia RAD-seq Genetic diversity Population genetic |
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