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广义青篱竹属(Arundinaria)核糖体DNA ITS序列及亲缘关系研究 总被引:8,自引:0,他引:8
利用PCR扩增产物直接测序的方法分析广义青篱竹属(Arundinaria)中有关争议类群的代表种或模式种(毛竹为外类群)等18种竹种的核糖体DNA内转录间隔区(Internal Transcribed Spacers,ITS)序列。通过最简约性分析产生的ITS系统发育树表明,供试竹种形成一个自然的单系类群,这说明广义青篱竹属中这些不同的类群归属青篱竹属是合理的。17种竹种可聚为2大分支:其中斑苦竹(A,oleosa)、仙居苦竹(A.hsienchuensis)、茶秆竹(A.amabilis)、长叶苦竹(A.chino)、苦竹(A.amara)、宜兴苦竹(A.yixingensis)、菲白竹(A.fortunei)、翠竹(A.pygmaea)为一个分支;而大明竹(A.graminea)、巴山木竹(A.fargesii)、冷箭竹(A.faberi)、凤竹(A.hupehense)、鼓节矢竹(Pseudosasa japonica cv.Tsutsumiana)、矢竹(Pseudosasa japonica)、短穗竹(Brachystachyum densiflorum)、肿节竹(A.oedogonata)、少穗竹(A.sulcata)组合在另一分支。ITS系统发育树还表明,大明竹与巴山木竹、鼓节矢竹与矢竹、少穗竹与短穗竹和肿节竹关系极为密切,均得到较高的Bootstrap(分别为99%、100%和87%)的支持;茶秆竹与仙居苦竹关系非常密切,茶秆竹可归隶到青篱竹属中;翠竹和菲白竹关系密切,且与苦竹类竹种分为两个分支。 相似文献
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新疆石竹属野生种核糖体DNA的ITS序列与亲缘关系 总被引:16,自引:1,他引:15
新疆是我国石竹属植物分布和分化中心,种质资源丰富。通过采用PCR直接测序法,对新疆石竹属(Dianthus)植物野生种共8个种及外类群(Lychnis coronata Thunb)rDNA的ITS区(包括ITS-1,5.8S,rDNA和ITS-2)进行序列测定。研究结果说明,新疆石生属植物的ITS序列总长度为617-621bp,长度变异较小,仅相差4bp,种间序列同源性很高,达97.6%-99.8%,外类群的序列同源性为80%左右。ITS区序列在石竹属内是相当保守的,石竹属物种间序列变异位点基本上是转移多于颠换,且转移率较高,转换/颠换率为1.0-3.0。系统地位和亲缘关系分析表明分布于中国的石竹属植物3个组即齿瓣组(sect.Barbulatum Williams)和石竹组(sect.Dianthus),遂瓣组(sect.Fimbriatum Williams)的亲缘关系较远,而sect.Dianthus与sect.Fimbriatum Williams的亲缘关系较近。ITS系统发育树揭示了石竹组起源早于遂瓣组和齿瓣组,其结果与传统形态学论述存在很大差异。 相似文献
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新疆杨高效遗传转化系统的建立 总被引:9,自引:0,他引:9
选择新疆杨(Populus alba L.var.pyramidalis Bge.)为遗传转化受体材料,为建立根癌农杆菌介导新疆杨高效遗传转化系统,从预培养时间、侵染时间、共培养时间、添加乙酰丁香酮(AS)的时机、共培养培养基中添加乙酰丁香酮浓度、侵染菌液的制备方法、外植体继代方式等7个方面优化筛选。结果显示较合适的转化系统为:预培养8h,农杆菌菌液(OD600=0.4)侵染15min,共培养5d,侵染菌液的最优制备方法是液体培养活化农杆菌2次加离心收集菌体重悬,共培养培养基中添加乙酰丁香酮80μmol/L。新疆杨叶盘转化频率可达38.10%。 相似文献
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美洲黑杨抗黑斑病基因的RAPD标记筛选和连锁分析 总被引:7,自引:0,他引:7
以美洲黑杨(Populus deltoides Bartr.cv.“Lux”(I-69/55))为母本,欧美杨(P.euramericana cv.I-45)为父本得到的F1为材料,其中I-69对黑斑病表现为高度抗病,I-45为高度感病。利用分离群体混合分析(bulked segregrants analysis,BSA)技术建立两个DNA池(感病池和抗病池),筛选出了与抗黑斑病性状基因相连锁的RAPD标记:OPAI17―1550、OPAI13―900。利用选择性基因型分析法进行标记―抗黑斑病基因连锁分析,两标记与抗黑斑病基因遗传距离分别为29.9cM和37.4cM。
Identification of Markers Linked to Resistance Locus of Marssonina Leaf Spot in Poplars by Bulked Segregant Analysis(BSA)
ZHANG Bo1,HUANG Min-ren1,ZHUGE Qiang1,HAN Zheng-min1,YIN Tong-ming1,PAN Hui-xin1,ZHU Li-huang2,WU Rong-ling3,WANG ming-xiu1
1.The Key Laboratory of Forest Tree Genetic Engineering,Nanjing Forestry University,Nanjing,210037,China;
2.The Institute of Genetics and Developmental Biology,Chinese Academy of Science,Beijing 100101,China;
3.Department of Statistics,University of Florida,Gainesville,Florida 32611,USA
Abstract:DNA markers linked to resistance locus of Marssonina leaf spot in poplars were found by bulked segregant analysis(BSA).The bulks consisted of individual with a extreme phenotype taken from a population of 91 F1 clones,which is a progeny of Populus deltoides Bartr.cv.“Lux”(I-69/55)(Resistance) and P.euramericana cv.I-45(Susceptible).Out of 114 RAPD primers,four markers showed polymorphisms between the resistance-bulk and the susceptible-bulk.By using selective genotype linkage analysis,OPAI17-1550 and OPAI13-900 were found linked to the resistance locus.The genetic distances between the two markers and the resistance locus were 29.9cM and 37.4cM,respectively.
Key words:BSA; RAPD; selective genotype analysis; Marssonina leaf spot 相似文献
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香石竹叶片离体再生体系的建立 总被引:2,自引:1,他引:1
以香石竹(Dianthus caryophyllus Linn.)无菌苗叶片为外植体,从不同细胞分裂素及其他激素配合使用等方面进行筛选,建立香石竹叶片离体再生体系.结果表明,不同的细胞分裂素影响叶片不定芽分化频率,其中较低浓度的6-BA(0.5 mg·L-1)和TDZ(0.001 mg·L-1)配合使用能有效诱导香石竹叶片不定芽分化;添加一定浓度的PP333(4 mg·L-1)可提高叶片不定芽分化频率和平均芽数.香石竹叶片不定芽分化的适宜培养基为:MS 0.002mg·L-1TDZ 0.5 mg·L-16-BA 0.2 mg·L-1IAA 4 mg·L-1PP333;壮苗培养基为:MS 0.2 mg·L-1 6-BA 0.2 mg·L-1IAA;生根培养基为:1/2 MS.不定芽诱导频率达到42.61%,平均芽数为4.53个. 相似文献
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转天麻抗真菌蛋白GAFP基因烟草的获得及离体抑菌活性检测 总被引:7,自引:0,他引:7
通过根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)介导,采用叶盘法将天麻(GastrodiaelataBl.)抗真菌蛋白基因GAFP转入烟草(NicotianatabacumL.),PCR和Southern blotting分析证明已将GAFP基因整合进烟草植株。体外抑菌实验表明GAFP转基因的烟草植株对真菌瑞氏木霉(Trichodermareesei)表现出一定的抑菌活性。 相似文献