乳腺癌新辅助化疗的研究进展

乳腺癌是一种女性最常见的恶性肿瘤,近年来我国乳腺癌的发病率呈逐年上升趋势。研究证实,新辅助化疗不仅可使不能手术的晚期乳腺癌患者获得手术机会,而且也增加了部分患者的保乳概率,但是约20%的乳腺癌患者不能从新辅助化疗中获益,并影响后续治疗效果。因此,制定合理的、个体化的新辅助化疗方案对于提高乳腺癌患者的生存质量和改善其预后尤为重要。目前,研究已发现的NCT相关的预测因子主要包块肿瘤类型、分子分型、ER、PR、Ki67等,而HER2、TOP2A、P53、PRAP单独作为预测因子的还存在争议。本文主要对乳腺癌新辅助化疗的现状、各种预测因子的作用及其不足之处进行了综述。     

解淀粉芽孢杆菌TF28抗菌蛋白TasA基因序列分析及蛋白质结构预测

本研究以解淀粉芽孢杆菌TF28为材料,采用PCR方法从基因组DNA中扩增出抗菌蛋白Tas A基因,利用生物信息学方法对Tas A基因序列及其编码的蛋白质结构进行分析和预测。结果表明Tas A基因全长786 bp,含有一个完整的开放阅读框和一个终止密码子,编码261个氨基酸,经Blast比对,该基因与其它解淀粉芽孢杆菌Tas A基因同源性为95%~99%,与B.amyloliquefaciens FZB42(CP 000560.1)Tas A基因序列同源性最高为99%,与B.amyloliquefaciens DSM7(FN597644.1)的同源性最低为95%。预测该基因编码蛋白质分子量为28 k D,等电点为6.35,是含有信号肽和跨膜结构的亲水蛋白,蛋白结构中含有糖基化和磷酸化位点,二级结构中以琢螺旋、茁折叠和无规则卷曲为主。     

microRNA靶基因预测算法研究概况及发展趋势

microRNA（miRNA）是一类约22个核苷酸（nt）长的非编码小分子RNA,广泛存在于动植物细胞中,通过和靶基因的不精确互补配对而裂解mRNA或抑制翻译的起始。准确地预测miRNA靶基因和正确地认识miRNA及其靶基因的作用机理已成为当前研究的热点。作者试图对目前常用的10余个高等生物miRNA靶基因预测软件的实现原理、适用对象及各算法的创新之处等加以综述,以便为进行靶基因预测算法设计人员提供参考,对生物学实验验证提供更好的理论指导。     

面向蛋白质功能位点识别的机器学习平台构建

有关蛋白质功能的研究是解析生命奥秘的基础,机器学习技术在该领域已有广泛应用。利用支持向量机(support vectormachine,SVM)方法,构建一个预测蛋白质功能位点的通用平台。该平台先提取非同源蛋白质序列,再对这些序列进行特征编码(包括序列的基本信息、物化特征、结构信息及序列保守性特征等),以编码好的样本作为训练数据,利用SVM进行训练,得到敏感性、特异性、Matthew相关系数、准确率及ROC曲线等评价指标,反复测试,得到评价指标最优的SVM模型后,便可以用来预测蛋白质序列上的功能位点。该平台除了应用在预测蛋白质功能位点之外,还可以应用于疾病相关单核苷酸多态性(SNP)预测分析、预测蛋白质结构域分析、生物分子间的相互作用等。     

视频脑电图联合PEWS评分、NSE、CD4+/CD8+比值对病毒性脑炎患儿病情评估及预后预测的临床价值

摘要 目的：探讨视频脑电图（VEEG）联合儿童早期预警评分（PEWS）、神经元特异性烯醇化酶（NSE）、CD4⁺/CD8⁺比值对病毒性脑炎患儿病情评估及预后预测的价值。方法：选择2020年3月至2022年3月南京医科大学附属儿童医院收治的152例病毒性脑炎患儿，根据病情严重程度将患儿分为重症组（67例）和轻症组（85例），另选择72例无神经系统损伤住院患儿为对照组。治疗2周后，根据儿童格拉斯哥预后量表（CGOS）将其分为预后良好组（4~5级，89例）与预后不良组（1~3级，63例）。所有研究对象均接受PEWS测评和VEEG检查，检测血清NSE水平，计算CD4⁺/CD8⁺比值。采用单因素和多因素Logistic回归分析影响病毒性脑炎患儿预后的因素。采用受试者工作特征（ROC）曲线分析PEWS、VEEG 及血清NSE、CD4⁺/CD8⁺比值预测病毒性脑炎患儿预后的价值。结果：重症组PEWS、VEEG重度异常比例及血清NSE水平高于轻症组和对照组，CD4⁺/CD8⁺比值低于轻症组和对照组（P＜0.05）；轻症组PEWS、VEEG重度异常比例及血清NSE水平高于对照组，CD4⁺/CD8⁺比值低于对照组（P＜0.05）。预后不良组PEWS、VEEG重度异常比例、血清NSE水平高于预后良好组，CD4⁺/CD8⁺比值低于预后良好组（P＜0.05）。多因素Logistic回归分析结果显示，持续惊厥、高PEWS、VEEG重度异常、血清NSE水平升高是病毒性脑炎患儿预后不良的危险因素，CD4⁺/CD8⁺比值升高是保护因素（P＜0.05）。联合PEWS、VEEG 及血清NSE、CD4⁺/CD8⁺比值预测病毒性脑炎患儿预后曲线下面积为0.859，高于各指标单独预测。结论：病毒性脑炎患儿高PEWS、VEEG重度异常、血清NSE水平升高、CD4⁺/CD8⁺比值降低，与病情加重和预后不良有关，联合以上四项指标辅助预测病毒性脑炎患儿预后的价值较高。     

火棘不同组织内生细菌群落多样性

为了解火棘不同组织内生细菌群落多样性,该研究采用高通量测序技术对火棘内生细菌16S rRNA V5～V7可变区进行测序,分析火棘不同组织部位内生细菌群落多样性。结果表明:(1)从火棘根、茎、叶组织中共获得内生细菌OTU 1 818个,其中根部754个,茎部 308 个,叶部756个,三者共有 OTU 152 个。(2)物种分类显示,不同火棘组织内生细菌具有丰富的群落多样性,火棘根部内生细菌种类隶属于23门53纲137目216科373属557种,其中异样根瘤菌属(Allorhizobium-Neorhizobium-Pararhizobium-Rhizobium)和链霉菌属(Streptomyces)为优势属,其相对丰度分别为 10.57%和 8.00%; 茎部内生细菌种类隶属于21门32纲76目126科204属270种,其中马赛菌属(Massilia)和未知分类的丛毛单胞菌科属(unclassified_f_Comamonadaceae)为优势属,其相对丰度分别为31.10%和12.82%; 叶部内生细菌种类隶属于21门52纲130目210科380属581种,其中土芽孢杆菌属(Geobacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas)为优势属,其相对丰度分别为12.31%和9.84%。(3)PICRUSt功能预测表明,根部内生细菌物种最丰富,参与各种代谢调控的细菌丰度最高。该研究结果为进一步探讨植物内生细菌功能,挖掘新的有益微生物资源提供了参考。     

血清UA、sdLDL、sST2对急性心肌梗死患者PCI术后无复流的预测价值分析

摘要 目的：探讨血清尿酸（UA）、小而密低密度脂蛋白（sdLDL）、可溶性致癌抑制因子2（sST2）对急性心肌梗死（AMI）患者经皮冠状动脉介入治疗（PCI）术后无复流（NRF）的预测价值。方法：选取2021年1月～2023年1月睢宁县人民医院收治的196例AMI患者为AMI组，根据PCI术后是否发生NRF分为NRF组和血流正常组，另选取同期120名体检健康志愿者为对照组。比较AMI组与对照组血清UA、sdLDL、sST2水平。采用多因素Logistic回归分析AMI患者PCI术后NRF的影响因素，采用受试者工作特征（ROC）曲线分析血清UA、sdLDL、sST2水平对AMI患者PCI术后NRF的预测价值。结果：与对照组比较，AMI组血清UA、sdLDL、sST2水平升高（P＜0.05）。196例AMI患者PCI术后NRF发生率为34.69%，NRF组年龄大于血流正常组，糖尿病比例、肌酸激酶同工酶（CK-MB）、肌钙蛋白I（cTnI）、低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）、UA、sdLDL、sST2水平高于血流正常组（P＜0.05）。多因素Logistic回归分析显示，年龄增加和UA、sdLDL、sST2升高为AMI患者PCI术后NRF的独立危险因素（P＜0.05）。ROC曲线分析显示，血清UA、sdLDL、sST2水平单独和联合预测AMI患者PCI术后NRF的曲线下面积AUC(0.95CI)分别为0.707(0.481～0.934)、0.742(0.513～0.955)、0.737(0.480～0.970)、0.863(0.737～0.960)，联合预测大于单独预测指标。结论：血清UA、sdLDL、sST2水平升高为AMI患者PCI术后NRF的独立危险因素，血清UA、sdLDL、sST2水平联合预测AMI患者PCI术后NRF的价值较高。     

基于GM(1,1)组合模型的小麦条锈病预测方法研究

小麦条锈病的预测是制定小麦条锈病防治方案的重要组成部分.鉴于小麦条锈病病害系统的复杂性和灰色性,首先用Brown指数平滑法和灰色预测建立了甘肃天水地区1995年到2003年的普遍率的单项预测模型,然后采用预测残差方差最小的原则进行优化组合,从而获得更为精确的预测模型和预测值,拟合率达到94.5%.     

模糊综合评判法在斜纹夜蛾预测预报上的应用

通过分析多年斜纹夜蛾灯下虫量、田间虫量以及气象资料,采用模糊综合评判的原理和方法,组建了斜纹夜蛾发生量模糊综合评判模型。应用该模型对2006年和2007年斜纹夜蛾田间发生量进行预测,预测结果与田间发生实况基本相符。     

中国人均生态足迹与生物承载力变化的EMD分析及情景预测

利用经验模态分解(EMD)方法分解并提取1961～2001年中国人均生态足迹与生物承载力变化的波动周期,建立具有周期性波动的非线性动力学预测模型,提出未来50a中国人均生态足迹和生物承载力变化的3种预测情景。结果表明:(1)40a来,中国人均生态足迹在波动中不断增加,具有明显的3.5a和8a两个波动周期;中国人均生物承载力在波动中不断减少,具有明显的2.7a和28a两个周期。(2)若一切照旧,即未来50a中国人均生态足迹与生物承载力保持过去40a的年均变化率不变,则人均生态足迹会持续上升,2050年达到3.391g.hm2;人均生物承载力持续下降,2050年降为0.490g.hm2;而人均生态赤字急剧拉大,2050年为3.024g.hm2,可持续发展形势非常严峻。(3)若缓慢变化,即未来20a中国人均生态足迹保持年均增长率1.195%、人均生物承载力年均减少率0.614%不变,则2025年人均生态足迹为1.849g.hm2、人均生物承载力为0.860g.hm2、人均赤字0.989g.hm2。(4)若人均生态足迹快速减少,即2025～2050年中国人均生态足迹年均减少率为0.996%、人均生物承载力年均减少率为0.614%不变,则2050年人均生态足迹为1.381g.hm2、人均生物承载力0.739g.hm2、人均生态赤字0.641g.hm2,但这需要中国经济发展和技术水平的极大提高、能源消费结构的多元化、居民消费意识和消费模式的快速转变、人民生活质量的极大改善。这样,中国的生态发展才有助于实现全球水平的生态可持续发展,在促进世界可持续发展的道路上起到积极的推动作用。