来自于变性链球菌的脱氧胞嘧啶核苷酸脱氨酶的表达，纯化，结晶以及初步晶体学研究

脱氧胞嘧啶核苷酸脱氨酶属于脱氧胞苷酸脱氨家族.对来自于变性链球菌UA159的脱氧胞嘧啶核苷酸脱氨酶进行了克隆,在大肠杆菌中进行了表达,最后纯化.快速液相分子排阻色谱分析表明这种酶在溶液中形成六聚体.利用悬滴气相扩散技术获得了这个蛋白的晶体.在北京同步辐射的3W1A线站,收集了衍射分辨率到达3.1!的数据.这个晶体属于P213空间群,其晶胞参数为a=b=c=113.2",!="=#=90°.计算可得马修斯系数为3.6#3·Da-1,据此可估计在一个不对称单位中含有两个单亚基.据目前所知,这是第一个关于野生型的脱氧胞嘧啶核苷酸脱氨酶的结晶学报道.     

闻香识茶:武夷岩茶地域香代谢组及离子组基础

不同地域的武夷岩茶具有独特香味,俗称"地域香",但"地域香"是否存在及其影响因素缺乏科学依据.本研究在武夷山四大产区随机选取350个茶园,分别采集茶青3500份、土壤900份.利用气相色谱飞行时间质谱仪测定茶青香气代谢物,对329个代谢信号进行聚类分析,发现武夷岩茶(水仙)香气代谢物聚为两大群,分别为高山、正岩群和半岩...     

龋齿致病菌变性链球菌蛋白Smu_195c的制备、结晶及初级晶体学分析

变性链球菌(Streptococcus mutans)是最主要的龋齿致病菌.其中Smu_195c为一个约10ku(86个氨基酸)的蛋白质,序列比对结果显示,它没有包含保守的结构域,功能也是未知的.为揭示其功能,在大肠杆菌BL21(DE3)中表达了N端结合了6个His的编码Smu_195c的DNA片段.通过悬滴法得到了两种不同晶系的晶体.第一种属于空间群P6122或P6522,晶格参数为a=b=62.93!,c=90.63",γ=120°;第二种属于空间群P41212或P43212,晶格参数为a=b=57.97#,c=103.51$.N端带有His的蛋白质长出的晶体属于第一种,而切掉N端的6个His后的蛋白质长出的晶体两种都有.     

一方水土养一方茶:产地影响武夷岩茶品质的代谢组基础

武夷岩茶是中国乌龙茶中的极品,"岩韵"是衡量岩茶品质的关键因素.自古以来,岩茶"岩韵"的强弱与产地密切相关,然而产地对岩茶"岩韵"的影响一直缺乏科学依据.本研究随机选取了来自武夷岩茶三大产区(正岩、半岩、洲茶)的112个茶园,采集了1120个茶青样品和224个相应的土壤样品,通过代谢组技术结合大样品数据分析,探讨了产地对"岩韵"的影响.首先采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)分析了不同产地岩茶非挥发性代谢物表型,发现来自武夷茶区不同产地的岩茶,其代谢物组成具有显著的差异.利用检测到的1058个代谢信号对岩茶产地进行分类的正确率高达94.94%,正岩茶和洲茶大部分点及区域呈现出明显的分离状态,而半岩茶则处于两者之间,说明岩茶"岩韵"确实客观存在.利用产地作为限制条件进行限制性主坐标轴分析(constrained principal coordinate analysis, CPCoA),发现产地对代谢物质总变异的贡献极其显著,产地可解释代谢物总变异的32.9%.相似性分析(analysis of similarities, ANOSIM)结果表明,同一产地不同茶园间茶青代谢物相似度极高(R=0.6380),表明"岩韵"确实与产地密切相关,正岩茶的"岩韵"显著异于洲茶,半岩茶则处于二者之间.通过不同产地茶园耕层土壤肥力指标(pH值、有机质、碱解氮、有效磷和速效钾)的综合分析,发现不同产地茶园土壤肥力差异显著,其变化趋势与茶叶代谢组变化趋势极为吻合,说明武夷茶区各产地茶园土壤肥力的差异可能直接影响了岩茶的"岩韵".此外,利用高效液相色谱系统(high performance liquid chromatography, HPLC)定量测定了8项主要的茶叶品质成分:茶氨酸、咖啡碱、儿茶素、表儿茶素没食子酸酯(epicatechin gallate, ECG)、表没食子儿茶素没食子酸酯(epigallocatechin gallate, EGCG)、表没食子儿茶素(epigallocatechin, EGC)、没食子儿茶素(gallocatechin, GC),以及没食子儿茶素没食子酸酯(gallocatechin gallate, GCG).研究发现各土壤肥力指标与不同茶叶品质成分具有显著的相关关系,进一步说明土壤肥力确实影响了岩茶的品质,进而可能影响其"岩韵".本研究结果为解析产地与"岩韵"的关系提供了科学依据,也为培育适宜土壤、合理施肥,及管理高品质茶园提供了参考.