人血小板生成素氨基端功能区cDNA的克隆及其定点突变

以Nested－PCR方法从人肝cDNA基因文库中扩增出编码人血小板生成素（hTPO）前153个氨基酸的氨基端功能区cDNA;在扩增中,采用非连续多核甘酸定点突变的方法．将翻译起始的七个氨基酸的原核中不常用的密码子同又突变成使用频率较高的密码子,以便于其在大肠杆菌中表达。序列测定证实了预期的结果。     

逆转录套式PCR检测粪便样本中的SARS冠状病毒

为了观察SARS冠状病毒在SARS患者粪便中的存在规律,建立了检测SARS冠状病毒RNA的逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法,并应用该方法检测了241份SARS患者粪便样本。部分PCR产物应用测序技术进行验证。RT-PCR的灵敏度为10^-10稀释度的病毒原液(原液为10^8TCID50／ml)。241份粪便样本的总体检出率为24．1％(58／241),其中发病后的前10d和20d的检出率均为50．0％。随着发病时间的延长,阳性检出率呈下降趋势。应用RT-PCR从粪便中检测SARS冠状病毒是可行的,在发病50d以后仍有17．0％左右的阳性检出率,提示SARS恢复期患者具有排毒的可能性,给后续的卫生防疫措施提供了一定的参考数据。     

人类基因组3pter-p26区域的序列比较分析

对人类基因组3号染色体短臂的3pter-p26区域进行了初步分析, 序列组装后整个区域全长约为8.1 kb, 靠近端粒区还存在一个约20~30 kb的空洞. 序列比较分析表明: (ⅰ) 该区域的GC含量为38.5%, 为人类基因组所有近端粒区域最低; (ⅱ) 共含有42个基因, 平均大小为97.5 kb, 以前通过基因连锁分析定位于该区域的基因Cntn3存在定位错误, 应位于3p12.3; (ⅲ) 该区域散在重复序列活跃程度高于全基因组平均水平, 其中(TA)_n含量是全基因组平均水平的2倍; (ⅳ) 该区域在小鼠6号染色体104.1~112.4 Mb的位置有一个保守的同源序列; 通过染色体进化分析推断, 3pter-p26区域可能于最近的一次染色体重排之后才转移到染色体的末端, 其发生时间应在人与小鼠的基因组分离之后, 在这次重排过程中, 染色体断裂点附近的一些序列, 连同所包含的基因发生了丢失, 而丢失的基因总拷贝数却在基因组的其他地方得到了增加; (ⅴ) 3pter-p26区域较低的GC含量可能不利于保持染色体末端的稳定, 容易发生DNA丢失, 而这又可能是引发基因表达异常导致疾病的原因之一.     

葡萄球菌激酶（Sak）的基因克隆和高效表达工程菌的构建

利用ＰＣＲ技术,从金黄色葡萄球菌中扩增Ｓａｋ基因并将其克隆到ｐＵＣ１９质粒上,确认其碱基序列正确后,再将其亚克隆到ｐＪＷ２质粒并转化大肠杆菌ＤＨ５α获Ｓａｋ高表达工程菌（ＤＨ５α／ｐＪＳ）。试验结果表明,Ｓａｋ可占菌体总蛋白的５０％。     

基因组学研究中一些常用软件的概述

基因组学是以一个物种的全部遗传信息为研究对象,在整体上研究遗传信息的分子组成、组织结构、表达调控和进化等内在机制的基础性学科。基因组学研究中海量数据的存储、管理和检索,以及对这些数据进行挖掘等过程, 必须借助于生物信息学的方法。 目前,大量成熟的软件广泛地应用在基因组学研究中,它们大都可通过互联网免费访问或索取。本文拟对人类基因组计划中常用的一些软件如序列比对、序列组装、重复序列鉴定和基因预测等软件的原理作一介绍,并结合典型软件加以说明。 Abstract:Genomics is a novel subject that has been developed accompanying with the progress of human genome project.Genomics deals with the chemistry component,structure organization and evolution of genome at global level.As genomics associated with huge data,bioinformatics plays an important role in these processes of data production,data management and data mining.At present,many reliable programs have been used in genomic research successfully,which are usually accessible and downloaded freely.We address here the principles of some programs used wildly in genomics such as sequence alignment,sequence assembly,repeat identification and gene prediction,which are exemplified with typical programs respectively.     

应用套式RT-PCR检测SARS患者血液样品中SARS冠状病毒

建立了套式RT-PCR方法检测SARS患血液样品中SARS冠状病毒的方法,并检测血液样品257份。同时将RT-PCR与ELISA检测IgG、IgM的方法进行了比较。结果RT-PCR方法的总检出率为72％,IgG总检出率为68％,IgM总检出率为43％。     

药物基因组学研究进展

不同病人对同一药物表现出不同的药物疗效和毒副作用的现象一直困扰着临床医疗及制药业。目前几类常见疾病的临床治疗有效仅在 4 0 - 6 2 %之间 ,肿瘤治疗的有效率更低达2 4 % ,如表 1[1] 。据ＷＨＯ统计 ,住院病人因用药不当引起的不良反应发生率 10 - 2 0 % ,其中 5 %死亡。美国每年就有 2 0 0万以上的病人因用药不当导致病情加重 ,其中近 10万人因副反应死亡 ,是死亡的第四大原因[2 ] 。表 1　不同类型疾病及临床有效率治疗领域有效率 (% )早老性痴呆 (Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ’ｓ) 30止痛 (Ａｎａｌｇｅｓｉｃｓ) 80哮喘 (Ａｓｔｈｍａ) 60…