我国微生物学科在国际学术中的地位及前景研究--基于“基本科学指标数据库”的分析

本研究基于基本科学指标（ESI ）数据库收录的微生物学领域2003～2013年度资料,利用文献计量学方法进行统计,获得该学科有显著意义和高被引的国家（地区）、机构及期刊分布,并分析该学科的高被引论文和热点论文。结果显示,我国在微生物领域的科研产出量已逐步提升到较高水平,但论文的国际影响力有待进一步提高。     

基于Web of Science的合成生物学文献计量分析

合成生物学是一个新兴的交叉学科,近年来得到了广泛关注。本文以1992-2012年期间Web of Science数据库收录的5012篇与合成生物学相关的论文为研究对象,进行年代分布、地域分布、机构分布、研究热点等方面的计量分析,以探究合成生物领域的研究实力分布、研究热点与发展动态。通过文献计量分析发现合成生物学领域近十年来发展迅猛,美国等发达国家占据主动。我国在该领域的论文产出数量可观,但学术影响力有待提高。研究的热点主要集中在基因调控网络构建、基因基因组合成、功能回路设计等方面。     

基于CSCD的盐生植物研究文献计量评价

以中国科学引文数据库（CSCD,477篇）为主线,以维普、万方和CNKI数据库（3329篇）为基础数据,采用文献计量分析的方法,对盐生植物研究文献进行统计分析,分别从文献的年代、机构、作者、来源期刊、学科类别、高被引论文和文献的关键词这7个方面,对盐生植物研究文献的分布规律和研究现状进行总体回顾与评价。全面概括、总结和分析该研究领域研究热点、区域、内容、技术和方法,优秀人才、领先机构和主要团队,揭示中国盐生植物研究的进展情况。结果表明：1956年有盐生植物论文发表,2007年文献总量340篇为最高记录;在CSCD,1991年有盐生植物论文发表,至2011年62篇为最高,均呈逐年上升趋势。中国在盐生植物研究方面已经形成了引领该研究方向的4个主要科研团队,分别是山东师范大学、中国科学院新疆生态与地理研究所、中国农业大学和南京大学。盐生植物的研究呈现明显的地域相关性,热点地区包括新疆、山东、北京、南京、东北、内蒙古、宁夏、兰州等地。盐生植物研究热点是：耐盐性（耐盐机制）、盐胁迫、盐碱地、基因克隆、土壤盐分、植物生长、开发利用、渗透调节、生理指标、种子萌发、脯氨酸、基因工程（基因表达）和植物群落等。     

国外公众健康信息学发展研究

通过分析国外公众健康信息学研究的年代分布特点、核心期刊、重要作者和研究热点,探索国外公众健康信息学研究的历史、现状和发展趋势,为国内公众健康信息学领域的研究与实践提供理论参考。利用TDA、Excel等工具,从时间、期刊和作者分布三方面对SCIE数据库收录的公众健康信息学领域的研究文献进行时空维度分析,再进行关键词和高频被引文献分析。从发文量来看国外公众健康信息学研究的发展比较平缓,核心期刊包括医学互联网研究杂志与国际医学信息学杂志,重要作者有Eysenbach Gunther、Keselman Alla等。1994~2013年公众健康信息学研究热点包括基本问题、卫生系统和个人健康记录、健康传播和患者教育以及医学信息学相关学科。高频被引文献内容涵盖公众健康信息学科,公众健康信息系统,电子病历和个人健康记录,互联网对公众健康行为的影响等几个方面。     

基于共词分析的国内生物信息学热点领域研究

利用共词分析和可视化方法对生物信息学的关键词进行聚类分析,探讨该研究领域的学科分类和热点内容.以中国知网、中华医学会数据库中期刊论文为统计来源,对1998～2013年间的5 707篇生物信息学相关文献进行计量分析,提取出40个高频关键词.利用ROST软件得到关键词共词矩阵,在此基础上利用SPSS进行因子分析、聚类分析和多维尺度分析.结合因子分析和聚类分析将生物信息学领域主要研究内容分为7类,结合多维尺度分析对研究热点及变化趋势进行了初步探讨.研究结果较为客观地反映了当前生物信息学领域的学科分类和研究热点,为科研人员进行生物信息学研究提供一些思路.     

Arrogance and ignorance in assessing scientific quality in a multidisciplinary academic medical centre

Several academic institutions in the Netherlands and elsewhere develop indices to rank their scientists which will impact evaluation and steering of research. An important part of these indices is based on bibliometric indices. The development of such ranking indices is often seen as the prerogative of management and is kept out of the process where scientific instruments should be presented and evaluated: peer-reviewed journals. In this case the index of the author’s institution is criticised both for the evasion of discussion as for the lack of compensation for bias related to discipline, gender and personal history. Furthermore, it is argued that the ranking based on ‘numbers’ rather than scientific contributions is detrimental to the motivation of the staff suffering under the several modi of bias, is counterproductive for interdisciplinary achievements and discourages young researchers in less scoring disciplines to find their way in the medical academic arena. (Neth Heart J 2010;18:319-22).     

文本挖掘在生物医学领域中的应用文献计量学分析

目的:近年来,随着生物医学领域文献数量的急骤增长,大量隐含的规律和新知被掩埋在浩如烟海的文献之中,而将文本挖掘技术应用于生物医学领域则可以对海量生物医学文献数据进行整合、分析,从而获得有价值的信息,提高人们对生物医学现象的认识。本文就我国近十年来文本挖掘技术在生物医学领域的应用现状进行文献计量学分析,旨在为我国科研工作者对该领域的进一步研究提供参考。方法:对国内正式发表的生物医学领域文本挖掘相关文献进行检索和筛选,分别从年度变化、地区分布、研究机构、期刊来源、研究领域等方面进行分析。结果:国内生物医学文本挖掘文献总量呈上升趋势,主要集中在挖掘算法的研究和文本挖掘技术在中医药及系统生物学领域的应用方面;北京、上海、广东等地的研究处于领先地位。结论:相比其他较为成熟的研究课题来说,目前文本挖掘技术在生物医学中的应用在国内还属于一个比较新的研究领域,但国内对该领域的认识正不断提高、研究正不断深入,初步形成了一批在该领域的核心研究地区、核心研究机构和核心研究领域,而对其进一步的研究,必将为生物医学领域的发展注入新的活力。     

我国微生物学相关方向研究生论文选题变化分析(1999-2018年)

【背景】当前微生物学研究正处于发展的重要时期,研究生学位论文作为研究生阶段的主要产出,在一定程度上体现了微生物学研究的热点和发展方向,但当前的大多文献计量分析以Web of Science、知网等收录的期刊论文为主,忽略了研究生论文数据库的重要作用。【目的】通过分析我国研究生学位论文的研究选题,为探究我国微生物学相关方向的研究生学位论文的选题热点及变化趋势提供数据支持。【方法】利用文献计量学方法,对1999-2018年收录于中国博硕士学位论文全文数据库的237 562篇以微生物为研究主题的论文进行分析。【结果】发现1999-2018年我国微生物学相关的研究生论文总体呈现增长趋势,学位论文发文量排名前三的科研机构是浙江大学、中国科学院大学和南京农业大学。通过关键词网络分析发现,近10年我国微生物学相关研究生论文的研究领域呈现多样化,关键词网络更加密集,研究主要集中于环境、人类医学和动物医学等领域,与国际热点领域基本一致,但基础微生物研究相对不足。近年来备受关注的一些新兴领域如宏基因组、蛋白质组、工程与药物等在研究生论文选题中仍需加强。【结论】文献分析结果为研究生及其导师选题、推动我国微生物学相关的研究生教育的理论研究和实践探索提供了一定参考。     

肥胖与肠道菌群相关性的研究热点、前沿和演变路径可视化分析

目的了解肥胖与肠道菌群相关性文献的科研合作网络特征、研究热点和前沿及其演变历史等,为后续研究提供参考依据。方法以"obesity"和"gut microbiota"为主题词,基于Web of Science数据库的检索结果,利用VOSviewer和CiteSpace软件对国际肥胖与肠道菌群类研究领域文献进行计量学和可视化分析。结果共检索到3 248篇文献,研究者发文最多的是比利时的Cani(72篇),中国上海的赵立平(30篇)位居第五位;机构以丹麦的哥本哈根大学发文最多(100篇),中国上海交通大学(78篇)和中国科学院(76篇)分别居第三和第四位;中国国家自然科学基金资助最多(495篇),发文量前3位的国家/地区依次为美国、中国、法国。研究热点有短期饮食限制与肠道菌群的关系等,研究前沿与演变路径包括脂肪组织、胰高血糖素、共生细菌、微生物菌群、DNA提取物、细菌科、共生菌群等的研究。结论自2010年开始,该领域发文量和被引频次均呈明显上升趋势,学科发展较好的国家有美国、中国、法国等,本研究结果客观而真实地展示了该领域研究热点及前沿内容,对其演变历史和发展趋势进行分析,可为后续研究发挥指导和借鉴作用。     

基于SCI文献分析我国菌根学研究现状和发展方向

基于美国科学情报研究所(ISI)科学引文索引(Science Citation Index, SCI)数据库, 对1989~2007年期间我国发表的菌根研究论文进行检索, 并采用文献计量方法对所获资料进行统计和趋势分析。结果表明, 1989~2007年间, 我国菌根学研究呈现不断上升趋势, 尤其是2000年之后, 增长速度明显加快。但只有5.22%的论文发表于影响因子大于5的刊物, 在研究深度上仍需进一步加强。半数以上的研究论文与丛枝菌根研究有关, 研究重点主要集中在菌根对植物的生理效应, 菌根与植物抗性