一种新的标记核糖核酸3′末端的方法

T_4RNA连接酶可以把[5′-~(32)p]核苷-3′,5′-双磷酸连接到RNA的3′羟基上,用此方法标记的RNA可以用于3′末端及其邻近的碱基顺序分析。     

高温反向顺序测定

单链克隆DNA的反向测序是一个简单和快速的方法,这个方法可利用原来的DNA再进行反向顺序测定,从而达到校正和积累DNA数据的作用。由于反向测序的本质是双链测序,所得到的DNA顺序的图谱背景较深,伴有杂带,或在x光显影上是不清晰的。本文报道利用我们实验室所开发的热稳定性的Bst聚台酶系统,进行反向测序克服了这些缺点,获得的图谱可以和单链DNA模板测序的图谱相媲美。我们以nod D 487-mp 8 ss-DNA为模板进行反向测序,证明Bst聚合酶在65℃反应能得到满意的结果。     

芽孢杆菌中的限制性核酸内切酶

我们从66株国内收集的芽孢杆菌中筛选出10株菌株,它们含有限制性核酸内切酶活力。这些酶已经分别部分纯化并鉴定了其专一性。Bsp211Ⅰ、Bsp226Ⅰ及Bce71Ⅰ是Hae Ⅲ的异源同功酶,识别顺序是,Bsp211Ⅰ的切点如箭头所示。Bsp105Ⅰ、Bsp67Ⅰ、Bsp64Ⅰ、Bsp74Ⅰ及Bsp76Ⅰ和MboⅠ有相同的识别顺序:此顺序中腺嘌呤被甲基化后,Bsp105Ⅰ与MboⅠ一样不能切割,而Bsp67Ⅰ不论此顺序中腺嘌呤是否甲基化均能识别并切断,它们的切点如箭头所示。Bsp63Ⅰ及Bsp78Ⅰ是PstⅠ的异源同功酶,识别顺序是:Bsp63Ⅰ的切点如箭头所示。     

芽孢杆菌中的限制性核酸内切酶

我们从66株国内收集的芽孢杆菌中筛选出10株菌株,它们含有限制性核酸内切酶活力。这些酶已经分别部分纯化并鉴定了其专一性。Bsp211Ⅰ、Bsp226Ⅰ及Bce71Ⅰ是HaeⅢ的异源同功酶,识别顺序是■,Bsp211Ⅰ的切点如箭头所示。Bsp105Ⅰ、Bsp67Ⅰ、Bsp64Ⅰ、Bsp74Ⅰ及Bsp76Ⅰ和MboⅠ有相同的识别顺序:■。此顺序中腺嘌呤被甲基化后,Bsp105Ⅰ与MboⅠ一样不能切割,而Bsp67Ⅰ不论此顺序中腺嘌呤是否甲基化均能识别并切断,它们的切点如箭头所示。Bsp63Ⅰ及Bsp78Ⅰ是PstⅠ的异源同功酶,识别顺序是:■,Bsp63Ⅰ的切点如箭头所示。     

DNA顺序有序测定中特定亚克隆的 简便检出

在按非随机法测定策略由Dnase I处理获得大量亚克隆后,随机从中选出一些亚克隆测定其DNA顺序,就可以迅速获得几组彼此不相联的亚克隆组,以这些亚克隆组首尾的克隆作电泳对照,与混合克隆同时电泳,就能方便地检出填平克隆组间空缺的特定亚克隆。用此方法,我们迅速完成了对含有psr基因的4064bp DNA片段的DNA顺序测定。