一种高效快速的鱼类标本基因组DNA提取方法

以95%酒精保存的黄鳝(M onopterus albus)和斑鳢(Channa maculates)标本为材料,采用先沉降DNA再去除杂质的方法从鱼类标本中提取基因组DNA。基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度法检测以及PCR扩增结果显示,本方法提取的鱼类基因组DNA的电泳主带清晰明亮;A260/A280值在1.7830-2.0144之间;PCR扩增产物条带清晰明亮,且单一整齐没有拖带,表明本方法可从酒精保存的鱼类标本中提取比较纯净的DNA,能够满足一般分子生物学试验需要。与传统苯酚/氯仿法相比,本方法操作简单快速,避免了苯酚等物质对后续实验的影响,可作为一种常规动物组织DNA提取方法。     

福建东张水库陆封型香鱼的遗传变异

测定了福建东张水库18尾陆封型香鱼的ND4-tRNA^Ser基因533 bp序列,发现2个可变位点和2个简约信息位点,共检测到4种单倍型。基于Kimura 2-parameter模型的遗传距离在0.001 9～0.003 9之间,在NJ系统树上无明显谱系结构;单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.627和0.001 37,平均核苷酸差异数为0.732,远低于两侧洄游型日本香鱼指名亚种(Hd为0.793,Pi为0.002 94),与被列为IUCN濒危物种名录的日本琉球香鱼亚种(Hd=0.519,Pi=0.001 11)相当。东张水库香鱼遗传多样性如此贫乏到底是历史原因还是近期陆封的结果,仍需进一步研究。目前亟待采取有效措施保护东张水库陆封香鱼。     

固相萃取-气相色谱法测定水和废水中四种氯苯类有机污染物

研究了用固相萃取技术结合氢火焰气相色谱法测定水和废水中四种氯苯类有机污染物。通过实验比较Sdex C18,Sep-Park Vac Silica,Bond Elut CARBON,Bond Elut SI和Bond Elut PLEXA五种SPE小柱对四种氯苯类的萃取效率,发现Dionex的Sdex C18柱有很好的回收率。系统研究了最佳萃取条件,甲醇洗脱体积为4.0 mL,且洗脱液不可通过氮吹浓缩;四种氯苯类化合物除氯苯外穿透体积都在1.0 L以上,而氯苯的穿透体积为300 mL,表明Sdex C18柱对二氯苯和三氯苯有很强的吸附性。在最佳萃取和测定条件下,方法线性范围为20.0~400μg/L,检出限为0.383~0.635μg/L,完全满足日常环境监测分析要求。     

基于线粒体细胞色素b基因全序列的海南长臀鮠南渡江种群遗传变异分析

测定了海南南渡江15尾海南长臀鮠(Cranoglanis bouderius multiradiatus)的cytb基因全序列1138bp,发现3个可变位点和1个简约信息位点,共检测到4种单倍型。海南长臀鮠Cytb基因具有典型的起始密码子(ATG)和不完全终止密码子(T^**),共编码379个氨基酸,密码子第三位点G的含量仅2.9%,而C和A的含量分别为39.1%和38.5%,在第二位点上T的使用频繁高达41.3%,表明cytb基因在密码子碱基的使用具有偏倚性。海南长臀鮠基于Kimura-2-parameter模型的单倍型间遗传距离为0.0009～0.0017,在NJ系统树中没有明显的谱系结构,单倍型多样性(0.600)和核苷酸多样性(0.0006)都较低,表明海南长臀鮠遗传多样性非常贫乏,应及时采取有效措施保护海南南渡江种群。     

华南3个赤眼鳟群体Cytb基因的遗传变异

测定了珠江和韩江3个群体21尾赤眼鳟线粒体细胞色素b基因1 029bp序列片段,发现11个单倍型,14个变异位点。韩江群体单倍型多样度h(0.464)和核苷酸多样度π(0.000 97)较低,珠江水系左江和郁江群体较高(h=0.929-1,π=0.023 6-0.036 9)。在邻接树上不同地理来源的个体混杂,没有明显的谱系结构和地理聚群。Fst值和AMOVA分析亦显示珠江与韩江群体之间没有显著遗传分化。单倍型网络图呈星状结构,中性检测Tajima's D和Fu's Fs均为显著负值,核苷酸不对称分布分析呈单峰模式,说明华南赤眼鳟群体可能在晚更新世(164-66KaBP)曾经历过种群的快速扩张。