基于支持向量机方法的蛋白可溶性预测

按照蛋白质序列中残基的相对可溶性,将其分为两类(表面／内部)和三类(表面／中间／内部)进行预测。选择不同窗宽和参数对数据进行训练和预测,以确保得到最好的分类效果,并同其他已有方法进行比较。对同一数据集不同分类阈值的预测结果显示,支持向量机方法对蛋白质可溶性的整体预测效果优于神经网络和信息论的方法。其中,对两类数据的最优分类结果达到79．0％,对三类数据的最优分类结果达到67．5％,表明支持向量机是蛋白质残基可溶性预测的一种有效方法。     

不同地理株中肋骨条藻生长特性及RAPD多态性

通过对不同地理株骨条藻形态和亚显微结构的观察和描述 ,鉴定为中肋骨条藻 ,但发现在刺长、细胞间隙、细胞链形态、链上细胞数 ,色素体个数方面存在差别 ;通过不同 N∶ P营养盐实验 ,结果表明 ,在 N∶ P为 16∶ 1时 ,东海株和胶州湾株中肋骨条藻均得到最大生长率 ,分别为 1.6 6 d1 和 1.5 3d- 1 ,东海株中肋骨条藻最大生长率要高于胶州湾株中肋骨条藻 ,这表明在不同的海域环境条件下 ,中肋骨条藻的生长均有各自地域性特征。应用 RAPD技术对两地理株中肋骨条藻进行鉴别 ,以其全 DNA为模板进行 RAPD扩增 ,两不同地理株的中肋骨条藻表现不同的 DNA多态性 ,同样以各自的小亚基片段为模板进行的 RAPD扩增条带也表现出差异性。实验结果表明 ,两株中肋骨条藻应为种下的不同变种或亚种     

基于支持向量机方法的蛋白质氨基酸残基可溶性预测

按照蛋白质序列中残基的相对可溶性,将其分为两类(表面/内部)和三类(表面/中间/内部)进行预测.选择不同窗宽和参数对数据进行训练和预测,以确保得到最好的分类效果,并同其他已有方法进行比较.对同一数据集不同分类阈值的预测结果显示,支持向量机方法对蛋白质可溶性的整体预测效果优于神经网络和信息论的方法.其中,对两类数据的最优分类结果达到79.0%,对三类数据的最优分类结果达到67.5%,表明支持向量机是蛋白质残基可溶性预测的一种有效方法.     

重组链激酶及其三种突变体的活性研究

利用PCR技术从Streptococucspyogenes的基因组DNA中扩增了链激酶的编码基因ska,并进行了序列分析 ,利用基因删除及定点位变技术获得了删除了C-末端 42个氨基酸残基编码区的突变链激酶基因skaΔC42 ,第 5 9位Lys残基突变为Glu的突变链激酶基因skaK5 9E以及删除C-末端 42个氨基酸且第 5 9位Lys残基突变为Glu的突变链激酶基因skaΔC42K5 9E ,将ska及其三种突变体分别克隆到表达载体pET 1 5b上 ,构建分别表达野生型链激酶 (SK)、C-末端缺失 42个氨基酸残基的突变体 (SKΔC42 )、第 5 9位Lys残基突变为Glu的突变体 (SKK5 9E)及C-末端缺失 42个氨基酸且第 5 9位Lys残基突变为Glu突变体 (SKΔC42K5 9E)的表达载体pSK ,pSKΔC42 ,pSK K5 9E ,pSKΔC42K5 9E ,分别转化E .coliBL2 1 (DE3) ,IPTG诱导后在大肠杆菌中实现了高效表达 ,经亲和层析、离子交换层析及分子筛层析 ,获得了rSK、rSKΔC42、rSKK5 9E及rSKΔC42K5 9E ,活性分析表明rSK与其三种突变体具有相同的比活性。     

降气化痰推拿法对慢性哮喘幼鼠气道重塑及血清NO水平的影响

摘要 目的：探究降气化痰推拿法对慢性哮喘幼鼠的治疗效果,为优化临床中小儿慢性哮喘治疗方案积累理论基础。方法：选取40只SPF级3周SD雌性小鼠,随机数字表法为对照组、模型组、药物组和推拿组,每组各10只。模型组、药物组和推拿制备慢性哮喘模型后,药物组使用地塞米松治疗,对照组注射等量生理盐水,推拿组在药物组基础上加入降气化痰推拿手法治疗,模型组不进行干预。比较各组幼鼠肺组织HE染色结果、支气管肺泡灌洗液（BALF）中炎性细胞水平和Th17/Treg细胞比例,并检测肺组织中Treg与Th17相关基因表达量。结果：与模型组比较,药物组和推拿组的支气管周围组织的炎性浸润较轻,肺泡壁及支气管壁的结构较为完整,气道可见少量杯状细胞增生,气道壁总厚度和气道平滑肌厚度增加较少,且推拿组大鼠的组织炎性浸润程度、气道壁总厚度和气道平滑肌厚度均低于药物组（P<0.05）;炎性细胞水平方面,对照组幼鼠的BALF细胞总数较低,白细胞分类中单核细胞数最多。模型组幼鼠的BALF中细胞总数明显增高,且白细胞分类中以中性粒细胞、嗜酸性粒细胞为主,白细胞总数和嗜酸性细胞总数明显高于对照组（P<0.05）;与模型组相比,药物组和推拿组的细胞总数及中性粒细胞和嗜酸性粒细胞的比例明显较低,但仍明显高于对照组,且药物治疗组高于推拿组（P<0.05）;与对照组相比,其余各组幼鼠的BALF中Th17比例明显增高,Treg比例降低,Th17/Treg比值增高（P<0.05）;与模型组相比,药物组和推拿组的Th17比例、Th17/Treg降低,且推拿组低于药物组,Treg比例升高,且推拿组高于药物组（P<0.05）;与对照组对比,其余各组幼鼠的IL-6、IL-10、IL-23、TGF-β mRNA表达水平均升高,与模型组相比,药物组与推拿组幼鼠表达水平均有所降低,且推拿组低于药物组（P<0.05）;与对照组相比,其余各组幼鼠的NO、IgE水平升高,与模型组相比,药物组和推拿组的NO、IgE水平降低,且推拿组低于药物组（P＜0.05）。结论：降气化痰推拿法可通过调节Th17/Treg比例及相关炎性因子基因表达和白细胞类型,调控血清NO、IgE水平和炎性反应水平,进而改善气道重塑,发挥治疗作用。