海洋侧孢短芽孢杆菌Lh-1抗菌活性物质的分离及特性研究

采用超滤、DEAE-Sephadex A25和CM-Sepharose FF离子交换层析及HPLC反相层析等步骤得到了海洋侧孢短芽孢杆菌(Brevibacillus laterosporus)Lh-1的抗菌活性物质,命名为R-1。HPLC纯化出的抗菌物质经质谱测定其分子量为1608.023Da,BIO-RAD等电聚焦测得其pI为8.55,氨基酸分析表明该物质由Leu、Tyr、Val、Ile、Lys、Gly、Met、Ser、Ala9种氨基酸组成。该抗菌物质具有极强的耐热、耐酸碱特性,在pH11.0~12.0条件下,121℃处理1h,其活力保持在75%以上。经3种蛋白酶(碱性蛋白酶、胰酶、胃蛋白酶)处理后,活性保持在80%以上。茚三酮反应阳性。推测R-1可能是低分子量的脂肽。抑菌试验表明对食品腐败菌、致病性革兰氏阴性、阳性菌及少数真菌均有抑菌活性。     

单功能过氧化氢酶的高级结构

单功能过氧化氢酶是在生物界广泛分布的抗氧化酶.近年来,人们在对单功能过氧化氢酶一级结构与生化性质深入研究的基础上,针对十几种单功能过氧化氢酶的高度保守的空间结构开展了研究.认识了其活性中心的血红素及周围保守残基,发现了酶的许多特殊结构,如方向不同的血红素,增强酶抗氧化性的侧链残基的共价键和保证酶高效催化的分子内通道等.本文综述了单功能过氧化氢酶空间结构研究现状,概括了酶构象的基本特点,分析了关注和争议较多的酶血红素、肽链侧链共价键及酶分子内通道等重点问题.深入研究单功能过氧化氢酶空间结构是一挑战性的课题,它将推动酶蛋白高级结构形成和酶催化模式等基础理论研究.     

几种海洋微藻的氨基酸含量

分析测定分属硅藻,绿藻和蓝藻的７种海洋饵料微藻氮和氨基酸含量。氮含量范围为４．０４％～９．８６％,总氨基酸中共测出１７种氨基酸,含量范围为１．２３％～９．７４％。名藻的总氨基酸含量顺序与氮含量相同     

海洋细菌QD80低温碱性蛋白酶的基因克隆和性质

对海洋细菌QD80所产低温碱性蛋白酶进行了基因克隆和序列分析,对此酶的性质进行了初步研究.此酶基因开放阅读框架为1377bp,分子量为49.9kD.此序列上游-8bp处为该基因的SD序列,-10区和-35区分别有5′TAGAAT3′和5′TTGACC3′的保守序列.该酶最适pH为9.5,最适反应温度为30℃,在10℃酶活力仍能保持30%以上.该酶对氧化剂H2O2的抗氧化作用明显,浓度达到4gL时酶活仍保留85%.该蛋白酶的低温适应性和抗氧化特性将对其在低温洗涤领域的应用提供广泛的潜在应用价值.     

锌金属蛋白酶家族介绍及结构机理研究进展

锌金属蛋白酶是一类分布广泛,种类繁多的水解酶家族,是近年来人们研究的热点．一般来说,HEXXH保守序列一直都作为锌金属蛋白酶家族分类的依据．除此之外,不同种类的酶还有一些其它的序列特征．谷氨酸锌蛋白（gluzincin）在锌离子配体处共有2组保守区域;甲硫氨酸锌蛋白（metzincin）则拥有1个延长的保守序列HEBXHXBGBXH,里面包含了第3个His配体．大量的金属蛋白酶晶体结构被解析出来,从中可以发现该类酶的活性中心都包含有1个锌离子．锌金属蛋白酶的催化机理通常认为是锌离子与1个水分子结合活化而成．但是,最近的发现证实了并不是所有的锌金属蛋白酶催化都需要水分子参与活化．在本文中,综述了这些已发表的锌金属蛋白酶家族的分类、结构特征、底物特异性识别和催化机理．     

超嗜热羧酸酯酶的性质和应用研究

摘要 来源于超嗜热菌的超嗜热羧酸酯酶,结构上与激素敏感性脂肪酶(HSL)家族近似,属于α/β-水解酶,但是其空间结构比HSL更加紧密而有韧性,具有很强的热稳定性。性质研究表明,温度和有机溶剂对超嗜热羧酸酯酶的活性和对映选择性影响显著;其最适底物一般是对硝基苯酯,部分酯酶的基因含有GGGX基序,能够水解叔醇酯结构。由于超嗜热羧酸酯酶的独特结构和性质,其应用潜力巨大,尤其在拆分手性的外消旋酯方面独具优势。     

海洋侧孢短芽孢杆菌Brevibacillus laterosporus Lh-1 产抗菌肽R-1的培养条件优化

采用Plackett-Burman(PB)设计和响应面分析(RSM)方法, 对一株海洋侧孢短芽孢杆菌Lh-1产抗菌肽R-1的发酵条件进行了优化。研究中数据的统计和分析均使用MINITAB 15.0。在研究中, 首先使用了Plackett-Burman (PB)设计对影响Lh-1产抗菌肽的15个因素进行了筛选, 得到了影响产量的显著因素为：葡萄糖、蛋白胨和氯化钙。在此基础上采用响应面法对该3个显著因素的最佳水平范围进行研究, 得到的最佳浓度为 15.72 g/L 葡萄糖、6.01 g/L 蛋白胨和3.29     

低温碱性蛋白酶QDAPr的生物信息学分析及同源模建

对一株来自黄海的假单胞杆菌QD80所产的碱性蛋白酶QDAPr进行了生物信息学分析,并用生物信息学软件对其空间结构进行了模拟,同时对模建结果进行了结构质量的分析和检测。最后对模建的结果进行了初步的实验验证。结果表明：该碱性蛋白酶的等电点为8．52,外源性氨基酸为32．9％,二级结构中α螺旋占5．88％,β折叠片占14．6％,与铜绿假单胞菌的碱性蛋白酶的同源性为76％。三维结构检测表明此模型的结构符合立体化学和生物学功能。同源性分析表明该模建模型含有HEXXHXUGUXH的基元（motif）,通过BrAc修饰实验初步验证了活性中心的功能。